Departamento de Biotecnología Papel de TERMINAL FLOWER 1 en el control de la arquitectura vegetal. Análisis de los genes que regulan su expresión Memoria presentada por PEDRO FERNÁNDEZ NOHALES para optar al grado de DOCTOR por la Universitat Politècnica de València. Director: Francisco Madueño Albi Valencia, Septiembre 2011 Don Francisco Madueño Albi, Doctor en Ciencias Biológicas y Científico Titular del Consejo Superior de Investigaciones Científicas en el Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas (Universidad Politécnica de Valencia-Consejo Superior de Investigaciones Científicas) de Valencia, INFORMA que, Don Pedro Fernández Nohales, Licenciado en Bioquímica, ha realizado bajo mi dirección el trabajo que con el título “Papel de TERMINAL FLOWER 1 en el control de la arquitectura vegetal. Análisis de los genes que regulan su expresión” presenta para optar al grado de Doctor por la Universidad Politécnica de Valencia. Para que así conste a los efectos oportunos, firma el presente certificado en Valencia a 1 de Julio de 2010. Fdo. Dr. Francisco Madueño Albi Resúmenes RESÚMENES Resúmenes During thefloraltransition,theshoot apicalmeristem(SAM) changesits identityfrom vegetative, when it produces leaves and shoots, to inflorescence, when it produces flowers. According to the behaviour of the SAM, the inflorescences can be classified as indeterminate, where the inflorescence SAM grows continuously, or determinate, where the SAM forms a terminal flower. In Arabidopsis, the expression of the TERMINAL FLOWER 1 (TFL1) gene in the centre of the SAM prevents its conversion into a flower and, therefore, the determination of the inflorescence. Thus, TFL1 plays a key role in the control of plant architecture, a function that is related to its particular expression pattern. The main aim of this work has been the identification of genes that regulate the expression of TFL1. A first step toward that aim has been to perform an EMS mutagenesis of a reporter line containing a TFL1pro::GUS transgene in which the regulatory regions of TFL1 direct the expression of the GUS gene. Because of the role of TFL1 in the control of plant architecture, we screened for plants that showed defects both in the pattern of TFL1pro::GUS expression and in inflorescence architecture. Among the selected mutants, the line 63.1, that we named moss, shows increased levels of TFL1pro::GUS expression, which is also ectopic in flowers, and a dramatic alteration in inflorescence architecture. The positional cloning of thecorrespondinggeneshowed thatthemoss phenotype is causedby ahypomorphic mutation in the ARGONAUTE1 (AGO1) gene. Our results suggest that TFL1 expression is regulated by small RNAs through AGO1. In order to identify the promoter regions that are critical for the expression of TFL1, we have also analyzed the TFL1 promoter by phylogenetic footprinting, and have combined these results with those from a deletion analysis previously carried out in our lab. One of the identified regulatory regions has been used in a screening with the yeast one-hybrid system. This screening resulted in the identification of TCP7, a transcription factor for which no function has been reported so far, as a protein able to bind to the TFL1 promoter. The characterization of lines where TCP7 is over-expressed or silenced showed that they have phenotypes related to the architecture of the inflorescence. Moreover, our data indicate that TCP7 represses TFL1. Our results support the idea that TCP7 controls plant architecture through the regulation of TFL1. Resúmenes Durante la transición floral, el meristemo apical del tallo (SAM) cambia su identidad de vegetativo, fase en la que produce hojas y ramas, a inflorescente, fase en que produce flores. Las inflorescencias se clasifican, según la identidad del SAM, en indeterminadas, en las que el SAM crece continuamente durante toda la vida de la planta, y determinadas, en las que el SAM da lugar a una flor terminal. En Arabidopsis, la expresión del gen TERMINAL FLOWER 1 (TFL1) en el centro del SAM impide su conversión en flor y, por lo tanto, la determinación de la inflorescencia. Así pues, TFL1 mantiene la identidad inflorescente del SAM, teniendo, por tanto, un papel clave en el control de la arquitectura de la planta. Esta función de TFL1 está íntimamente relacionada con su particular patrón de expresión. El objetivo principal de este trabajo ha sido la identificación de genes que regulan la expresión de TFL1. Para ello, en primer lugar, se llevó a cabo la mutagénesis con EMS de una línea delatora que contiene un transgén, TFL1pro::GUS, en la que la expresión del gen GUS se encuentra dirigida por las regiones reguladoras de TFL1. Dado al papel de TFL1 en el control de la arquitectura de la planta, el escrutinio se realizó buscando plantas que tuvieran un patrón de expresión de TFL1pro::GUS alterado y, a su vez, presentaran defectos en la arquitectura de su parte aérea. Entre los mutantes seleccionados, la línea 63.1, a la que denominamos moss, resultó ser un mutante hipomorfo del gen ARGONAUTE 1 (AGO1). El mutante moss muestra un aumento de la expresión de TFL1pro::GUS en el SAM, y expresión ectópica en las flores, así como una dramática alteración de la arquitectura de su inflorescencia que parece estar relacionada con el aumento de la expresión de TFL1. Nuestros resultados abren la puerta a la idea de que pequeños RNAs participen en la regulación de TFL1 a través de AGO1. Por otro lado, en este trabajo también se han identificado regiones del promotor de TFL1 que son clave para la expresión del gen. Para ello se analizó el promotor de TFL1 mediante phylogenetic shadowing y los resultados obtenidos se combinaron con los de un análisis de deleciones realizado previamente en nuestro laboratorio. Una de las regiones reguladoras identificadas se utilizó en un escrutinio de híbrido simple que puso de manifiesto que el factor de transcripción TCP7, de función desconocida, es capaz de unirse al promotor de TFL1. El análisis fenotípico de líneas con pérdida o ganancia de función del gen TCP7 ha mostrado que cambios en la expresión de TCP7 causan alteraciones en la arquitectura de la inflorescencia de la planta. Este análisis también indicó que TCP7 reprime la expresión de TFL1. Nuestros resultados sugieren que TCP7 controla la arquitectura de la planta a través de la regulación de TFL1.
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