FLÁVIA MATARAZZO DIVERSIDADE E ANÁLISE QUANTITATIVA DE MICRORGANISMOS DO DOMÍNIO ARCHAEA EM AMOSTRAS DE BIOFILME SUBGENGIVAL DE INDIVÍDUOS COM PERIODONTITE AGRESSIVA E SAÚDE PERIODONTAL Tese apresentada ao Programa de Pós- Graduação em Microbiologia do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo, para obtenção do Título de Doutor em Ciências. São Paulo 2010 FLÁVIA MATARAZZO DIVERSIDADE E ANÁLISE QUANTITATIVA DE MICRORGANISMOS DO DOMÍNIO ARCHAEA EM AMOSTRAS DE BIOFILME SUBGENGIVAL DE INDIVÍDUOS COM PERIODONTITE AGRESSIVA E SAÚDE PERIODONTAL Tese apresentada ao Programa de Pós- Graduação em Microbiologia do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo, para obtenção do Título de Doutor em Ciências. Área de Concentração: Microbiologia Orientadora: Profa. Dra. Marcia Pinto Alves Mayer. São Paulo 2010 2 DADOS DE CATALOGAÇÃO NA PUBLICAÇÃO (CIP) Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo © reprodução total Matarazzo, Flávia. Diversidade e análise quantitativa de microrganismos do domínio Archaea em amostras de biofilme subgengival de indivíduos com periodontite agressiva e saúde periodontal. / Flávia Matarazzo. -- São Paulo, 2010. Orientador: Márcia Pinto Alves Mayer. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo. Instituto de Ciências Biomédicas. Departamento de Microbiologia. Área de concentração: Microbiologia. Linha de pesquisa: Microbiologia Oral. Versão do título para o inglês: Diversity and quantitative analysis of microorganisms of Archaea domain in biofilm subgingival samples from aggressive periodontitis and periodontally healthy subjects. Descritores: 1. Archaea 2. 16S rRNA 3. Biofilme subgengival 4. Periodontite agressiva 5. Saúde periodontal I. Mayer, Márcia Pinto Alves II. Universidade de São Paulo. Instituto de Ciências Biomédicas. Programa de Pós-Graduação em Microbiologia III. Título. ICB/SBIB0126/2010 UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS ______________________________________________________________________________________________________________ Candidato(a): Flávia Matarazzo. Título da Tese: Diversidade e análise quantitativa de microorganismos do domínio Archaea em amostras de biofilme subgengival de indivíduos com periodontite agressiva e saúde periodontal. . Orientador(a): Marcia Pinto Alves Mayer. A Comissão Julgadora dos trabalhos de Defesa da Tese de Doutorado, em sessão pública realizada a ................./................./................., considerou ( ) Aprovado(a) ( ) Reprovado(a) Examinador(a): Assinatura: ............................................................................................... Nome: ....................................................................................................... Instituição: ................................................................................................ Examinador(a): Assinatura: ................................................................................................ Nome: ....................................................................................................... Instituição: ................................................................................................ Examinador(a): Assinatura: ................................................................................................ Nome: ....................................................................................................... Instituição: ................................................................................................ Examinador(a): Assinatura: ................................................................................................ Nome: ....................................................................................................... Instituição: ................................................................................................ Presidente: Assinatura: ................................................................................................ Nome: ....................................................................................................... Instituição: ................................................................................................ 4 Dedico este trabalho Aos meus pais, Armando e Maura, em quem busco forças para lutar. Ao meu marido, Guilherme, que superou os períodos em que eu não pude estar perto. 5 AGRADECIMENTOS A Deus, Pai, Filho e Espírito Santo, cuja luz não se apaga. A Marcia Mayer, minha orientadora, pelo respeito e paciência em me orientar. Os caminhos profissionais foram se abrindo durante o Doutorado, e mesmo preocupada com a conclusão dos experimentos, nunca deixou de me apoiar nas minhas decisões. A Adriana Ribeiro, minha eterna amiga, com quem venci todas as dificuldades metodológicas deste trabalho e em quem confio os desafios da vida extra-laboratorial. A Josely Umeda, que me acolheu incondicionalmente, no laboratório e no conforto de sua casa durante uma boa parte do Doutorado. A Silvia Teixeira, também pelo acolhimento e por ser tão prestativa, prática e atenciosa neste período importante da minha vida. Ao Marcelo de Faveri, que sempre me abriu os caminhos da Pós-Graduação, tornando o contato inicial com os meus orientadores muito mais prazeroso. Também por ter cedido as amostras clínicas analisadas neste trabalho. Aos amigos do Laboratório de Microbiologia Oral, Ellen, Dione, Cristina, Éricka, Priscila, Talita, Ana Carla, Felipe, Daniela, Lucas, Mayke, pela convivência tão agradável do dia a dia. Ao João e ao Léo, técnicos do laboratório, pela amizade e por facilitarem a realização dos experimentos e confecção da tese. Ao Laboratório de Microbiologia Ambiental, representado pela Profa. Dra. Vivian Pelizzari, que cedeu a amostra que serviu de controle positivo para Archaea e 6 especialmente e à Ana Carolina, pós-graduanda deste laboratório, com quem sempre esclarecia dúvidas sobre diversidade microbiana. Ao Laboratório de Genética, representado pela Profa. Dra. Elizabete, que disponibilizou o equipamento para análise por PCR quantitativo. 7 Porque parece que na hora não vou agüentar, se eu sempre tive força, e nunca parei de lutar? Trecho da Música “Pensa em mim” de Bernardo Faria/Conrado D´Avila 8 ESTE TRABALHO FOI FINANCIADO PELA FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO (FAPESP) PROCESSOS 2006/52890-6 E 2007/52509-6 9
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