UNIVERSIDAD NACIONAL DE LA PLATA FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BIOLÓGICAS Trabajo de Tesis Doctoral TOPOLOGÍA MOLECULAR APLICADA A LA BÚSQUEDA DE NUEVOS FÁRMACOS PARA EL TRATAMIENTO DE LA EPILEPSIA REFRACTARIA Farm. Mauricio Emiliano Di Ianni Director: Dr. Luis Enrique Bruno Blanch / Co- Director: Dr. Alan Talevi 2015 2 3 4 AGRADECIMIENTOS Luis Bruno Blanch – Alan Talevi – Facultad de Ciencias Exactas – UNLP – CONICET – ANPCyT – Carolina Bellera – Lucas Alberca – Melisa Gantner – Andrea Enrique – María Luisa Villalba – Luciana Gavernet – Pablo Palestro – Laureano Sabatier – Julián Prieto – María Esperanza Ruiz – Sofía Goicoechea – Roque Dietrich – María Laura Sbaraglini – Francisco Morales – Sebastián Scioli – Alexandra Elbakyan – INAME – LASSE – Manuel Couyoupetrou – Ruben Greco – Sung Ching Moon – CINVESTAV– Padres –Hermanos – Amigos de hoy y de ayer – Gisela Díaz. 5 6 ÍNDICE Breve planteo del problema Pág. 11 Capítulo I. Hitos en la Historia de la Epilepsia Pág. 17 Contexto Histórico (Pág. 19) – Salud Pública y Capital Social de la Epilepsia (Pág. 26) Capítulo II. Epilepsia Pág. 29 Epilepsia: la enfermedad (Pág. 31) – Prevalencia de la Enfermedad (Pág. 33) – Clasificación de las epilepsias (Pág. 33) – Causas de la Epilepsia (Pág. 35) – Tratamiento de la Epilepsia (Pág. 37) – Epilepsia y Mortalidad (Pág. 41) Capítulo III. Epilepsia Refractaria Pág. 49 Definición de la ILAE e Impacto de la Epilepsia Refractaria (Pág. 51) – Mecanismos de Resistencia a Fármacos (Pág. 53) – La Hipótesis del Transportador (Pág. 54) – Glicoproteína-P (Pág. 53) – Base Molecular de la Poliespecificidad (Pág. 57) – Poliespecificidad de Sustrato (Pág. 60) – Inhibidores del trasporte mediado por P-gp (Pág. 60) – ¿Cómo abordar clínicamente el problema de la farmacorresistencia mediada por P-gp? (Pág. 61) – Regulación de la expresión de la P-gp (Pág. 62) Capítulo IV. Fármacos Antiepilépticos Pág. 75 Diversidad y Clasificación (Pág. 79) – Neurobiología y actividad antiepiléptica de los FAEs (Pág. 81) – El trasporte de FAEs por la P-gp (Pág. 88) – Perspectiva sobre el desarrollo de nuevos fármacos anticonvulsivos (Pág. 91) – Desarrollo de nuevos FAEs con menos efectos adversos (Pág. 93) – Nuevos horizontes en el campo de la investigación y desarrollo de nuevos FAEs (Pág. 95) Capítulo V. Química Medicinal Pág. 111 Lineamientos del enfoque / Argumentos (Pág. 114) – Cribado Virtual (Pág. 116) – Técnicas de Cribado Virtual (Pág. 119) – Desarrollo de nuevos fármacos para el tratamiento de la epilepsia refractaria (Pág. 130) Capítulo VI. Metodología Pág. 143 Generación de modelos QSAR (Pág. 145) – Selección de la actividad biológica a modelar. Construcción de la base de datos de sustratos y no-sustratos de P-gp (Pág. 7 147) –Tamaño y partición de la base de datos (Pág. 148) – Digitalización de estructuras químicas. Cálculo y manejo de descriptores moleculares (Pág. 150) – Generación / entrenamiento de los modelos (Pág. 153) – Validación de las Funciones Discriminantes (Pág. 157) – Criterios de selección de las mejores FDs (Pág. 158) – Valor de Corte. Combinación de modelos / Fusión de Datos (Pág. 160) – Cribado Virtual (Pág. 163) – Ámbito de aplicabilidad (Pág. 164) – Evaluación Biológica (Pág. 164) – Determinación de la actividad antiepiléptica de los candidatos seleccionados en modelos animales (Pág. 165) – Potencial de las sustancias seleccionadas para tratar epilepsias farmacorresistentes (Pág. 168) – Ensayo de trasporte bidireccional en mono-capa de células MDCK II - MDR I (Pág. 168) – Ensayo de las drogas en un modelo de convulsiones farmacorresistentes inducidas por ácido 3- mercaptopropiónico (3-MP) (Pág. 170) Capítulo VII. Resultados y Discusión Pág. 179 Construcción de la base de datos de sustratos y no-sustratos de P-gp (Pág. 181) – Generación y validación de los modelos (Pág. 182) – Valor de Corte. Combinación de modelos / Fusión de Datos (Pág. 188) – Cribado virtual (Pág. 196) – Evaluación Biológica. Determinación de la actividad antiepiléptica de los candidatos seleccionados en modelos animales (Pág. 199) – Potencial de las sustancias seleccionadas para tratar epilepsias fármacorresistentes. Ensayo de trasporte bidireccional en mono-capa de células MDCK II - MDR I (Pág. 201) Capítulo VIII. Conclusiones Pág. 209 Anexo Pág. 213 8 9 10
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