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A dense linkage map of the silkworm ( Bombyx mori )based on AFLP markers PDF

2008·0.77 MB·
by  LieZhang
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昆 虫 学 报 !"#$%&#’(’)’*+"$,+&+"$,!"#$%&’’(,)(* +):&,-.&)/ 0112’,),3-&4- %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 家蚕高密度 连锁图谱的构建 !"#$ 张 烈*,&,钱 敏&,代方银&,赵爱春&,鲁 成&,! (*M西华师范大学生命科学学院,珍稀动植物研究所,四川南充 -+/’’4; &M西南大学生物技术学院,农业部蚕学重点实验室,重庆 ,’’/*-) 摘要:为了进行家蚕 -’(./0(’1+数量性状的NOP定位研究,以白色茧系品种5*’(’ ")和近交系大造(Q)’)(#)杂 交得到R*,用R(*#)与双隐性标记的5*’(’ ")回交,得到回交一代(65*),用改进的7RPQ分子标记方法,经4-组选 择性扩增引物扩增,获得分离比为*S(* 2$’M’))的*/,,个7RPQ位点。用!"H!"=">?# NOTU*(4 V?#G:B=’M&4)连锁 图谱构建软件,构建了具有(*,个标记,+-个连锁群的家蚕高密度7RPQ分子标记连锁图谱。该连锁图谱覆盖的家 蚕基因组长度为*+’’) $!,连锁群长度变化范围为*’4M’W*)/+M/ $!,连锁群的平均长度为+-*M&) $!,其标记间 平均图距*)M4( $!,最小图距&M+$!,最大图距,/M/$!,标记间大于+’$!的>"H共有+4个。该连锁图平均每个连 锁群&+个标记,最多一个连锁群有4&个标记,最少(个标记。该连锁图谱确定了与经典实验遗传图谱第*)连锁 群和X染色体连锁群相对应的两个连锁群。 关键词:家蚕;分子标记;7RPQ;连锁图谱 中图分类号:N4-- 文献标识码:7 文章编号:’,),3-&4(- &’’()’+3’&,-3*& ! %&’(& )*’+,-& .,/ 01 23& (*)+405.( !"#$%& #"’()6,(&% 0’ !"#$ .,5+&5( YZ72[ P:?*,&,N072 !:=*,\70 R"=>3]:=*,YZ7^ 7:35%D=*,P_ 5%?=>(* *M 0=GE:EDE? BF K"#? 7=:9";G "=I Q;"=EG,5B;;?>? BF P:F? 1$:?=$?G,5%:=" X?GE 2B#9"; _=:L?#G:EA,2"=$%B=>,1:$%D"=-+/’’4,5%:=";&M ‘?A 1?#:$D;ED#"; P"UB#"EB#A BF 7>#:$D;ED#"; !:=:GE#A,\?H"#E9?=E BF 1?#:$D;ED#? "=I 6:BE?$%=B;B>A,1BDE%J?GE _=:L?#G:EA,5%B=>a:=> ,’’/*-,5%:=") !6(25,72:RB# GEDIA:=>NOPBFG:;bJB#9aD"=E:E"E:L? E#":EG,E%?U"$b$#BGG%AU#:IJ"GBUE":=?IJ:E% F?9";?BF" $B99?#$:"; #"$? 5 $#BGG:=> J:E% 9";? BF E%? F:#GE F:;:"; %AU#:I BF 5 "=I \"<"BC 6"G?I B= :9H#BL?I 7RPQ *’’ *’’ 9?E%BI,* /,, 7RPQ9"#b?#G := ">#??9?=E J:E%*S* G?>#?>"E:B= #"E:B(2$’M’))J?#? BUE":=?I ?9H;BA:=>4- H":#G H#:9?#G,"=I " I?=G? ;:=b">? 9"H $B9HBG:=> BF+- ;:=b">? >#BDHG BF(*, ;B$: J"G $B=GE#D$E?I ?9H;BA:=> E%? !"H !"=">?# NOTU*4(V?#G:B= ’M&4)GBFEJ"#?C O%? EBE"; ;?=>E% BF E%? >#BDHG J"G *+ ’’) $! "=I E%? I:GE"=$?G U?EJ??= ;B$: J?#?&M+ EB,/M/ $!C O%? "L?#">? ;?=>E% BF E%? >#BDHGJ"G+-*M&) $!"=I E%? "L?#">? ;?=>E% U?EJ??= ;B$: J"G *)M4( $!,"=I B=;A +4 >"HG J%BG? I:GE"=$? U?EJ??= ;B$: J"G 9B#? E%"= +’ $! J?#? := E%? $B=GE#D$E?I 9"HC O%? =D9U?# BF ;B$: := E%? $B=GE#D$E?I 9"H #"=>?I F#B9( EB4& "=I E%? "L?#">? ;B$: BF E%? >#BDHG J"G &+C OJB >#BDHG BF E%? $B=GE#D$E?I 9"H $B##?GHB=I J:E% E%? *)E% "=I X $%#B9BGB9? BF E#"I:E:B="; ;:=b">? 9"HC 8&9 405%(:-’(./0 (’1+;9B;?$D;"# 9"#b?#;7RPQ;;:=b">? 9"H 遗传连锁图谱的构建是遗传学和育种研究的重 图谱由于标记数量的有限,不能满足构建高密度遗 要内容之一,构建高密度的遗传连锁图谱有助于加 传连锁图谱的需要。&’世纪(’年代诞生的分子标 快动、植物育种工作进程,特别是有助于动、植物数 记技术,使构建高密度的分子标记遗传连锁图谱成 量性状的改良研究。仅用形态标记构建的遗传连锁 为可能,因此,利用各种分子标记技术构建分子标记 基金项目:“4/+”计划项目(&’’)56*&*’’’);四川省教育厅项目(&’’)7*’));西华师范大学科研启动基金项目(’)6’,’) 作者简介:张烈,男,*4-,年生,四川巴中人,博士,研究方向为家蚕分子遗传与育种研究,839":;:<%"=>;:?’*@A"%BBC$B9C$= !通讯作者 7DE%B#FB#$B##?GHB=I?=$?,839":;:;D$%?=>@GJDC?IDC$= 收稿日期 K?$?:L?I:&’’/3’)3*);接受日期 7$$?HE?I:&’’(3’*3&( P期 张 烈等:家蚕高密度@AB0连锁图谱的构建 5/? 遗传连锁图谱是遗传学和育种研究的重要途径之 蚕的GHB定位研究。继!"#$%&’()后,构建了家蚕的 一。在一些动、植物如家蚕 !"#$%& #"’(( !"#$%&’() DAB0(,)’ )* +,3,-..4)、D@0E(01"&2""+ )* +,3,-..4; *+$ ,)’,-../;01"&2""+ )* +,3,-..4;李斌等,5666; 李斌等,5666)、,,D(:’*" )* +,3,5664)和 @AB0(朱玉 万春玲等,566-;赵爱春等,566/)、波尔山羊(李祥 芳等,566-;H*+ )* +,3,566-;赵爱春等,566/)标记 龙等,566/)、中国明对虾 -)..)’"/).+)01 23(.).1((1 王 连锁图谱。这些家蚕分子连锁图谱的构建,为进一 伟继等,5667)、玉米 4)+ #+%1(89+("#’#* )* +,3, 步开展家蚕高密度分子连锁图谱的构建和利用研究 -..-;郝转芳等,5664)、水稻 5’%6+ 1+*(7+(:*;<’## )* 奠定了基础。这些已构建的各种家蚕分子标记遗传 +,3,-..7;熊立仲等,-..=)、大豆 8,%2(.) #+&(>9’& 图谱仅仅是一个框架图谱,都具有标记数较少,覆盖 )* +,3,-..?)、马铃薯 9",+.0# *0$)’"10#(纪颖彪和屈 家蚕基因组较小等特点,因此这些图谱还不能满足 冬玉,-..?)构建了标记密度不等的各种分子标记的 家蚕分子辅助育种研究的要求。本研究采用实用品 连锁图谱。这些分子标记连锁图谱的构建为基因的 种I (白色茧)与广泛用于家蚕分子标记构图研究 -66 定位、克隆以及数量性状的遗传研究奠定了基础,对 的基础品种大造(绿色茧)为材料进行杂交、回交,应 其进一步的研究和利用有利于提高动、植物育种工 用改进的 @AB0 分子标记方法以及 :*J :*+*K91 作效率和加快育种工作的进展。 GHL2-(. C91%’"+635.)(:*+#M )* +,3,566-)软件进行 @AB0分子标记技术是由 C"%等(-..4)在 DAB0 连锁分析,构建家蚕高密度 @AB0 分子标记遗传连 技术和D@0E技术的基础上发展起来的一种高效分 锁图谱,为进一步进行家蚕数量性状的 GHB分析和 子标记。@AB0 分子标记技术既具有 D@0E 分子标 分子标记辅助家蚕育种研究奠定基础。 记技术的方便性又具有 DAB0分子标记技术的稳定 与可靠性(王斌和翁曼丽,-..7),特别是在对生物遗 ! 材料和方法 传背景不甚了解的情况下,利用 @AB0 分子标记技 术对基因组各部分可能存在的 EF@序列变异进行 !"! 材料 扫描,从而发现不同个体间的多态性。@AB0分子标 作图群体:采用生态型差异较大的高交代实用 记技术克服了 D@0E 分子标记技术的不稳定性和 白色茧系品种 I (!)和西南大学家蚕基因库培育 -66 DAB0分子标记技术受探针来源的限制,因此,@AB0 的近交系大造(046)( )杂交得到 A ,用 A( )与 " - - " 分子标记可用于生物遗传研究分析的许多方面,如 双隐性标记的 I (!)回交,得到回交代(8I )。按 -66 - 遗传连锁图谱的构建,目的基因的定位、品种鉴别、 家蚕常规饲育方法在 54N左右,给予良桑饲养,待 分类和系统发育研究等多个方面。 结茧化蛹后,随机取回交代(8I )的//个个体,其中 - 家蚕 !3 #"’( 是重要的经济昆虫,作为生产已 绿色茧 55 个(雌、雄各 -- 个),白色茧 55 个(雌、雄 有五千多年的历史,作为遗传学研究材料,家蚕具有 各--个)以及回交代的亲本同胞后代各 -6 个用于 其他动物所不可替代的易于繁殖、饲养,繁殖后代数 基因组EF@提取。 量较多等优点。对家蚕的遗传学及其应用研究也积 !"# 主要试剂和酶 累了较为丰富的经验,并保存了大量的品种资源,利 :1*!和 ;+<!限制性内切酶,H EF@ 连接酶, / 用部分品种资源已构建了含有//6多个形态标记的 $FH0%,尿素,HO:OE,G/-P5 测序银染试剂盒,由 家蚕遗传连锁图谱(代方银等,5664)。形态标记的 01"&9K* 公司生产;H*Q EF@ 聚合酶,甲叉双丙烯酰 数量有限及其多态性不丰富,对进一步开展由多基 胺,丙烯酰胺,由上海生物工程有限公司(,9K"+)分 因控制的数量性状遗传以及基因的定位等研究显得 装;结合硅烷、剥离硅烷等。 十分乏力,因此利用分子标记技术构建家蚕分子标 人工接头和引物:人工接头包括两部分,一部 记遗传连锁图谱显得十分重要。如果构建了家蚕高 分为核心序列(IRDO),另一部分为酶特定序列 密度的分子标记遗传连锁图谱就可以进一步开展家 (OFS),能与用 :1*!、;+<!酶解的基因组 EF@ 片 蚕分子辅助育种研究。!"#$%&’()(-..-)首先提出了 段粘端互补。人工接头由上海生物工程有限公司 国际家蚕分子育种计划,构建了仅76个 DAB0标记 (,9K"+)合成。其结构如下: 的家蚕分子标记连锁图谱框架,并倡导进行有关家 1R= 昆虫学报 *+#%,)#-.-/-0(+%1()(+% ’.卷 !"#$ $%& !"#$ $%& ’()*+!*,*+!**!!*,! +,*!+ )-( ’()*+!*+,*+*,!!,*+ *)-( -()*!+!,*!!**!+* ,)’( -(),+!,!+**+!, !*! )’( !"#!人工接头 $%&!人工接头 根据人工接头序列设计相应的选择性引物。引 ($%&)和选择性碱基($%,)。 物由-部分组成:核心序列(!"#$)、酶特定序列 !"#$ $%& $%, !"#!预扩增引物:’()*+!**!!*,! +,*!+* +)-( $%&!预扩增引物:’()*+,*+*,!!,*+ *!*+ +)-( !"# $%&’模板制备、酶切片段扩增和凝胶分析 每次降低23QU共.-个循环;<RU变性-2 ;,’GU退 取蛹体的 ./-0./1(大小约重 23’ 4)提取基因 火-2 ;,Q1U延伸. :7L,1-个循环;Q1U延伸Q :7L。 组5%+。基因组 5%+ 模板的制备参照 678879:; 等 用.31W琼脂糖凝胶检测选择性扩增结果。预、选 (.<<2)和夏庆友等(.<<=)的方法。基因组 5%+ 的 择性扩增均在 ,DKDA:J8TLD +:C87BAJL !型 5%+合成 完整性经琼脂糖凝胶电泳检测(图 .),并用 >?") 仪上进行。选择性扩增产物先用琼脂糖凝胶电泳检 #+5 @:9AB ;CDE,F -222分光光度计测定其浓度,然后 测,防止扩增漏样,再用GW变性聚丙烯酰胺凝胶对 用 ,$ 稀释,保证基因组 5%+ 的纯度(+ /+ )在 选择性扩增产物进行分离。分离加样前先加入G V 1G2 1=2 $ .3=左右。 反应终止液,经<-U变性- :7L后,立即将其放入冰 水中,待分离电泳液温度达到’2U时快速将分离样 品加入到加样孔,分离电泳中电泳液温度保持恒温 ’2U。选择性扩增产物分离后,用银染法(参照 XAJ:D49 !9BI YR.-1 银染试剂盒使用说明书)显色检 测变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结果。 图. 家蚕基因组5%+电泳图 H74I . $8DEBAJCKJAD;7;C9BBDALJM;78NOJA:4DLJ:7E5%+ F:5%+分子量标准"/’()P#:9ANDA;.0=分别为样品(Q *A!)、 (< *A!)、.(’ *A")、.(G *A")、1(G 6")、1Q(6")、RG(6!)和RQ (6 )的基因组 5%+ ,KD 89LD; . BJ = ;KJODP 4DLJ:7E 5%+ JM ! ;78NOJA:(Q *A!),(< *A!),.’(*A"),.G(*A"),1G(6"),1Q (6"),R(G 6!)9LPR(Q 6!),AD;CDEB7SD8TI 图1 家蚕基因组5%+预扩增 取完整基因组5%+ .22 L4加入’单位 !"#!限 H74I 1 $8DEBAJCKJAD;7;C9BBDALJMCAD9:C87M7E9B7JL 制性内切酶-QU温育1 K,再加入’单位 $%&!限制 JM;78NOJA:4DLJ:7E5%+ 性内切酶 G’U温育 1 K对基因组进行酶切,将其酶 .:没有预扩增引物5D8DB7JLJMCAD9:C87M7E9B7JLCA7:DA;;1:没有模板 切产物在Q’U下保持.’ :7L,使内切酶灭活后,酶切 的预扩增结果5D8DB7JLJMBD:C89BD5%+;-:5%+分子量标准5%+ 产物储于RU备用。取 ’ V酶切消化产物用 ,R 连 V9PPDA:9ANDA;R0.Q:部分预扩增结果XAD9:C87M7E9B7JL;JM;78NOJA: $ 7LP7S7PZ98;,AD;CDEB7SD8TI 接酶将双链接头连接到经酶切后的 5%+片段上,再 用具有一个选择性碱基的引物对连接产物进行预扩 !"( 数据统计分析 增。预扩增程序为:<RU变性- :7L;循环为<RU变 !"("! +HVX标记数据的统计与分析:+HVX分子标 性-2 ;,’GU退火 . :7L,Q1U延伸 . :7L,12 循环; 记数据获得方法参照 &9[D9Z和 \J(; .<<1)建立的方 Q1U延伸Q :7L。用.31W琼脂糖凝胶检测预扩增结 法,并参考#+X5标记数据分析方法(VZEK,.<<2;常 果(图1)。以此预扩增产物稀释 ./=2 后为模板,再 青和周开亚,.<<=)将一个 +HVX分子标记视为等位 用带-个选择性碱基的引物组进行选择性扩增。选 基因进行多态性分析。每一对引物分别对所有个体 择性扩增程序为:第一次循环为 <RU变性 -2 ;, 基因组的扩增,特定位置扩增出带的作为 . 个分子 G’U退火-2 ;,Q1U延伸.:7L,随后的循环退火温度 标记,并代表.对等位位点,扩增出带的个体为杂合 @期 张 烈等:家蚕高密度"),-连锁图谱的构建 .CE 型记为“!”,未扩增出带的个体为纯合型记为“"”, ) 代分离比应为*+*,对个体间的"),-标记分离进 * 对于部分模糊不清等原因造成判读较难的带型用 行 . 检验,在/0显著水平下,将符合 *+* 分离比 ! “#”代替,以此作为数据记录的标准,将全部带型数 的标记用于遗传连锁图谱的构建。 据录入$%&’(表中。根据孟德尔遗传分离规律回交 表! 选择性扩增引物序列 "#$%&! ’&()*+#,-%./.(#0.)*-1.,&12&34&*(&2 !"#!引物序列 9:;含量(0) $%&!引物序列 9:;含量(0) -123’14!"#! 5’67’8&’ 9:;&<8=’8= -123’14$%&! 5’67’8&’ 9:;&<8=’8= -*:/>49";99;;9?;"?9;"9""?4@> //AB ?*:/>49"?9"9?;;?9"9;9"""?4@> CDAC -.:/>49";99;;9?;"?9;"9""94@> B*A* ?.:/>49"?9"9?;;?9"9;9""";4@> /.AB -@:/>49";99;;9?;"?9;"9"";4@> B*A* ?@:/>49"?9"9?;;?9"9;9"";"4@> /.AB -C:/>49";99;;9?;"?9;"9"?"4@> //AB ?C:/>49"?9"9?;;?9"9;9"""94@> /.AB -/:/>49";99;;9?;"?9;"9"?;4@> B*A* ?/:/>49"?9"9?;;?9"9;9""9"4@> /.AB -B:/>49";99;;9?;"?9;"9"?94@> B*A* ?B:/>49"?9"9?;;?9"9;9""9;4@> /DAE -D:/>49";99;;9?;"?9;"9"9"4@> B@A. ?D:/>49"?9"9?;;?9"9;9""9?4@> /.AB -F:/>49";99;;9?;"?9;"9";94@> BFAC ?F:/>49"?9"9?;;?9"9;9""?"4@> CDAC -E:/>49";99;;9?;"?9;"9"9;4@> BFAC ?E:/>49"?9"9?;;?9"9;9""?;4@> /.AB -*G:/>49";99;;9?;"?9;"9";"4@> B@A. ?*G:/>49"?9"9?;;?9"9;9"";?4@> /.AB -**:/>49";99;;9?;"?9;"9";?4@> B@A. ?**:/>49"?9"9?;;?9"9;9"";94@> /DAE -*.:/>49";99;;9?;"?9;"9"9?4@> B@A. ?*.:/>49"?9"9?;;?9"9;9""?94@> /.AB 根据形态标记将家蚕雌性个体(家蚕的雌性基 ,28OLH’ 91<7M5等命令进行连锁图谱构建。 因型为杂合型 UV)赋予杂合型有带“!”标记,则雄 性个体(家蚕的雄性基因型为纯合型 VV)赋予纯合 7 结果与分析 型无带“"”标记;根据茧色形态标记将绿色茧(9 & 基因对白色茧为显性,应包含纯合子 9 W9 和杂合 75! 扩增结果 & & 子9 W: 两种基因型)赋予有带型“!”标记,则白色 75!5! 引物的扩增效果:从 *. 个 !"#!和 *. 个 & 茧(只包含隐性纯合子基因型:W:)赋予无带型“"” $%&!组合的*CC对双引物中筛选了EB对扩增效果 较好的引物组合进行选择性扩增,经EB组选择性双 标记。 引物对所有个体进行选择性扩增,扩增效果见图 @ !5657 连锁图谱的构建:对符合*+*遗传分离比的 和图C,共获得了F /..个扩增位点。每组引物平均 "),-标记采用RLM RL8LH’1 X?YZ*E([’152<8GA.E)软 扩增位点FE个,最多 *B* 个,最少 @* 个;不同组双 件(RL8(\ ’# %(I,.GG*)进行连锁分析。连锁分析参 引物间的扩增位点数量相差较大,引物组以-C组合 数设置如下:!]GAGG*,使用其遗传连锁分析方式, 的扩增带较多,平均扩增带*GB个,-*.组合扩增带 选择 ^L&O&1<55 遗传模式,作图函数为 R<1HL8,RLO’ 图@ 部分选择性扩增结果 )2HI @ J’&<8KL3M(2N2&L=2<8<N52(OP<1328K2Q2K7L(5 R:ST"分子量标准ST",LKK’13L1O’1I #%= 昆虫学报 !"#$%&#’(’)’*+"$,+&+"$ %<卷 图! "#$%选择性扩增产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳图 &’() ! *+,-./0120/,3’314..,/5063,-057481+’6’-4.’0506"#$% 1/’8,/057,54.9/’5(10+:4-/:+48’7,(,+ ;:<==>1?@A分子量标准<==>1?@AB477,/84/C,/;<:绿茧亲本大造!样品;4+,06?4D40;#:白茧亲本E<=="样品&,84+,06E<==; F:&<!样品;4+,06&<;!G<!:HE<绿茧!;4+,’57’I’794+306(/,,5-0-005HE<;<%G#%:HE<绿茧" &,84+,’57’I’794+306(/,,5-0-005 HE<;#JGFJ:HE<白茧"&,84+,’57’I’794+306K2’.,-0-005HE<;FLG!L:HE<白茧!的个体样品;4+,’57’I’794+306K2’.,-0-005HE<) 较少,平均J<个。 该连锁图中平均每个连锁群#F个标记,最大连锁群 !"#"! 扩增位点的多态性:在扩增位点中,非分离 P#个标记,最少 M 个标记;该连锁图谱总图距 <F 位点即所有个体都能扩增出的同一位点 F F<M 个, ==% -;,平均图距 <%OPM -;,两标记间图距最小 #OF 分离位点即部分个体能够扩增出的位点 % #=! 个, -;,最大 !LOL -;,两标记间图距大于 F= -; 的 (41 占总扩增出位点的 J<N,其多态性与 $45 等(#==<) 共有FP个(图%)。与已构建的其他家蚕 A&B"框架 报道的J=OLN相一致。 图相比(万春玲等,#==<;朱玉芳等,#==<),该连锁图 对分离位点在 P%N置信度下经 # 检验符合 谱具有标记数较多、平均图距较小等特点,便于进一 ! <Q<分离比位点< L!!个,偏分离位点F !J=个,占分 步进行 S$B 定位以及目标基因的定位克隆研究。 离位点JJO%N,这与万春玲等(#==<)用 A&B" 标记 拟定的绿茧标记 B"$XU/与 B"L$LX<F和 B"<<$%X<位 得到的 < <LL 个扩增带,偏分离位点 J!OFN,以及 点紧密相连,其图距分别为 JOM -;和 <%OP -;。该 R00//’13等(<PPL)用A&B"标记的偏分离位点J!OFN 连锁群对应于经典实验遗传连锁图的第<%连锁群。 相近。偏分离位点的发生在分子标记中是普遍存在 的,其发生原因可能有:一是生物配子的生活力和 $ 讨论 竞争力的遗传因素、染色体的转位;二是作图群体 数量大小、酶切基因组 ?@A不彻底、基因组 ?@A本 $"# 家蚕%&’(分子标记遗传连锁图谱比较 身存在大量的断裂片段等原因造成的带型缺失或模 遗传连锁图谱的构建是为了基因的定位克隆及 糊不清。 S$B定位研究,因此连锁图谱上的标记是越多越好, !"! 连锁图谱构建 标记间的图距是越小越好。本研究所构建的家蚕 用 ;41 ;454(,/ S$T><P(R,/3’05=O#P)连锁图谱 A&B"分子标记遗传连锁图谱与其他已构建的家蚕 构建软件中”;4C, B’5C4(, U/0913”命令,在 "V=O==< A&B"标记遗传连锁图谱相比较(表#),具有标记数 条件下将 < L!! 个 A&B"分子标记分离位点和 < 个 较多、标记间图距较小、覆盖家蚕基因组较大等特 绿茧标记U-位点以及雌性决定作用 W染色体标记 点,因此有利于进一步进行家蚕基因的定位克隆以 位点,共 < L!J 个位点分为 <FF 个连锁群,其中 F#L 及家蚕数量性状的 S$B 定位研究。已构建的所有 个分离位点未进入连锁群。连锁位点率 M<OFN,高 家蚕A&B"分子标记遗传连锁图谱中即使有的图谱 于其他的J!O!FN(朱玉芳等,#==<)。用标记数不少 构建的连锁群比家蚕的 #P 个(#L 个常染色体,< 个 于<=个的连锁群,以及仅有 M 个标记的 W染色体 W染色体和<个Y染色体)实验遗传连锁群多,但都 连锁群,共计 M<! 个标记,构建了 FJ 个连锁群的家 未能够完全与家蚕的#P个实验遗传连锁群相对应, 蚕A&B"分子标记连锁图谱,作图位点率 !JOJN。 用于家蚕全基因组以及其数量性状遗传研究,还有 ;期 张 烈等:家蚕高密度"#$%连锁图谱的构建 :!9 图! 家蚕"#$%分子标记连锁图谱 #&’( ! $&)*+’,-+./012,3&4*5/6-7+3,8/)"#$% ;!; 昆虫学报 !"#$%&#’(’)’*+"$,+&+"$ !<卷 图! 家蚕"#$%分子标记连锁图谱(续) #&’( ! $&)*+’,-+./012,3&4*5/6-7+3,8/)"#$%(9/)1&):,8) ;期 张 烈等:家蚕高密度"#$%连锁图谱的构建 <!; 图! 家蚕"#$%分子标记连锁图谱(续) #&’( ! $&)*+’,-+./012,3&4*5/6-7+3,8/)"#$%(9/)1&):,8) <!; 昆虫学报 !"#$%&#’(’)’*+"$,+&+"$ !=卷 图! 家蚕"#$%分子标记遗传连锁图谱(续) #&’( ! $&)*+’,-+./012,3&4*5/6-7+3,8/)"#$%(9/)1&):,8) %期 张 烈等:家蚕高密度!"#$连锁图谱的构建 G@@ 待于进一步完善。本研究构建的家蚕 !"#$分子标 蚕!"#$连锁图谱,逐渐完善 !"#$分子标记图谱与 记连锁图谱包含%&个连锁群,可进一步开展基因的 实验遗传图谱的对应,以便应用于指导家蚕育种 定位克隆和 ’(# 定位研究。结合其他已构建的家 研究。 表! 家蚕"#$%分子标记连锁图谱的比较 &’()*! +,-.’/01,2,3"#$%-,)*45)’/)026’7*-’.10210)68,/- 个体数 总图距 标记数 连锁群 平均图距 大于%>点数 大于@>位点数 最大图距 研究者 作图群体 5678,329 (2.1; 71< 5678,3 5678,3- !+,310,71< 5678,32901<- 5678,32901<- (?,;130,-. )*+,-./01.23 4,*,31./2* /*:/+/:61;- :/-.1*=, 29;2=/ 290326< :/-.1*=, 723,.?1*%> 723,.?1*@> 71<:/-.1*=, 万春玲 A!5 B# CBD EF %GH@I@ D@J G& GFID@ @%KG @%KG @GIH 朱玉芳 LMNO" CBD EF GJJHIJ D&% GH GGIGD G%KG G%KG @EIJ 谭远德 (!5 OP CBD EF &@DG %@& %> GDI>F @&K> @&K> EFI@ 赵爱春 LM!Q!B CBD EE %&F&IF G@& %% DEI%& GGKE GGKE DDJIJ 本研究 (?/--.6:R CBD EE D%>>@ HDE %& D@IJH %JK> %JK> EFIF 已有研究表明家蚕的 A染色体具有强雌性决 小也是影响构图效果的重要因素之一,关于构建分 定作用,但其作用机制尚不清楚。该 !"#$ 分子标 子连锁图谱的最小有效群体,尚无统一标准。已经 记遗传连锁图谱,结合形态标记除确定了与家蚕经 构建的 !"#$ 分子标记连锁图谱中,也有采用小样 典实验遗传连锁图谱的第D@连锁群的对应关系外, 本作图群体的报道,如 U,/7等(DJJF)曾采用 EG 个 还确定了家蚕的雌性决定A染色体连锁群,A雌性 个体的作图群体构建了大豆的高密度 !"#$连锁图 决定连锁标记#$ ( SA与 #$DD(&S%和 #$D(DGS%F位 谱。因此,根据实验条件本研究采用了EE个个体作 > > 点紧密相连,其图距分别为 GI% =T和 DGIG =T。在 为构图群体。作图群体对构图效果的影响是群体越 此之前尚无有关A染色体连锁群标记的报道,A染 大,可检测的最大图距越大,可分辨的最小图距就越 色体连锁群的标记将有助于家蚕性别调控机制研 小。对于EE个个体的回交群体,可以检测的最大图 究。同时该 !"#$ 分子标记遗传连锁图谱显示,A 距约%% =T,可以分辨的最小图距约J =T(徐云碧和 染色体连锁群上 !"#$ 分子标记数较少,仅有 H 个 朱立煌,DJJE)。以此构图标准判断,本研究所构建 标记,明显较其他染色体上的 !"#$标记位点数少, 的家蚕高密度!"#$分子标记图谱较其他已构建的 这一结果有利于进一步对A染色体连锁群的研究。 家蚕!"#$ 分子标记图谱更好,更具有实用性。与 9:; 作图材料 VVW、W!$P分子标记构图相比较,用 !"#$分子标记 构图材料的选择是影响构图效果的重要因素之 构建的家蚕遗传连锁图谱比 VVW、W!$P分子标记构 一,构图材料的亲本间差异越大,分子标记的多态性 建的家蚕遗传连锁图谱在标记间的平均图距上更 就越丰富。因此本研究采用形态特征和生态型差异 大,这一方面可能与不同分子标记类型有关,不同分 较大的两个亲本杂交及其回交一代为作图群体,用 子标记类型在染色体上的分布密度不同;二是可能 这样的亲本杂交可获得更多的多态性标记,构建高 与作图群体大小有关,如 VVW分子标记图谱的构建 密度的分子标记连锁图谱,每组引物平均获得多态 用DHJ 个个体,其平均图距 &I&% =T(T/12 !" #$X, 性标记@E个。其二是现有的连锁遗传图谱构建软 G>>@);W!$P分子标记图谱的构建用 D&& 个个体, 件均未考虑配子形成中不发生交换对使用 " 群体 其平均图距%I@EYEI>G =T(O1-6Z2=?/,DJJH)。 G 作图所产生的影响(谭远德等,G>>>),因此,本研究 参 考 文 献(<*3*/*24*1) 采用回交一代为构图群体可以避免由于家蚕雌完全 C,*.2;/;1V,46/..2* B,C26+,. 5,V1/;;1*: !,5RZ1[, V,"3,R--/*,. 4, 连锁所带来的"G 群体作图所不能检测其亲本中互 DJJDX ):,*./9/=1./2*291*W"#$713Z,3-./0?.;R;/*Z,:.2.?,M.;0,*,/* 斥相位点连锁关系的缺陷。 71/[,X %&!’()!*!"X,HG:%J%\%JHX 在分子标记遗传图谱的构建中,作图群体的大 B?1*0 ’,L?26 UO,DJJHX $?R;20,*R 3,=2*-.36=./2* /* .?, -.6:R 29

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