UNIVERSIDADE DE LISBOA FACULDADE DE FARMÁCIA ABORDAGEM GENÉTICA DA DOENÇA DE ALZHEIMER FAMILIAR: DO DIAGNÓSTICO AO TRATAMENTO Leticia de Bastos Relatório de estágio orientado pela Professora Doutora Isabel Antolin Rivera e pelo Dr. Carlos José Faria Diogo Cortes, e coorientado pela Dra. Joana Selada Domingues. MESTRADO EM ANÁLISES CLÍNICAS 2018 UNIVERSIDADE DE LISBOA FACULDADE DE FARMÁCIA ABORDAGEM GENÉTICA DA DOENÇA DE ALZHEIMER FAMILIAR: DO DIAGNÓSTICO AO TRATAMENTO Leticia de Bastos Relatório de estágio orientado pela Professora Doutora Isabel Antolin Rivera e pelo Dr. Carlos José Faria Diogo Cortes, e coorientado pela Dra. Joana Selada Domingues. MESTRADO EM ANÁLISES CLÍNICAS 2018 IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio Prefácio O presente trabalho é parte integrante do plano de estudos do Curso de Mestrado em Análises Clínicas pela Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa. Este documento é composto por duas partes fundamentais, que visam alcançar objetivos distintos, mas interligados. A primeira é composta pelo relatório de estágio, onde é apresentado todo o trabalho desenvolvido e os conhecimentos adquiridos, de uma forma sintetizada, nas áreas da Bioquímica, Hematologia e Microbiologia. O estágio de Bioquímica decorreu no Serviço de Patologia Clínca do Hospital de Cascais e o estágio das valências de Hematologia e Microbiologia foram realizadas no Serviço de Patologia Clínca do Hospital Nossa Senhora da Graça, em Tomar, tendo tido deste modo o privilégio de conhecer a dinâmica de dois Serviços distintos. A segunda parte é composta pela dissertação, que foi desenvolvida na área da genética, com o tema: “Abordagem genética da doença de alzheimer familiar: do diagnóstico ao tratamento.” A escolha do tema deveu-se ao interesse em aprofundar os conhecimentos relativamente à doença de Alzheimer, aliada à importância da genética no possível diagnóstico e tratamento precoce. Leticia de Bastos 3 IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio Resumo O presente trabalho é parte integrante do plano de estudos do Mestrado em Análises Clínicas da Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa e constitui um dos principais elementos da avaliação final. Este documento encontra-se dividido em duas partes fundamentais. A primeira parte consiste no relatório de estágio e a segunda é constituída pela dissertação. No relatório de estágio é apresentado o local onde decorreram os estágios e as atividades desenvolvidas em cada valência, focando os aspetos mais relevantes no que diz respeito à experiência desenvolvida e ao enquadramento dos conhecimentos adquiridos no contexto real de trabalho num Laboratório e da sua aplicação à Clínica. O estágio foi realizado em Laborotórios de Serviços de Patologia Clínica de dois hospitais. No Hospital Dr. José de Almeida, em Cascais, decorreu o estágio de Bioquímica, no período compreendido entre os dias 9 de janeiro e 10 de março de 2017. No Hospital da Nossa Senhora da Graça, em Tomar, foram realizadas as valências de Hematologia e Microbiologia, entre os dias 3 de abril e 4 de agosto de 2017. Na dissertação, é apresentada uma revisão da literatura na qual é desenvolvido o tema: "Abordagem genética da doença de Alzheimer Familiar: do diagnóstico ao tratamento". A doença de Alzheimer (DA) de início precoce é a forma rara da doença (5-10% dos casos diagnosticados), apresentando um padrão de hereditariedade autossómico dominante e tendo essencialmente origem em mutações nos genes que codificam as presenilinas (PSEN1 e PSEN2) e a proteína precursora amilóide (APP), que levam ao aumento do péptido Aβ42 e, consequentemente, à perda de função e morte neuronal. Atualmente, o diagnóstico definitivo desta patologia é obtido a partir da autópsia dos tecidos cerebrais, pois os procedimentos de diagnóstico tradicionais da DA assentam essencialmente na exclusão de outras causas de demência. Contudo, diversas pesquisas estão centradas na possibilidade do diagnóstico precoce recorrendo a biomarcadores específicos, que capturam tanto a extensão da patologia quanto os seus efeitos sobre a função cerebral, passando de uma abordagem de diagnóstico de exclusão para um diagnóstico positivo. Os biomarcadores 4 Leticia de Bastos IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio encontram-se divididos em duas grandes categorias permitindo uma observação sequencial de eventos relacionados com os processos fisiopatológicos da doença, sendo fundamentais para uma possível caracterização da situação clínica do doente. Relativamente ao tratamento, este é baseado essencialmente na sintomatologia, sendo usados inibidores da acetilcolinesterase e antagonistas do recetor do N-Metil-D-Aspartato. No entanto, diversos tratamentos baseados na etiologia encontram-se já em estudo e englobam, não só a imunoterapia Aβ, mas também inibidores das secretases, da agregação do péptido Aβ, e da fosforilação e agregação da proteína tau. No futuro, os micro-RNAs (miRNAs), elementos reguladores da expressão de genes, constituem biomarcadores promissores para o diagnóstico precoce e as tecnologias baseadas em RNA de interferência poderão abrir novos caminhos para o tratamento da DA. Palavras-chave: DA, APP, presenilinas, péptido Aβ, biomarcadores. Leticia de Bastos 5 IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio Abstract The present work is an integral part of the study plan of the Masters in Laboratorial Medicine of the Faculty of Pharmacy of the University of Lisbon and is one of the main elements of the final evaluation. This document is divided into two fundamental parts. The first part consists of the internship report and the second part consists of the monograph. The internship report presents the place where the internships and activities developed in each valency took place, introducing the most relevant aspects regarding the experience developed and the framework of the knowledge acquired in the real context of work in a Laboratory and its application to the Clinic. The internship was carried out in Clinical Pathology Laboratories of two hospitals. At the Dr. José de Almeida Hospital in Cascais, the biochemistry course was held from January 9 to March 10, 2017. At the Nossa Senhora da Graça Hospital in Tomar, the Hematology and Microbiology, areas took place between April 3 and August 4, 2017. In the monograph, a review of the literature in which the theme "Genetic Approach of Familial Alzheimer's Disease: from Diagnosis to Treatment" is presented. Early-onset Alzheimer's disease (AD) is the rare form of the disease (5-10% of diagnosed cases), presenting an autosomal dominant inheritance pattern and essentially originating from mutations in genes encoding presenilins (PSEN1 and PSEN2) and amyloid precursor protein (APP), which lead to the increase of the Aβ42 peptide and, consequently, loss of neuronal function and death. Currently, the definitive diagnosis of this pathology is obtained from the autopsy of brain tissues, since the traditional diagnostic procedures of AD are essentially based on the exclusion of other causes of dementia. However, several studies are focused on the possibility of early diagnosis using specific biomarkers, which capture both the extent of the disease and its effects on brain function, moving from an exclusion diagnosis approach to a positive diagnosis. Biomarkers are divided into two broad categories allowing a sequential observation of events related to the pathophysiological process of the disease and are fundamental for a possible characterization of the clinical situation of the patient. 6 Leticia de Bastos IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio Regarding treatment, this is based essentially on symptomatology, using acetylcholinesterase inhibitors and N-methyl-D-Aspartate receptor antagonists. However, several treatments based on the etiology are already under study and encompass not only Aβ immunotherapy, but also inhibitors of secretases, aggregation of Aβ peptide, and phosphorylation and aggregation of tau protein. In the future, micro-RNAs (miRNAs), regulators of gene expression, are promising biomarkers for early diagnosis and interference-based RNA technologies may open new avenues for AD treatment. Key words: DA, APP, presenilins, Aβ peptide, biomarkers. Leticia de Bastos 7 IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio Agradecimentos É com satisfação que expresso o meu agradecimento a todos os que contribuíram para que chegasse até aqui. Aos meus pais, Glória e Fernando, pois sem eles nada disto seria possível. Obrigada por tudo, pelos valores transmitidos, pelo amor e apoio incondicional que me têm dado ao longo da vida. À minha irmã por acreditar em mim e ter estado sempre presente quando lhe pedi ajuda. Ao Patrick por todo o amor e paciência que tem demonstrado ao longo desta caminhada. Aos colegas de mestrado, pelos momentos que passamos juntos, pela amizade, troca de experiências e sabedoria. Aos Professores do Mestrado em Análises clínicas, pela aprendizagem que proporcionaram, em especial à Doutora Isabel Bettencourt, pela força que me deu quando a minha vontade era desistir, à Doutora Isabel Rivera, pela orientação na dissertação e à Doutora Cristina Marques, por todo o apoio no processo transição de local de trabalho/estágio. Às minhas colegas de trabalho que fizeram com que a conciliação entre a minha vida profissional e académica se tornasse mais fácil. A todos, os meus sinceros agradecimentos. 8 Leticia de Bastos IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio Índice Geral Relatório Índice………………………………………………………………………………………….14 Índice de Figuras ……………………………………………………………………………...19 Índice de Tabelas...………………………………………………………………...…………21 Siglas e Abreviaturas …………………………………………………………………………23 1. Introdução ……………………………………………………………………………….27 1.1. Objetivo ……………………………………………………………………………..27 2. Caracterização dos Serviços de Patologia Clínica ……………………………………….28 2.1. Serviço de Patologia Clínica do Hospital Dr. José de Almeida …………………….28 2.2. Serviço de Patologia Clínica do Hospital Nossa Senhora da Graça ………………..30 3. Higiene e Segurança no Laboratório …………………………………………………….33 4. Fluxograma Geral ………………………………………………………………………..37 5. Amostras Inadequadas para Análise …………………………………………………….39 6. Controlo de Qualidade …………………………………………………………………..40 6.1. Controlo de Qualidade Interno ……………………………………………………..40 6.2. Avaliação Externa da Qualidade ……………………………………………………42 7. Valência de Bioquímica ………………………………………………………………….43 7.1. Bioquímica Clínica …………………………………………………………………43 7.2. Interferência da Hemólise, Icterícia e Lipémia nos Métodos Analíticos …………...90 7.3. Análise da Urina Tipo II ……………………………………………………………91 7.4. Avaliação da Urina a Tempo Determinado ……………………………………….103 8. Valência de Hematologia ………………………………………………………………105 8.1. Hemogramas……………………………………………………………………….105 8.2. Hemoglobina Glicada ……………………………………………………………..124 8.3. Eletroforese das Hemoglobinas ……………………………………………………126 Leticia de Bastos 9 IX Mestrado em Análises Clínicas Relatório de Estágio 8.4. Hemostase …………………………………………………………………………128 9. Valência de Microbiologia ……………………………………………………………..139 9.1. Marcha Laboratorial em Microbiologia …………………………………………...139 9.2. Exame Microscópico ………………………………………………………………141 9.3. Exame Cultural ……………………………………………………………………146 9.4. Testes de Identificação Presuntiva ………………………………………………...154 9.5. Teste de Identificação da Escherichia coli O157:H7 ……………………………..157 9.6. Teste para identificação de Streptococcus pneumoniae …………………………...158 9.7. Identificação de Microrganismos e Teste de Suscetibilidade aos Antimicrobianos 159 9.8. Teste Screening para Streptococcus do Grupo A ………………………………….162 9.9. Teste Screening para Streptococcus pneumoniae …………………………………162 9.10. Teste Screening para Legionella pneumophila ………………………………….163 9.11. Teste Screening para Clostridium difficile ……………………………………...164 9.12. Teste Screening para Campylobacter spp.…..…………………………………..166 9.13. Pesquisa de Vírus………………………………………………………………..167 9.14. Pesquisa de Micobactérias ………………………………………………………170 9.15. PCR em Tempo Real ……………………………………………………………175 9.16. Colheita de Produtos Biológicos e Processamento de Amostras ……………….176 9.17. Fluxograma para Identificação de Bactérias Gram Negativos ………………….202 9.18. Fluxograma para Identificação de Bactérias Gram Positivos …………………..204 9.19. Fluxograma para Identificação de Leveduras …………………………………..205 9.20. Fluxograma para Identificação de Fungos Filamentosos ……………………….206 9.21. Pesquisa de Sangue Oculto nas Fezes …………………………………………..206 10. Fase Pós-Analítica……………………………………………………………………208 11. Conclusão …………………………………………………………………………….209 12. Referências Bibliográficas …………………………………………………………...210 10 Leticia de Bastos
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