Prof. Dr. Ahmet OKAY ÇAĞLAYAN

24 Pages·2017·0.3 MB·English

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ
ÖZGEÇMİŞ
Adı Soyadı: Ahmet Okay ÇAĞLAYAN
Doğum Tarihi: 10 Aralık 1978
Öğrenim Durumu:
Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl
Y. Lisans Tıp Fakültesi Osmangazi Üniversitesi, Tıp 2001
Fakültesi
Doktora/S.Yeterlik/ Erciyes Üniversitesi, Tıp
Tıbbi Genetik 2007
Tıpta Uzmanlık Fakültesi
Doçentlik Tıbbi Genetik 2012

Tıpta Uzmanlık Tezi Başlığı ve Danışmanı (Özeti ekte): İdiyopatik hirşutizmli vakalarda
CYP19 geni ve SRD5A2 geni polimorfizmlerinin ve bunların lokal olarak androjene duyarlı
dokudaki ekspresyonlarının araştırılması, KAYSERİ-2007. Tez Yöneticisi: Prof Dr. Munis
Dündar
Görevler:
Görev Unvanı Görev Yeri Yıl
Dr. Ar. Gör. Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi 2003-2007
Uz. Dr. Kayseri Eğitim ve Araştırma Hastanesi 2008-2013
Doktora Sonrası Yale Üniversitesi 2010-2011
Araştırmacı Dr.
Öğretim Görevlisi Yale Üniversitesi 2012-2015
Öğretim Üyesi T.C. İstanbul Bilim Üniversitesi 2015-2017

Projelerde Yaptığı Görevler
PROJENİN
PROJEDEKİ PROJE BAŞLAMA-BİTİŞ
PROJE ADI ALINDIĞI
GÖREVİ TARİHİ
MERCİ
İdiopatik Hirşutizmli Vakalarda
CYP19 Geni ve SRD5A2 Geni
Polimorfizmlerinin ve Bunların
Araştırmacı TUBITAK 09-15-2006 / 2009-09-15
Lokal Olarak Androjene Duyarlı
Dokudaki Ekspresyonlarının
Araştırılması
Gene Discovery in Recessive
Structural Brain Disorders
Araştırmacı NIH 2009-09-30 / 2011-08-31
through Whole Exome
Sequencing
1
Yale Center for Mendelian
Araştırmacı NIH 2011-12-05 / 2019-11-30
Genomics
Integrating the genomics of
Autism Spectrum Disorders(ASD)
Araştırmacı NIH 2015-05-08 / 2019-02-28
in consanguineous and
'idiopathic' families
Disease Gene Discovery in
Araştırmacı NIH 2014-04-05 / 2017-03-31
Structural Brain Disorders
Kalıtsal Hipertrofik ve Dilate İstanbul
Kardiyomiyopatilerin Genetik Yürütücü Bilim 2016-07-07 / 2018-07-07
Sebeplerinin Araştırılması Üniversitesi
Otizm Spektrum Bozukluğu
İstanbul
Hastalarında Hedef gen TMLHE Araştırmacı 2017-09-22 / 2018-03-22
Üniversitesi
Ekpresyon Profilinin İncelenmesi
Otizm Spektrum Bozukluğu
Hastalarında Hedef gen İstanbul
Araştırmacı 2017-09-21 / 2018-03-21
MACROD2 Ekpresyon Profilinin Üniversitesi
İncelenmesi
İdari Görevler
Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik AD Başkanlığı
Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ve Genetik AD Başkanlığı
Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ve Genetik AD Başkan Vekilliği
Tıp Fakültesi Fakülte Kurulu Üyesi
Tıp Fakültesi Fakülte Yönetim Kurulu Üyesi
Sağlık Bilimleri Enstitüsü Yönetim Kurulu Üyeliği
Tıp Fakültesi, Ulusal Tıp Eğitimi Akreditasyon Komisyonu Üyesi
Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler:
2016 – 2017 European Society of Human Genetics
2016 – 2017 American Society of Human Genetics
2015 – 2016 American Association for Science and Technology
2008 – European Biotechnology Thematic Network Association
2007 – Türkiye Diabet, Obezite ve Beslenme Derneği
2003 – Tıbbi Genetik Derneği
Editöryal Hizmetler
2016- Halen Editorial Board, Annals of Molecular & Genetic Medicine
2015- Halen Editorial Board, Annals of Neurology & Neurosciences
2014- Halen Editorial Board, Austin Journal of Autism and Related Disorders
2014- Halen Editorial Board, Austin Journal of Clinical Neurology
2012- 2017 Editorial Board, Journal of Genomes and Exomes
2010- Halen Associate Editor, Frontiers in Child and Neurodevelopmental Psychiatry

2
Ödüller
1 Dönem Üçüncülüğü ödülü, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi
2 Klinik Genetik alanında poster birincilik ödülü, 7. Ulusal Prenatal Tanı ve Tıbbi Genetik
Kongresi, 172- Mayıs 2006, Kayseri

2015-2018/Güz/Bahar Dönemi Master Dersi/Tıbbi Biyoloji ve Genetik AD/İnsan Genetiği

Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik A.D.’da Verdiği Dersler

Dönem Saati
Öğrenci
Akademik (Saat/grup)
Dönem Dersin Adı Sayısı
Yıl
(Toplam)
Teorik Uygulama
Genler ve genetik
varyasyon, poligenik ve 2
multifaktöriyel kalıtım.
Genler ve sinyalizasyon,
gelişim genetiği. Cinsiyetin 2
belirlenmesi.
Mitokondrial ve X’e bağlı
2
kalıtım, X inaktivasyonu.
Dönem II
- 12
Mutasyonlar: Somatik ve
2
Germinal
2008-2009 Kromozomlar ve
2
Kromozomal Hastalıklar
Mutagenezis, DNA tamiri,
2
Transposbl elementler
Mutasyonların tanısında
2
moleküler yaklaşımlar
Mendelian kalıtım ve pedigri 2
analizi
Dönem II
(Uygulama) - 12
Mutasyonların tanısı 3

(Multiplex PCR ve RFLP
uygulamaları)

3
Dönem Saati (Saat) Öğrenci
Akademik
Dönem Dersin Adı Sayısı
Yıl
Teorik Uygulama (Toplam)
Tıbbi Genetiğe Giriş 1
Organel Hastalıkları,
Mitokondriyal kalıtım ve 2
Hastalıkları
İnsan Genetik Hastalıklarında
2
Mutasyonlar
Dönem I Kalıtımın Kromozomal
2
Temelleri 81

Kromozomlar ve Kromozomal
2
Hastalıklar
Kalıtım Şekilleri ve Mendelian
Kalıtım 2 -
Non-Mendelian Kalıtım
2015-2018 2
Şekilleri
Moleküler genetikte ve
sitogenetikte kullanılan 2
yöntemler
Popülasyon genetiği,
Kişiselleştirilmiş Tıbba Giriş ve 2
Farmakogenetik
Kanser Genetiği 2
Insanlarda Malformasyonlar 2
Tıbbi Genetik Laboratuvarının 1
Tanıtılması
Dönem I
81
(Uygulama)
Kromozomun Elde Edilmesi ve - 2
Karyotip analizine giris
Pedigri çizimi ve analizi 2

4
Dönem
Saati Öğrenci
Akademik Dönem / Yarı
Dersin Adı (Saat) Sayısı
Yıl Yıl
(Toplam)
Teorik
Kalıtımın Temel Prensipleri ve
2
Kalıtım Çeşitleri
Genetik Hastalıklara Giriş ve Aile
2
Ağacı Analizi
Klinik Genetikte Hastaya Yaklaşım 2
Kromozomal Hastalıklar 2
Mikrodelesyon Sendromları 2
Dönem III / Epigenetik ve İlişkili Hastalıklar 2
Birinci Yarıyıl
İnfertilitede Genetik Yaklaşım 2

Fetal Kayıp / Tekrarlayan Genetik
2
Kayıplarında Genetik Yaklaşım
Prenatal / Preimplantasyon Genetik 2
Tanı
Dismorfik Çocuğa Yaklaşım 2
Zeka Gelişimi Bozukluklarında 2
Genetik Yaklaşım
73
2015-2017
Boy Kısalığında Genetik Yaklaşım 2
Kortikal Gelişimin Genetik 2
Hastalıkları
Nörogenetik Hastalıklar 2
Otizm Spektrum Hastalıklarının 2
Genetiği
Kanser Genetiği ve Kalıtsal Kanser 2
Sendromları
Dönem III /
İşitme Kaybının Genetik Sebepleri 2
İkinci Yarıyıl
Genetik Hastalıkların Tedavisi 2
Genetik Danışma ve Genetik Etik 2
Moleküler ve Sitogenetik Tanısal 2
Metotlar
Yeni Nesil Dizileme Teknolojileri 2
Biyoinformatiğe Giriş 2
Genetik ve Çevrimsel Tıp 2
5
Dönem
Saati Öğrenci
Akademik Dönem /
Dersin Adı (Saat) Sayısı
Yıl Yarı Yıl
(Toplam)
Teorik
Kalıtımın Temel Prensipleri ve Kalıtım
2
Çeşitleri
Genetik Hastalıklara Giriş ve Aile Ağacı
2
Analizi
Klinik Genetikte Hastaya Yaklaşım 2
Kromozomal Hastalıklar 2
Mikrodelesyon Sendromları 2
Dönem III / Epigenetik ve İlişkili Hastalıklar 2
Birinci
Yarıyıl İnfertilitede Genetik Yaklaşım 2

Fetal Kayıp / Tekrarlayan Genetik
2
Kayıplarında Genetik Yaklaşım
Prenatal / Preimplantasyon Genetik Tanı 2
Dismorfik Çocuğa Yaklaşım 2
Zeka Gelişimi Bozukluklarında Genetik 2
Boy Kısalığında Genetik Yaklaşım 2
73
2017-2018
Popülasyon Genetiği 2
Kortikal Gelişimin Genetik Hastalıkları 2
Nörogenetik Hastalıklar 2
Otizm Spektrum Hastalıklarının Genetiği 2
Kanser Genetiği/Kalıtsal Kanser Sendromları 2
Solid / Hematolojik Tümörlerde Genetik 2
Kalıtsal Kardiyomyopatiler 2
Dönem III /
İkinci
İşitme Kaybının Genetik Sebepleri 2
Yarıyıl
Genetik Hastalıkların Tedavisi 2
Genetik Danışma ve Genetik Etik 2
Moleküler ve Sitogenetik Tanısal Metotlar 2
Yeni Nesil Dizileme Teknolojileri 2
Biyoinformatiğe Giriş 2
Genetik ve Çevrimsel Tıp 2
6
2016-2018 Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümünde Verdiği Genetik Dersleri

Dönem
Saati Öğrenci
Akademik Dönem / Yarı
Dersin Adı (Saat) Sayısı
Yıl Yıl
(Toplam)
Teorik
İnsan Genomu ve Kalıtımın
2
Kromozomal Temelleri
Gen Yapısı ve Fonksiyonu 2
İnsan Moleküler Genetiği İnceleme
2
Yolları
Klinik Sitogenetiğin Temelleri 2
Otozomal ve Cinsiyet Kromozomu
2
Hastalıkları
Tek Gen Kalıtımının Temelleri 2
Kompleks Kalıtımlı Yaygın
2
Dönem III / Hastalıkların Genetiği
5
2017-2018 Birinci Yarıyıl
Bireylerdeki ve Populasyondaki

Genetik Varyasyonlar: Mutasyon ve 2
Polimorfizm
Genetik Hastalıkların Moleküler, 2
Biyokimyasal ve Hücresel Temelleri
Gelişim Genetiği ve Doğum 2
Defektleri
Prenetal Tanı 2
Kanser Genetiği 2
Tıbbi Genetikte Etik 2

7
ESERLER
A. Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler:
A1 Ozgun, M.T., C. Batukan, M. Basbug, H. Akgun, O. Caglayan, M. Dundar, “Prenatal
diagnosis of a fetus with partial trisomy 7p,” Fetal Diagn. Ther., 22: 229-232 (2007).
A2 Batukan, C., M.T. Ozgun, M. Basbug, O. Caglayan, M. Dundar, N. Murat,
“Sacrococcygeal teratoma in a fetus with prenatally diagnosed partial trisomy 10q
(10q24.3-->qter) and partial monosomy 17p (p13.3-->pter),” Prenat. Diagn., 27: 365-
368 (2007).
A3 Per, H., H. Gumus, K. Ichida, O. Caglayan, S. Kumandas, “Molybdenum cofactor
deficiency: Clinical features in a Turkish patient”, Brain Dev., 29: 365-368 (2007).
A4 Saatci, C., A.O. Caglayan, Y. Ozkul, M. Dundar, “Prenatal Diagnosis of Unique
Translocation t(7;15) q11.23;q26.3) in a Fetus”, Egypt. J. Med. Hum. Genet., 8: 105-
110 (2007). #Corresponding yazar
A5 Dundar, M., O. Caglayan, C. Saatci, H. Karaca, M. Baskol, S. Tahiri, Y. Ozkul, “How
the I1307K Adenomatous Polyposis Coli Gene Variant Contributes in the
Assessment of Risk of Colorectal Cancer, but not Stomach Cancer, in a Turkish
Population”, Cancer Genet. Cytogenet., 177: 95-97 (2007).
A6 Caglayan, A.O., # M. Dundar, “Megarbane Syndrome” Ind. J. Hum. Genet., 14: 27-
29 (2008). #Corresponding yazar
A7 Eggermann, T., E. Meyer, O. Caglayan, M. Dundar, N. Schönherr, “ICR1
epimutations in 11p15 are restricted to patients with Silver-Russell syndrome
features”, J. Pediatr. Endocrinol. Metab., 21: 59-62 (2008).
A8 Saatci, C, Y. Ozkul, S. Tahiri, A.O. Caglayan, A.B. Turhan, M. Dundar, “The effect
of maras powder on DNA methylation and micronucleus formation in human buccal
tissue”, J. Toxicol. Environ. Health. A., 71: 396-404 (2008).
A9 Unger, S., F. Antoniazzi, M. Brugnara, Y. Alanay, A. Caglayan, K. Lachlan, S.
Ikegawa, G. Nishimura, B. Zabel, J. Spranger, A. Superti-Furga, “Clinical and
radiographic delineation of odontochondrodysplasia”, Am. J. Med. Genet.
A., 146: 770-778 (2008 ).
A10 Caglayan, A.O.,# E. Koklu, C. Saatci, T. Gunes, Y. Ozkul, N. Narin, D. Buyukkayhan,
A. Baykan, M. Dundar, “Holt-Oram Syndrome In Two Generations With Translocation
t(9;15)(p12;q11.2)”, Ann. Saudi. Med., 28: 209-212 (2008). #Corresponding yazar
A11 Dundar, M., A.O. Caglayan, C. Saatci, K. Arslan, Y. Ozkul, “Down Syndrome Like
Appearance With A Novel Denovo Translocation t(6;21)(q21;q13)”, Ind. J. Med. Res.,
128: 666-668 (2008).
8
A12 Dundar, M., K. Erkilic, M. Agun, A.O. Caglayan, P. Comeglio, G. Matyas, A.H. Child,
“Scoliosis, blindness and arachnodactyly in a large Turkish Family: Is it new
syndrome?”, Genet. Couns., 19: 319-330 (2008).
A13 Dundar, M, A.O. Caglayan, C. Saatci, Y. Ozkul, “Can the classical euchromatic
variants of 9q12/qh+ cause recurrent abortions?”, Genet. Couns., 19: 281-286
(2008).
A14 Tanriverdi, F., S. Taheri, H. Ulutabanca, A.O. Caglayan, Y. Ozkul, M. Dundar, A.
Selcuklu, K. Unluhizarci, F.F. Casanueva, F. Kelestimur, “Apolipoprotein E3/E3
genotype decreases the risk of pituitary dysfunction after traumatic brain injury due
to various causes: preliminary data”, J. Neurotrauma, 25: 1071-1077 (2008).
A15 Dundar, M., C. Saatci, S. Tasdemir, M. Akcakus, A.O. Caglayan, Y. Ozkul, “Frank-
ter Haar syndrome with unusual clinical features”, Eur. J. Med. Genet., 52: 247-249
(2009).
A16 Yalcin, A.A., N. Kalay, A.O. Caglayan, F. Kayaalti, M. Duran, I. Ozdogru, M.T. Inanc,
A. Dogan, E. Basar, A. Oguzhan, “The Relationship between Slow Coronary Flow
and Angiotensin Converting Enzyme and ATIIR1 Gene Polymorphisms”, J. Natl. Med.
Assoc., 101: 40-45 (2009).
A17 Saatci, C., A.O. Caglayan, Y. Ozkul, S. Tahiri, A.B. Turhan, M. Dundar, “Detection
of p16 promotor hypermethylation in "Maras powder" and tobacco users”, Cancer
Epidemiology, 33: 47-50 (2009).
A18 Caglayan, O.,# N. Kalay, C. Saatci, A. Yalcın, H. Akalın, M. Dundar, “Lack of
Association of the Glu298Asp Polymorphism of Endothelial Nitric Oxide Synthase
with Coronary Slow Flow in the Turkish Population”, Canadian J. Cardiology, 25: e69-
72 (2009). #Corresponding yazar
A19 Caglayan, A.O.,# M. Dundar, “Inherited diseases and syndromes leading to aortic
aneurysms and dissections”, Eur. J. Cardiothorac. Surg., 35: 931-940
(2009). #Corresponding yazar
A20 Caglayan, A.O.,# F. Demiryilmaz, M. Kendirci, I. Ozyazgan, S. Bittmann, “Mixed
Gonadal Dysgenesis With 45,X/46,X,Idic(Y)/46,XY, Idic(Y) Karyotype”, Genetic
Counseling, 20(2): 173-179 (2009). #Corresponding yazar
A21 Caglayan, A.O.,# M.T. Ozgun, F. Demiryilmaz, I. Ozyazgan, “Can Heterochromatin
Polymorphism Of Chromosome 6 Affect Fertility?”, Genetic Counseling, 20(2): 203-
206 (2009). #Corresponding yazar
A22 Kalay, N., A.O. Caglayan, H. Akkaya, I. Ozdogru, A. Dogan, M.T. Inanc, M.G. Kaya,
A. Ergin, R. Topsakal, N.K. Eryol, A. Oguzhan, M.Dundar, “The deletion
polymorphism of the angiotensin-converting enzyme gene is associated with acute
aortic dissection”, The Tohoku Journal of Experimental Medicine, 219: 33-37 (2009)
9
A23 Caglayan, A.O.,# U. Uksal, H.C. Hennies, “Epidermolytic palmoplantar keratoderma
due to keratin 9 gene mutation (Arg163Trp)” Eur. J. Pediat. Dermatol., 19: 95-96
(2009). #Corresponding yazar
A24 Caglayan, A.O., # H Gumus, I Erdogan, “A Female Case with Multicystic Dysplastic
Kidney: A New Findings, Genetic Counseling and Literature Review”, Central
European Journal of Urology, 63(3): 151-152 (2010). #Corresponding yazar
A25 Caglayan, A.O., # H. Gumus, “A Very Rare Neurocutaneous Disorder in Two Sibs:
Sjögren-Larsson Syndrome”, Journal of Child Neurology, 25(8): 1003-1005
(2010). #Corresponding yazar
A26 Caglayan, A.O.,# “Genetic Causes of Syndromic and Non-Syndromic Autism”,
Developmental Medicine and Child Neurology, 52(2): 130-138
(2010). #Corresponding yazar
A27 Saatci, C., A.O. Caglayan, # I. Kocyigit, H. Akalin, L.G. Kaynar, F. Altuntas, B. Eser,
M. Demir, M. Cetin, Y. Ozkul, “Expression of WT1 gene in multiple myeloma patients
at diagnosis: Is WT1 Gene Expression Useful Marker In Multiple Myeloma?”,
Hematology, 15(1): 39-42 (2010). #Corresponding yazar
A28 Caglayan, A.O.,# J.J.M. Engelen, S. Ghesquiere, M.Alofs, C. Saatci, M. Dundar,
“Fluorescence In situ Hybridization and Single Nucleotide Polymorphism of a New
Case with inv dup del(8p)”, Genetic Counseling, 20(4): 333-340
(2009). #Corresponding yazar
A29 Dundar, M., A.O. Caglayan, C. Saatci, Z. Cetin, K. Arslan, A.S. Uzak, “A Case with
a Rare Chromosomal Abnormality: Isochromosome 18p”, Genetic Counseling, 21(1):
69-74 (2010).
A30 Caglayan, A.O., # I. Ozyazgan, F. Demiryilmaz, M.T. Ozgun, “Are Heterochromatin
Polymorphisms Associated with Recurrent Miscarriage”, Journal of Obstetrics and
Gynecology Research, 36(4): 774-776 (2010). #Corresponding yazar
A31 Caglayan, A.O.,# I. Ozyazgan, F. Demiryilmaz, H. Gumus, “MEFV Gene Compound
Heterozygous Mutations In Familial Mediterranean Fever Phenotype: A
Retrospective Clinical and Molecular Study”, Nephrology Dialysis Transplantation,
25(8): 2520-2523 (2010). #Corresponding yazar
A32 Caglayan, A.O.,# H. Gumus, M. Kato, “Two female siblings with West syndrome:
Familial idiopathic West syndrome with genetic susceptibility and variable phenotypic
expression.” Journal of Pediatric Neuroscience, 5(2): 147-149
(2010). #Corresponding yazar
A33 Caglayan, A.O,# J. Klammt, W. Kiess, N. Hatipoglu, R. Pfäffle, S. Kurtoglu, C. Saatcı,
M. Dundar, “A unique case of a patient with partial trisomy 22 and lipodystrophy: Is it
10