PENETAPAN KADAR DAN ANALISIS PROFIL PROTEIN DAN ASAM AMINO EKSTRAK AMPAS ...

77 Pages·2013·2.67 MB·Indonesian

UIN SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA

PENETAPAN KADAR DAN ANALISIS PROFIL
PROTEIN DAN ASAM AMINO EKSTRAK AMPAS
BIJI JINTEN HITAM (Nigella sativa Linn.) DENGAN
METODE SDS-PAGE DAN KCKT

SKRIPSI

NIA YULIANI DEWI
NIM.108102000030

FAKULTAS KEDOKTERAN DAN ILMU KESEHATAN
PROGRAM STUDI FARMASI
JAKARTA
SEPTEMBER 2013
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
UIN SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA

PENETAPAN KADAR DAN ANALISIS PROFIL
PROTEIN DAN ASAM AMINO EKSTRAK AMPAS
BIJI JINTEN HITAM (Nigella sativa Linn.) DENGAN
METODE SDS-PAGE DAN KCKT

SKRIPSI
Diajukan sebagai salah satu syarat memperoleh gelar Sarjana Farmasi
(S.Far)

NIA YULIANI DEWI
NIM.108102000030

FAKULTAS KEDOKTERAN DAN ILMU KESEHATAN
PROGRAM STUDI FARMASI
JAKARTA
SEPTEMBER 2013
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
ABSTRAK

Nama : Nia Yuliani Dewi
Program Studi : Farmasi
Judul : Penetapan Kadar dan Analisis Profil Protein dan
Asam Amino Ekstrak Ampas Biji Jinten Hitam
(Nigella sativa Linn.) dengan Metode SDS-PAGE
dan KCKT.

Biji jinten hitam (Nigella sativa Linn.) merupakan salah satu tumbuhan obat yang
antara lain berkhasiat sebagai pelancar ASI, peluruh buang angin, pencegah
muntah, pencahar, pengelat, pengobatan pasca persalinan dan immunomodulator.
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kadar dan profil protein serta asam
amino pada ekstrak ampas biji jinten hitam. Ekstraksi protein dari ampas biji
jinten hitam (Nigella sativa Linn.) menggunakan PBS (phosphate buffer saline)
pH 7,2 dan di sentrifuge dengan kecepatan 10.000 rpm pada suhu 40C selama 30
menit. Pengukuran kadar protein digunakan dengan metode Lowry menggunakan
pereaksi folin-ciocalteu yang di ukur pada panjang gelombang 737,5 nm. Hasil
pengukuran kadar protein dengan metode Lowry didapatkan kandungan protein
pada ekstrak ampas biji jinten hitam yaitu 8,5848 mg/ml. Analisis profil protein
dilakukan dengan menggunakan sodium dedosil sulfat poliakrilamid gel
elektroforesis (SDS-PAGE). Elektroforesis gel poliakrilamid digunakan untuk
mengetahui profil protein serta bobot molekul dari ampas biji jinten hitam
(Nigella sativa Linn.). Pewarnaan pita protein menggunakan comassie brilliant
blue. Data dianalisis secara deskriftif berdasarkan nilai migrasi pita protein
sampel dibandingkan dengan pita protein marker (Rf). Hasil analisis profil protein
dengan menggunakan SDS-PAGE menunjukkan pada ampas biji jinten hitam
(Nigella sativa Linn.) terdapat pita protein dengan berat molekul 67,4839 kDa –
8,0872 kDa. Penentuan kandungan asam amino dilakukan dengan menggunakan
KCKT. Hasil analisis kandungan asam amino pada ampas biji jinten hitam
(Nigella sativa Linn.) menunjukkan terdapat 16 asam amino dengan kandungan
total 1,055%. Diantaranya 9 asam amino esensial, yaitu histidin 0,015%, arginin
0,035%, treonin 0,021%, valin 0,032%, metionin 0,001%, lisin 0,182%, isoleusin
0,020%, leusin 0,030%, fenilalanin 0,013%; serta 7 asam amino non esensial,
yaitu aspartat 0,058%, serin 0,064%, glutamat 0,071%, glisin 0,053%, alanin
0,219%, prolin 0,148%, dan tirosin 0,005%.
Kata kunci : Ampas Biji Jinten Hitam (Nigella sativa Linn.), Profil Protein,
Asam Amino.

UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
ABSTRACT

Name : Nia Yuliani Dewi
Program Study : Pharmacy
Title : Determination and Analysis Of Protein Profile and
Amino Acid of Black Cumin Seeds Waste Extrac
Using SDS-PAGE and HPLC Method.

Black cumin seeds (Nigella sativaLinn.) is one of herb that had potency like
facilitator milk, laxative flatulence, preventing vomiting, laxatives, postpartum
treatment and immunomodulator. The aims of this research is to determine protein
concentration and profile protein and amino acids on black cumin seeds waste
extract. The extraction of proteins from the black cumin seeds waste (Nigella
sativa Linn.) using PBS (phosphate buffer saline) pH 7.2 and centrifuged at
10,000 rpm at a 40C for 30 minutes. Measurement of protein concentration using
the Lowry method using Folin-Ciocalteu reagent is measured at a wavelength of
737.5 nm. Protein measurement results obtained by the method of Lowry protein
content from black cumin seed waste extrac is 8.5848 mg/ml. Poliacrylamide gel
electrophoresis is used to know determine the molecular weight of the protein
profile of black cumin seeds waste (Nigella sativa Linn.). Staining the protein
comassie brilliant blue was used. Data were analyzed descriptively, based on
score of the migration of the sample protein band compared marker protein band
(Rf). Results of analysis of protein profiles using SDS-PAGE showed the of black
cumin seeds waste (Nigella sativa Linn.) There is a protein band with BM
67.4839 – 8.0872 kDa. Determination of the amino acid content is done using
HPLC. Results of analysis of amino acid content in the black cumin seeds waste
(Nigella sativa Linn.) Shows are 16 amino acids with total amino acid 1,055%.
Nine of them are assential amino acids, they are histidine 0,015%, arginine
0,035%, threonine 0,021%, valine 0,032%, metheonine 0,001%, lysin 0,182%,
isoleucine 0,020%, leucine 0,030%, phenylalanine 0,013%. And the other seven
are non-essential, they are aspartic acid 0,058%, serine 0,064%, glutamic acid
0,071%, glycine 0,053%, alanine 0,219%, proline 0,148%, dan tyrosine 0,005%.

Keywords : Black Cumin Seeds Waste (Nigella sativa Linn.), Protein
Profile, Amino Acid.

UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
KATA PENGANTAR

Puji syukur kepada Allah SWT. Atas segala rahmat-Nya, penulis dapat
menyelesaikan skripsi yang berjudul “Penetapan Kadar dan Analisis Profil Protein
dan Asam Amino Ekstrak Ampas Biji Jinten Hitam (Nigella sativa Linn.) dengan
Metode SDS-PAGE dan KCKT”. Skripsi ini disusun untuk memenuhi salah satu
syarat menempuh ujian akhir guna memperoleh gelar Sarjana Farmasi pada
Program Studi Farmasi Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas
Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta.
Penulis menyadari bahwa, keberhasilan penulisan dan penyusunan
skripsi ini tidak lepas dari bantuan dan bimbingan serta do’a dari berbagai pihak,
dari masa perkuliahan sampai pada penyusunan skripsi ini. Oleh karena itu,
penulis mengucapkan terima kasih kepada:
(1) Ibu Farida Sulistiawati, M.Si, Apt selaku pembimbing pertama dan Ibu Lina
Elfita, M.Si, Apt selaku pembimbing kedua, yang memiliki andil besar
dalam proses penelitian dan penyelesaian tugas akhir penulis ini, semoga
segala pengarahan, nasehat, dukungan serta bantuan kedua pembimbing
mendapat imbalan yang jauh lebih baik di sisi-NYA.
(2) Bapak Prof. Dr. (hc). Dr. M. K. Tadjudin, Sp. And. selaku Dekan Fakultas
Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Islam Negeri (UIN) Syarif
Hidayatullah Jakarta.
(3) Bapak Drs. Umar Mansur, M.Sc, Apt, selaku ketua Program Studi Farmasi
Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Islam Negeri (UIN)
Syarif Hidayatullah Jakarta.
(4) Ibu Eka Putri, M.Si, Apt selaku pembimbing akademik.
(5) Bapak dan Ibu staf pengajar Program Studi Farmasi yang telah memberikan
ilmu dan pengetahuan hingga penulis dapat menyelesaikan studi di jurusan
Farmasi Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan UIN Syarif Hidayatullah
Jakarta.
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
(6) Para staf dan karyawan program studi Farmasi. Staf Administrasi Farmasi,
Kak Pia yang telah banyak membantu dalam kelancaran studi kuliah.
(7) Pihak laboratorium Program Studi Farmasi Kak Eris, Mba Rani, Kak Yopi
dan Kak Liken; Pihak Laboratorium Terpadu UIN Kak Prita, Kak Pipit;
pihak Laboratorium PT. Saraswanti Indo Genetech Bogor. Terima kasih
karena telah banyak membantu selama proses penelitian.
(8) Kedua Orang Tua, Ayahanda H. Anan Ardiansyah dan Ibunda Hj. Eni
Suherti yang telah membesarkan, memberikan kasih sayang, mendoakan
dan memberikan dukungan luar biasa baik moril maupun materil kepada
penulis untuk segera menyelesaikan Skripsi ini. Terima kasih bapak dan
mamah. Tiada apapun di dunia ini yang dapat membalas semua kebaikan
yang telah bapak dan mamah berikan, hanya Allah yang bisa membalas
dengan Jannah-Nya.
(9) Kakak penulis Teh Dian yang telah banyak memotivasi, menghibur dan
memberikan do’a serta semangat hingga penulis dapat menyelesaikan
skripsi ini dan adik-adik penulis Epul dan Thalita.
(10) Sahabat penulis Wiwin, Sinthi, Ade, Sivia dan Nurma yang telah menjadi
sahabat-sahabat paling baik dan menjadikan hari-hari berwarna. Serta Imam
Maulana yang telah memberikan dukungan dan doa serta semangat hingga
penulis dapat menyelesaikan skripsi ini.
(11) Teman seperjuangan penelitian Sinthi Ayesha dan Zikriah atas perhatian,
kerjasama dan kebersamaan selama penelitian ini.
(12) Teman-teman seperjuangan Farmasi angkatan 2008 yang sama-sama
berjuang bersama untuk menyelesaikan pendidikan ini.
(13) Teman-teman Komda FKIK dan teman-teman akhwat Al-Kahfi 2008,
terimakasih untuk motivasi dan semangat yang selalu kalian tularkan. Tiada
kata yang dapat penulis ucapkan selain I love u all coz Allah.
(14) Sahabat terbaik penulis, Kariena Febriantin. Terimakasih untuk dukungan,
do’a dan untuk setiap cerita yang selalu kita habiskan bersama. Semoga kita
dapat meraih mimpi-mimpi kita dan sukses dengan profesi kita masing-
masing.
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
(15) Pihak-pihak lain yang terlibat langsung maupun tidak dalam penulisan ini
yang namanya tidak dapat disebutkan.

Semoga apa yang telah diberikan kepada penulis, baik dalam bentuk doa,
dukungan, motivasi, dan tenaga atau apapun bentuknya. Semoga Allah membalas
kebaikan ini. Aamiin Ya Rabb..

Ciputat, September 2013

Penulis

UIN Syarif Hidayatullah Jakarta