ÉCOLE NATIONALE VETERINAIRE D’ALFORT Année 2006 CONTRIBUTION A L’ETUDE DE LA PREVALENCE DE L’INFECTION A ANAPLASMA PHAGOCYTOPHILUM DANS LA FAUNE SAUVAGE EN FRANCE THESE Pour le DOCTORAT VETERINAIRE Présentée et soutenue publiquement devant LA FACULTE DE MEDECINE DE CRETEIL Le 30 novembre 2006 par Alex, Marie Edith CHIMIER Né le 13 août 1981 à Chartres (Eure-et-Loir) JURY Président : M. Professeur à la Faculté de Médecine de CRETEIL Membres Directeur : Henri-Jean BOULOUIS Professeur à l’ENVA Assesseur : Renaud MAILLARD Maître de conférences à l’ENVA Remerciements AAAA MMMMoooonnnnssssiiiieeeeuuuurrrr lllleeee pppprrrrooooffffeeeesssssssseeeeuuuurrrr Professeur à la faculté de médecine de Créteil Qui m’a fait l’honneur d’accepter la présidence de mon jury de thèse Hommage respectueux AAAA MMMMoooonnnnssssiiiieeeeuuuurrrr lllleeee pppprrrrooooffffeeeesssssssseeeeuuuurrrr HHHHeeeennnnrrrriiii----JJJJeeeeaaaannnn BBBBOOOOUUUULLLLOOOOUUUUIIIISSSS Mon directeur de thèse Pour ses conseils avisés lors de la réalisation de ce travail et son humour sans égal lors de ses cours Sincère reconnaissance AAAA MMMMoooonnnnssssiiiieeeeuuuurrrr lllleeee DDDDoooocccctttteeeeuuuurrrr RRRReeeennnnaaaauuuudddd MMMMAAAAIIIILLLLLLLLAAAARRRRDDDD Pour avoir accepté de participer à mon jury de thèse et pour la qualité de son enseignement clinique sur les animaux de rente Profonde gratitude AAAA MMMMoooonnnnssssiiiieeeeuuuurrrr lllleeee DDDDoooocccctttteeeeuuuurrrr GGGGuuuuyyyy JJJJOOOONNNNCCCCOOOOUUUURRRR Sans toi, je n’aurais jamais choisi ce sujet pour ma thèse. A l’irréductible Loup blanc que tu es. Profond respect et amitiés AAAA llllaaaa SSSSNNNNGGGGTTTTVVVV,,,, llllaaaa FFFFDDDDCCCC eeeetttt lllleeeessss llllaaaabbbboooorrrraaaattttooooiiiirrrreeeessss mmmmééééccccèèèènnnneeeessss L’argent étant toujours le nerf de la guerre, Sans votre soutien cette étude expérimentale n’aurait vu le jour Remerciements sincères AAAA ttttoooouuuussss lllleeeessss eeeennnnsssseeeeiiiiggggnnnnaaaannnnttttssss ddddeeee llll’’’’EEEEccccoooolllleeee dddd’’’’AAAAllllffffoooorrrrtttt.... AAAA ttttoooouuuussss lllleeeessss eeeennnnsssseeeeiiiiggggnnnnaaaannnnttttssss qqqquuuueeee jjjj’’’’aaaaiiii eeeeuuuussss ddddaaaannnnssss mmmmaaaa vvvviiiieeee (y compris mes professeurs de musique Mme Billard, M. Mounier…) Parce que vous faites un travail extraordinaire auprès de vos élèves, dans des conditions qui ne sont pas toujours idéales. Parce que vous jouez un rôle fondamental dans notre société. Profond respect et profonde reconnaissance. Remerciements AAAA………… -TTTTooooiiii,,,, SSSSeeeeiiiiggggnnnneeeeuuuurrrr, sans qui je ne serais pas. Tu es toujours là quand il faut. -TTTTooooiiii,,,, MMMMéééémmmméééé, pour tes qualités exceptionnelles de grand-mère. -VVVVoooouuuussss ddddeeeeuuuuxxxx,,,, MMMMaaaammmmaaaannnn eeeetttt PPPPaaaappppaaaa, à qui je dois d’être devenu ce que je suis. Vous m’avez supporté malgré mes exigences. Vous avez su m’élever dans l’Amour, la simplicité, la joie de vivre et le respect. Vous m’avez appris à savourer les petits bonheurs, à savoir être heureux. Je vous en suis éternellement reconnaissant. Merci aussi Papa d’être venu m’aider pour « la chasse à la souris ». - VVVVoooouuuussss,,,, JJJJeeeeaaaannnn----CCCChhhhaaaarrrrlllleeeessss eeeetttt EEEElllliiiieeee,,,, mes deux grands frères préférés, mes complices. Vous m’avez accompagné dans mes bêtises comme dans mes exploits. Vous m’avez aussi enseigné l’art de la discussion, l’écoute et la tolérance dans notre vie de couple (Vive la colocation !) TTTTooooiiii,,,, VVVViiiirrrrggggiiiinnnniiiieeee, qui est venu compléter le trio avec brio ! -VVVVoooouuuussss,,,, JJJJeeeennnnnnnniiiiffffeeeerrrr eeeetttt SSSSuuuullllyyyyvvvvaaaannnn, que je considère un peu comme mes frère et sœur, même si le destin en a décidé autrement. Vous m’avez appris à développer mon sens de la communication et de l’éducation. -TTTToooouuuutttteeee mmmmaaaa ffffaaaammmmiiiilllllllleeee : tantes, oncles, cousines, cousin,… Vous avez toujours illustré qu’une famille unie ça existe malgré les difficultés, même si elle est nombreuse et qu’on ne se voit pas tous aussi souvent qu’on le souhaiterait. -TTTTooooiiii,,,, TTTTaaaannnntttteeee GGGGuuuuiiiitttteeee, en particulier, qui sais toujours être présente et bienveillante. -TTTTooooiiii,,,, mmmmoooonnnn cccchhhheeeerrrr eeeetttt iiiinnnntttteeeerrrrnnnnaaaattttiiiioooonnnnaaaallll HHHHeeeerrrrbbbbeeeerrrrtttt. Viel Glück Maestro et attention avec les jolies mademoiselles… -VVVVoooouuuussss,,,, qqqquuuuiiii mmmm’’’’aaaavvvveeeezzzz gggguuuuiiiiddddéééé oooouuuu ttttoooouuuutttt ssssiiiimmmmpppplllleeeemmmmeeeennnntttt aaaaccccccccoooommmmppppaaaaggggnnnnéééé sur mon petit bonhomme de chemin : Denise, toute la famille de Courcel, Clémence, Olivier et Grégoire, Laurent, Lionel et Mariannick, et tout le groupe Tibériade, Jean-Marie et les musiciens de Beauce (spéciale dédicace pour les Maisons, Solène,…). Votre attention et votre jovialité m’ont définitivement touché. -VVVVoooouuuussss,,,, ttttoooouuuussss mmmmeeeessss aaaammmmiiiissss. Ceux de mmmmoooonnnn ggggrrrroooouuuuppppeeee ddddeeee cccclllliiiinnnniiiiqqqquuuueeee (j’ai nommé : Aude, Aurélie, Béatrice, Claire, Camille, Dorothée, Eléonor, Marie-Aude, Sabine, Stéphanie, Vanessa et Bogdan.). AAAA llllaaaa ccccoooommmmmmmmuuuunnnnaaaauuuuttttéééé cccchhhhrrrrééééttttiiiieeeennnnnnnneeee dddd’’’’AAAAllllffffoooorrrrtttt et ses membres invétérés ( Marie-Bé, Marie-Aude, Una, Johanna, Lucile, Mica, Camille, Jean, Kartooch, et notre hyper-méga-giga-Ancien Vincent) A mon Ancienne Hélène, ma co-poulotte Séverine, nos parents de clinique Claire et Nico, Gishlaine, Jean Michel, Antoine, Mattieu et Marie-Astrid, Christophe et Danielle, Mélo, Hélène, Laura, Ben, Gaëlle, Stéphane, Amélie, Guillaume, Crô, Marianne, Marie, Laeti, François, Alexis, les 2 Claire,... AAAA ttttoooouuuutttteeee mmmmaaaa pppprrrroooommmmoooo. Pour ces merveilleuses années passées en votre compagnie à Alfort. ----VVVVoooouuuussss,,,, mmmmeeeessss aaaammmmiiiissss JJJJMMMMJJJJiiiisssstttteeeessss eeeetttt GGGGaaaalllliiiillllllllééééeeeennnnssss (Elsa, Camille, Christian, Florence, Guillaume, Hermione, Jean, Joan et Sophie, Lourdes, Marianne, Patrick, Patricia, Tiana, Sandrine et Roll, Fabienne, Gérald, Ellen). Vous êtes une bouffée d’oxygène. J’ai passé avec vous des moments extraordinaires, qui resteront gravés dans mon cœur. ----VVVVoooouuuussss,,,, ttttoooouuuussss lllleeeessss mmmmeeeemmmmbbbbrrrreeeessss ddddeeee CCCChhhhaaaarrrrttttrrrreeeessss HHHHaaaannnnddddiiiissssppppoooorrrrtttt eeeetttt LLLLooooiiiissssiiiirrrrssss.... Vous rendez la vie plus humaine. -VVVVoooouuuussss, le personnel du Zoodyssée et vous Philippe Nicollet et Cyril Maingourd du LDV 79, pour votre accueil chaleureux et votre aide. -VVVVoooouuuussss,,,, ttttoooouuuussss lllleeeessss vvvvééééttttéééérrrriiiinnnnaaaaiiiirrrreeeessss eeeetttt éééélllleeeevvvveeeeuuuurrrrssss que j’ai rencontrés. Vous m’avez conforté dans mon choix professionnel et ma vision du métier. -VVVVoooouuuussss,,,, eeeennnnffffiiiinnnn,,,, ttttoooouuuutttteeeessss lllleeeessss bbbbêêêêtttteeeessss. De Saturnin le canneton à la vache Anémone en passant par Gros Pépère le lapin. De la perruche callopsitte Kiki à la chienne Roxane en passant par le chat Filou. Vous qui avez suscité ma vocation et sans qui, l’Art Vétérinaire ne serait rien. A tous ceux que j’ai assistés à la naissance, que j’ai soignés, que j’ai opérés et même que j’ai euthanasiés. A mes futurs patients et à leurs maîtres. -TTTTooooiiii,,,, celle que je ne connais pas, mais qui j’en suis sûr me comblera… AAAA vvvvoooouuuussss ttttoooouuuussss,,,, jjjjeeee ddddééééddddiiiieeee cccceeeetttttttteeee tttthhhhèèèèsssseeee.... MMMMiiiilllllllleeee mmmmeeeerrrrcccciiiissss dddd’’’’êêêêttttrrrreeee.... JJJJeeee vvvvoooouuuussss aaaaiiiimmmmeeee.... Table des matières Introduction..............................................................................................................................5 I. Une bactérie nommée Anaplasma phagocytophilum..........................................................7 1. Une appellation qui a varié au fil du temps....................................................................7 2. Les caractéristiques de la bactérie..................................................................................9 3. La transmission de l’agent pathogène..........................................................................11 4. L’étiopathogénie de l’infection....................................................................................17 5. Les espèces infectées....................................................................................................19 II. Présence de la bactérie chez le chevreuil.........................................................................23 1. Méthodes de détection de la bactérie et/ou de son passage..........................................25 2. Données bibliographiques............................................................................................28 3. Etude nationale SNGTV/FNC 2005-2006...................................................................33 4. Discussion....................................................................................................................42 III. Prévalence de l’infection chez les micromammifères...................................................45 1. Données bibliographiques............................................................................................46 2. Investigations en milieu clos : étude au Zoodyssée de Chizé......................................48 3. Discussion....................................................................................................................53 Conclusion...............................................................................................................................57 Bibliographie...........................................................................................................................61 Annexes...................................................................................................................................67 1 2
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