T´ecnicas de filtrado bayesiano aplicadas al modelado ambiental cuantitativo en Acu´stica y Ecolog´ıa Laura Mart´ın Fern´andez Departamento de F´ısica Aplicada Universidad de Granada Tesis doctoral presentada dentro del Programa Oficial de Posgrado en F´ısica para optar al grado de Doctor por la Universidad de Granada Septiembre 2012 Editor: Editorial de la Universidad de Granada Autor: (cid:47)(cid:68)(cid:88)(cid:85)(cid:68)(cid:3)(cid:48)(cid:68)(cid:85)(cid:87)(cid:116)(cid:81)(cid:3)(cid:41)(cid:72)(cid:85)(cid:81)(cid:105)(cid:81)(cid:71)(cid:72)(cid:93) D.L.: (cid:42)(cid:53)(cid:3)(cid:27)(cid:24)(cid:28)(cid:16)(cid:21)(cid:19)(cid:20)(cid:22) ISBN: (cid:28)(cid:26)(cid:27)(cid:16)(cid:27)(cid:23)(cid:16)(cid:28)(cid:19)(cid:21)(cid:27)(cid:16)(cid:23)(cid:24)(cid:25)(cid:16)(cid:27) ii Declaracio´n La doctoranda Dn˜a. Laura Mart´ın Fern´andez y los directores de la tesis Dr. Diego Pablo Ruiz Padillo, Profesor Titular del Departamento de F´ısica Aplicada de la Universidad de Granada, y Dr. Joaqu´ın M´ıguez Arenas, Profesor Titular del Departamento de Teor´ıa de la Sen˜al y Comunicaciones de la Universidad Carlos III de Madrid, al firmar esta tesis doctoral GARANTIZAN: Que la memoria titulada “T´ecnicas de filtrado bayesiano aplicadas al mode- ladoambientalcuantitativoenAcu´sticayEcolog´ıa”hasidorealizadaporla doctoranda bajo la direcci´on de los directores de la tesis en el departamento de F´ısica Aplicada de la Universidad de Granada para optar al grado de DoctorporlaUniversidaddeGranada,yenlarealizaci´ondeltrabajo,hasta donde nuestro conocimiento alcanza, se han respetado los derechos de otros autores a ser citados cuando se han utilizado sus resultados o publicaciones. Granada, 10 de Septiembre de 2012 Fdo.Diego Pablo Ruiz Padillo Fdo. Joaqu´ın M´ıguez Arenas Fdo.: Laura Mart´ın Fern´andez Resumen Enestetrabajoseexplorant´ecnicasdeaproximaci´onnum´ericapararesolver tres problemas importantes en ciencias ambientales. En primer lugar, se abordandosproblemaspresentesenlasaglomeracionesurbanas,enelmarco de la acu´stica. Por un lado, se propone un m´etodo de aproximaci´on del m´aximo a posteriori (MAP) para comparar modelos de espacio de estados no lineales que describen el problema de la predicci´on de los niveles de ruido ambiental. Este m´etodo se basa en el filtrado de part´ıculas y adem´as usa una t´ecnica de Monte Carlo con cadenas de Markov para mejorar la etapa de remuestreo. Por otro lado, se presenta una metodolog´ıa basada en filtrado de Kalman extendido que aborda el problema de la estimaci´on de los caudales de tr´afico urbano, diferenciando entre los tres principales tipos de veh´ıculos rodados, a partir de observaciones de ruido ambiental. Finalmente, en el marco de la ecolog´ıa, se estudia un sistema depredador- presa estoc´astico con una respuesta funcional del tipo Lotka-Volterra y se propone un filtro de part´ıculas para estimar el par´ametro desconocido de comportamientoquerepresentalatasadebu´squedaefectivapordepredador enlarespuestafuncionalypredecirlabiomasadelaspoblacionesutilizando datos sint´eticos y datos de campo. Esta t´ecnica combina un esquema de muestreo secuencial de Monte Carlo para el seguimiento de las biomasas, conlaintegraci´onanal´ıticadelpar´ametrodesconocido.Conelfindeevaluar elcomportamientodelostresm´etodosmencionados,losresultadoshansido validados con datos experimentales. Este trabajo ha sido financiado por el proyecto de la Consejer´ıa de Innovaci´on, Ciencia y Empresa de la Junta de Andaluc´ıa de Espan˜a con ref. TIC-03269. Abstract Inthiswork,numericalapproximationtechniquesareexploredtosolvethree important problems in environmental sciences. Firstly, two problems of ur- ban agglomerations, in the acoustics framework, are addressed. On the one hand, a maximum a posteriori (MAP) method to compare nonlinear state- space models that describe the problem of predicting environmental sound levels is put forth. The numerical implementation of this method is based on particle filtering and we use a Markov chain Monte Carlo technique to improve the resampling step. On the other hand, a methodology that deals with the problem of predicting urban traffic flows, differentiating between the three main road vehicle types, from environmental noise observations is put forth. Inference is numerically carried out using an extended Kalman filter. Finally, in the ecology framework, we consider a stochastic predator- prey system with a Lotka-Volterra functional response and propose a par- ticle filtering method for estimating the behavioral parameter representing the rate of effective search per predator in the functional response and forecast the population biomass using both synthetic and field data. The proposed technique combines a sequential Monte Carlo sampling scheme for tracking the time-varying biomasses with the analytical integration of the unknown behavioral parameter. In order to assess the performance of the three methods, the results have been compared to experimental data. This work has been supported by the “Consejer´ıa de Innovaci´on, Ciencia y Empresa de la Junta de Andaluc´ıa” of Spain under project TIC-03269. A mi familia “La naturaleza est´a repleta de razonamientos que no tuvo nunca la experiencia”. Leonardo da Vinci. ´ Indice general Lista de figuras xi Lista de tablas xiii Lista de acr´onimos xv I INTRODUCCIO´N 1 1 Introducci´on 3 1.1 M´etodos ambientales cuantitativos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 1.2 Problemas en acu´stica ambiental . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 1.3 Sistemas predador-presa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 1.4 Objetivos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 1.5 Aportaciones del trabajo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 1.6 Marco del proyecto de tesis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 1.7 Organizaci´on de los cap´ıtulos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 2 Filtrado en sistemas din´amicos 13 2.1 Modelos de espacio de estados . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 2.2 Inferencia bayesiana . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 2.3 Aproximaci´on num´erica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 2.4 Notaci´on . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 3 Descripci´on del paisaje sonoro urbano 29 3.1 Introducci´on. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 3.2 Descriptores del nivel de presi´on sonora . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33 vii ´INDICE GENERAL 3.3 Descriptores de la composici´on temporal del nivel de presi´on sonora . . 35 3.4 Composici´on espectral del nivel de presi´on sonora . . . . . . . . . . . . . 36 3.5 Descriptores psicoacu´sticos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 4 Modelos matem´aticos en ecolog´ıa 39 4.1 Introducci´on. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39 4.2 Modelo exponencial del crecimiento de las poblaciones . . . . . . . . . . 41 4.3 Modelo log´ıstico del crecimiento de las poblaciones . . . . . . . . . . . . 43 4.4 Modelos depredador-presa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46 II APLICACIONES EN ACU´STICA 51 5 Comparison of environmental noise prediction models 53 5.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 5.2 Dynamic models . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 5.3 Criterion for model selection. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62 5.4 Numerical implementation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64 5.5 Experimental results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 5.6 Conclusions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75 6 Urban road traffic flow prediction using sound pressure levels 77 6.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77 6.2 Dynamic model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79 6.3 Numerical implementation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 6.4 Experimental results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 6.5 Conclusions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 III APLICACIONES EN ECOLOG´IA 87 7 Jointparameterestimationandbiomasstrackinginastochasticpredator- prey system 89 7.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 7.2 Dynamic model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93 7.3 Computational inference . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97 viii ´INDICE GENERAL 7.4 Case study . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 7.5 Conclusions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 IV CONCLUSIONES Y PERSPECTIVAS 121 8 Discusi´on 123 8.1 Principales contribuciones . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123 8.2 Trabajo futuro . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125 8.3 Publicaci´on de resultados . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 9 Discussion 131 9.1 Main contributions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 9.2 Future works . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 9.3 Publication of results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134 APE´NDICES 137 A Redes neuronales artificiales: Red backpropagation 139 A.1 Concepto general . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 A.2 Funcionamiento de una red neuronal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 A.3 La neurona artificial . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 A.4 Mecanismos de aprendizaje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 A.5 Ventajas e inconvenientes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145 A.6 Las redes backpropagation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 B Procedimiento y sistema para estimar caudales de tr´afico rodado a partir de los niveles de ruido ambiental (Memoria t´ecnica de la patente) 149 BIBLIOGRAF´IA 179 ix
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