DEPARTAMENTO DE GEOLOGÍA, GEOGRAFÍA Y MEDIO AMBIENTE ESTIMATION OF GAP FRACTION AND CLUMPING INDEX WITH TERRESTRIAL AND AIRBORNE LASER SCANNER DATA Tesis Doctoral presentada por: JOHN GAJARDO VALENZUELA Bajo la dirección de: Dr. David Riaño Arribas Dr. Mariano García Alonso Dr. Javier Salas Rey Madrid, España Marzo de 2014 "hay que olvidar a los viejos, renegar de los enfermos, odiar al diferente, expulsar al extranjero, barrer a los mendigos, eliminar a los parados, aborrecer al débil...obedecer al dinero". Evaristo Páramos John Gajardo V. is grateful to BECAS CHILE from the Chilean Government for funding this work. Agradecimientos En primer lugar quiero dar los agradecimientos a mis directores. Su apoyo y aporte en los ámbitos profesionales y personales ha sido esencial para la finalización de esta empresa. Gracias infinitas por vuestra paciencia y por mantener viva en mí la ilusión de la ciencia. David, no encuentro palabras conocidas para agradecer por todos tus esfuerzos y momentos dedicados. Gracias a Pilar Martin y a su equipo de investigación en el CSIC por acogerme y darme la oportunidad de aprender y participar de sus investigaciones. Son un grupo humano y profesional increíble. A la gente del CSTARS, especialmente a Susan Ustin por brindarme la ocasión de ser partícipe de sus actividades y ampararme en mi estancia. A la Facultad de Ciencias Forestales de la Universidad de Talca por la oportunidad de perfeccionamiento otorgada. En segundo lugar a todas las personas que he conocido y han compartido conmigo en estos años de aprendizaje, especialmente a los ciudadanos permanentes e itinerantes del sótano y torreón de la UAH. Agradezco también a mis compañeros de pisos por su compañía, comprensión y apoyo, RL10 y MOFO, ustedes siempre me hicieron sentir en familia. Gracias también a ‘my editor for life’ Marilú Carter, tu ayuda y compañía al otro lado del río grande fue muy importante. Al final de este orden, pero siempre en primer lugar de mi corazón, gracias a mi familia. Madre, Hermana y especialmente a mi Padre por haber tenido confianza en mí. Gracias por todo lo que ustedes me han brindado. CONTENTS RESUMEN .......................................................................................................................... 1 ABSTRACT ......................................................................................................................... 3 STRUCTURE OF THE PHD DISSERTATION .......................................................................... 5 1 INTRODUCTION ........................................................................................................ 6 1.1 Characterization of the vegetation canopy structure ....................................... 6 1.2 Measurement of vegetation canopy structural variables ................................. 8 1.3 Estimation of vegetation canopy structure using Terrestrial (TLS) and Airborne (ALS) Laser Scanners ................................................................................................... 14 1.4 Hypothesis and objectives ............................................................................... 18 1.4.1 Hypothesis ................................................................................................ 18 1.4.2 Objectives ................................................................................................. 18 2 METHODS ............................................................................................................... 20 2.1 Description of the study sites .......................................................................... 20 2.1.1 Majadas del Tiétar .................................................................................... 20 2.1.2 Jasper Ridge .............................................................................................. 21 2.2 Vegetation canopy GF from TLS....................................................................... 23 2.2.1 Data collection .......................................................................................... 23 2.2.2 The angular resolution algorithm ............................................................. 25 2.2.3 Computing angular GF images ................................................................. 27 2.2.4 Validation of the angular resolution algorithm and GF images ............... 28 2.2.5 Estimation of GF on real TLS data............................................................. 31 2.3 Vegetation canopy CI from TLS data ................................................................ 33 2.3.1 Chen & Cihlar’s clumping index (CI) ......................................................... 33 2.4 Vegetation canopy GF from ALS ...................................................................... 35 2.4.1 Description of the HP equipment, data collection and pre-processing ... 35 2.4.2 Description of the ALS sensor, data collection and pre-processing ......... 38 2.4.3 Calculation of GF from HP ........................................................................ 44 2.4.4 Calculation of ALS metrics to estimate GF ............................................... 46 2.4.5 Computing the GF models from ALS metrics ........................................... 49 2.5 Vegetation canopy CI from ALS ....................................................................... 49 2.5.1 Calculation of CI from HP.......................................................................... 49 2.5.2 Estimation of CI from ALS metrics and ground laser returns ALS images (GRI) 50 2.5.3 Pielou’s coefficient of segregation (PCS) .................................................. 51 3 RESULTS AND DISCUSSIONS ................................................................................... 54 3.1 Vegetation canopy GF from TLS....................................................................... 54 3.2 Vegetation canopy CI from TLS ........................................................................ 66 3.3 Vegetation canopy GF from ALS ...................................................................... 71 3.4 Vegetation canopy CI from ALS ....................................................................... 78 4 CONCLUSIONS ........................................................................................................ 85 4.1 Vegetation canopy GF from TLS....................................................................... 85 4.2 Vegetation canopy CI from TLS ........................................................................ 86 4.3 Vegetation canopy GF from ALS ...................................................................... 87 4.4 Vegetation canopy CI from ALS ....................................................................... 87 5 REFERENCES ............................................................................................................ 89 6 LIST OF FIGURES ................................................................................................... 101 7 LIST OF TABLES ..................................................................................................... 104
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