Ingrid Alsos Lian Mechanisms involved in the pathogenesis of pre-eclampsia and fetal growth restriction Transcriptional analyses of placental and decidual tissue Thesis for the degree of Philosophiae Doctor Trondheim, January 2012 Norwegian University of Science and Technology Faculty of Medicine Department of Cancer Research and Molecular Medicine NTNU Norwegian University of Science and Technology Thesis for the degree of Philosophiae Doctor Faculty of Medicine Department of Cancer Research and Molecular Medicine © Ingrid Alsos Lian ISBN 978-82-471-3303-3 (printed ver.) ISBN 978-82-471-3304-0 (electronic ver.) ISSN 1503-8181 Doctoral theses at NTNU, 2012:21 Printed by NTNU-trykk MMekanismer relatert til utvikling av svangerskapsforgiftning og føtal veksthemming Genekspresjonsanalyser av placenta og decidua vev Svangerskapsforgiftning (preeklampsi) og føtal veksthemming er alvorlige svangerskaps- komplikasjoner og viktige årsaker til økt sykelighet og død hos gravide kvinner og deres avkom. Selv om forståelsen av hvordan disse tilstandene oppstår har økt de siste årene, er det fortsatt manglende kunnskap rundt mekanismene som bidrar. En rekke observasjoner tyder på at en mangelfull utvikling av morkaken (placenta) kan ligge til grunn. I et normalt svangerskap vil trofoblaster (morkakeceller) invadere og omdanne morkakens tilførende blodkar for å sørge for stabil blodtilførsel til morkaken og fosteret under graviditeten. Ved preeklampsi og føtal veksthemming er denne prosessen ufullstendig, noe som kan resultere i utilstrekkelig tilførsel av blod og næringsstoffer til fosteret, morkaken og det underliggende vevet (decidua). Videre vil en ”syk” morkake respondere på redusert blodtilførsel ved å skille ut faktorer til kvinnens sirkulasjon som kan forårsake skade på karendotelet, og føre til høyt blodtrykk og protein i urinen (tegn på preeklampsi) hos affiserte kvinner. Hensikten med arbeidet som presenteres i denne avhandlingen har vært å kartlegge hvilke molekylære mekanismer som er assosiert med mangelfull morkakedannelse ved preeklampsi og føtal veksthemming. For å gjøre dette, har vi blant annet tatt i bruk genekspresjonsanalyser, hvor det er mulig å måle uttrykket av titalls tusen gener i én analyse. Resultatene fra disse analysene viste at kvinner med preeklampsi i kombinasjon med føtal veksthemming har økt genuttrykk av faktorer som påvirker kardannelse negativt i morkaken sammenlignet med kvinner med isolert preeklampsi eller føtal veksthemming (studie I). Når disse faktorene skilles ut til mors sirkulasjon kan de bidra til utvikling av preeklampsi. Nivået av disse faktorene i morkakevevet ser ut til å ha sammenheng med alvorlighetsgrad av sykdom. Videre fant vi nedsatt gen- og protein uttrykk av matrix metalloproteinase 1 (MMP1) i decidua fra kvinner med preeklampsi og/eller føtal veksthemming (studie II). MMP1 er et viktig enzym for nedbrytning av bindevevet i decidua, og lave nivåer av MMP1 kan være en mulig mekanisme bak nedsatt trofoblastinvasjon ved disse tilstandene. I arbeidet som inngår i denne avhandlingen ble også utrykket av alle gener i decidua fra kvinner med preeklampsi og/eller føtal veksthemming sammenlignet med friske gravide. Denne sammenligningen viste at kvinner med preeklampsi og føtal veksthemming hadde forstyrrelser i flere biologiske prosesser som tidligere har vært assosiert med nedsatt oksygentilførsel til vev, som for eksempel endoplasmatisk retikulum (ER) stress, forsvar mot oksidativt stress og fettsyremetabolisme (studie III). I videre analyser fant vi at av ER stress responsen var aktivert ved føtal veksthemming, isolert eller i kombinasjon med preeklampsi. Ved isolert preeklampsi så ER stress ut til å være mindre fremtredende (studie IV). Dette kan være med på å forklare noen av de kliniske forskjellene som sees ved preeklampsi og føtal veksthemming. Samlet sett har arbeidet i denne avhandlingen bidratt til å kartlegge sentrale mekanismer knyttet til utvikling av preeklampsi og føtal veksthemming, samt skapt noen nye hypoteser som bør undersøkes videre. Kandidat: Ingrid Alsos Lian Institutt: Institutt for kreftforskning og molekylær medisin Veiledere: Professor Rigmor Austgulen og førsteamanuensis Mette Langaas Finansieringskilde: Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet Ovennevnte avhandling er funnet verdig til å forsvares offentlig for graden PhD i molekylærmedisin. Disputas finner sted i Auditoriet, Medisinsk teknisk forskningssenter, fredag 27. januar 2012, kl. 12.15. CCONTENTS ACKNOWLEDGMENTS ........................................................................................................................i ABBREVIATIONS ................................................................................................................................ ii LIST OF PAPERS ................................................................................................................................. iv 1. INTRODUCTION .............................................................................................................................. 1 1.1 Definitions, diagnosis and management ...................................................................................... 1 1.2 Risk factors and long term complications .................................................................................... 3 1.3 Pathogenesis of PE and FGR ........................................................................................................ 4 1.4 Transcriptional analyses of PE and FGR .................................................................................... 14 2. AIMS OF THE STUDIES ................................................................................................................. 16 3. MATERIAL ..................................................................................................................................... 18 3.1 Study population ....................................................................................................................... 18 3.2 Tissue sampling and preparation ............................................................................................... 20 3.3 Ethical considerations................................................................................................................ 21 4. METHODS ...................................................................................................................................... 22 4.1 Microarray gene expression analyses ......................................................................................... 22 4.2 Quantitative RT-PCR analyses .................................................................................................. 23 4.3 Immunohistochemical analyses ................................................................................................. 24 4.4 Western blot analyses ................................................................................................................ 25 4.5 Statistical analyses ..................................................................................................................... 25 4.5.1 Microarray data analyses ................................................................................................... 25 4.5.2 Bioinformatic pathway analyses ........................................................................................ 26 4.5.3 Quantitative RT-PCR data analysis .................................................................................... 27 5. MAIN FINDINGS ............................................................................................................................ 28 6. DISCUSSION ................................................................................................................................... 30 6.1 Methodological considerations .................................................................................................. 30 6.1.1 Diagnostic criteria and phenotype ..................................................................................... 30 6.1.2 Tissue sampling .................................................................................................................. 31 6.1.3 Gestational age ................................................................................................................... 32 6.1.4 Some problems related to transcriptional analyses ............................................................ 33 6.1.5 Global versus targeted analyses of gene expression ............................................................ 35 6.2 Biological considerations – discussion of main findings............................................................. 36 6.2.1 Transcriptional analysis of placental tissue ........................................................................ 36 6.2.2 Anti-angiogenic factors in placental tissue ........................................................................ 36 6.2.3 Trophoblast differentiation and invasion ........................................................................... 37 6.2.4 Altered biological pathways in the pathogenesis of PE ...................................................... 38 6.2.5 ER stress in PE and FGR .................................................................................................... 41 7. CONCLUSIONS AND FUTURE PERSPECTIVES ........................................................................... 43 8. REFERENCES .................................................................................................................................. 45 PAPERS I-IV ........................................................................................................................................... AACKNOWLEDGMENTS The work presented in this thesis has been carried out at the Department of Cancer Research and Molecular Medicine, the Norwegian University of Science and Technology (NTNU) from 2004 to 2011, and at the Perinatology Research Branch, National Institute of Child Health and Human Development, Detroit, USA, in spring 2006. The financial support for the work was ensured trough the Medical Student Research Programme at the Faculty of Medicine, NTNU, from 2004-2009 and trough a PhD grant from the Faculty of Medicine for 2009-2011. First of all, I would like to express my gratitude to Professor Rigmor Austgulen for undertaking the role as my principal supervisor, providing guidance and support throughout the project. I highly appreciate the help from my co-supervisor Mette Langaas, who has been an excellent and patient teacher of statistics and bioinformatics. I also wish to thank my colleagues and friends at the Medical Student Research Programme, with whom I have shared the frustrations of having ‘too much to do and too little time’ and the experience of starting research early in medical school. I especially wish to thank Johanne Toft for her enjoyable companionship during our four years together as research partners in the Medical Student Research Programme. I would like to thank previous and current members of the The Research Group of Human Reproduction; Mona Fenstad, Linda Roten, Mari Løset, Siv Mundal, Line Tangerås, Guro Stødle, Astrid Gundersen, Irina Eide, Åsa Johansson, Guro Olsen, Toai Nguyen, Ann- Charlotte Iversen, Ann-Helen Leknes, and Kristin Rian in the Laboratory Group, for their help, friendship, encouragement and inspiration. There have been many valuable discussions over a cup of coffee. I am grateful to my international collaborators Adi Tarca, Roberto Romero, Offer Erez, Jimmy Espinoza, Daniel Lott, Matthew Johnson and Eric Moses for their contributions. The experienced help from Toril Rolfseng, Borgny Ytterhus and Unn Granli at the Department of Laboratory Medicine, Children’s and Women’s Health, NTNU, in immunohistochemical analyses is deeply appreciated. I am also in debt to employees at the Norwegian Microarray consortium, NTNU, for technical assistance in our second microarray experiment. I also wish to thank Kristine Pettersen, Anne Gøril Lundemo and Caroline Pettersen for teaching me how to do Western blot. I highly appreciate all the mothers that participated in our study, and the doctors that were involved in tissue collection, especially Irina Eide and Line Bjørge. Finally, I thank my parents Vigdis and Jon-Inge and my sister Ingeborg, for their everlasting love and support. Ingrid Alsos Lian, Trondheim, October 2011 i AABBREVIATIONS ANGPTL2 angiopoietin-like 2 ANOVA analysis of variance ARL5B ADP-ribosylation factor-like 5B ATF6 activating transcription factor 6 BMI body mass index CAM cell adhesion molecule cDNA complementary deoxyribonucleic acid CS caesarian section Ct cycle threshold CVD cardiovascular disease DNA deoxyribonucleic acid ECM extracellular matrix EIF2α eukaryotic translation initiation factor 2α EMT epithelial to mesenchymal transition ENG endoglin ER endoplasmic reticulum ERAP2 endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 EVT extravillous trophoblast FDR false discovery rate FGR fetal growth restriction FLT1 fms-related tyrosin kinase 1 FZD4 frizzled family receptor 4 GEE generalized estimating equations GST glutathione s-transferase HMOX1 heme oxygenase 1 I/R ischaemia-reperfusion IDO indoleamine 2,3-dioxygenase IPA ingenuity pathway analysis IRE1 inositol-requiring enzyme 1 KDR kinase insert domain receptor KYNU kynureninase MAN1A2 mannosidase α, class 1A, member 2 MCAM melanoma cell adhesion molecule MMP matrix metalloproteinase mRNA messenger ribonucleic acid NRF2 nuclear respiratory factor 2 PE pre-eclampsia pEIF2α phosphorylated eukaryotic translation initiation factor 2α PERK PKR-like ER kinase ii PLA2G7 phospholipase A2, group VII PlGF placental growth factor qRT-PCR quantitative real-time polymerase chain reaction RMA robust multichip average RNA ribonucleic acid ROAST rotation gene set tests ROMER rotation gene set enrichment analysis ROS reactive oxygen species sENG soluble endoglin SEPS1 selenoprotein S sFLT1 soluble fms-related tyrosin kinase 1 SGA small for gestational age SLITRK4 SLIT and NTRK-like family, member 4 SOLAR sequential oligogenic linkage analysis routines TGF-β transforming growth factor β UPR unfolded protein response VEGF vascular endothelial growth factor XBP1 x-box binding protein 1 XBP1(S) x-box binding protein 1 spliced XBP1(U) x-box binding protein 1 unspliced ZEB2 zinc finger E-box binding homeobox 2 iii LLIST OF PAPERS Paper I Toft JH*, Lian IA*, Tarca AL, Erez O, Espinoza J, Eide IP, Bjørge L, Sun C, Draghici S, Romero R, Austgulen R. Whole-genome microarray and targeted analysis of angiogenesis-regulating gene expression (ENG, FLT1, VEGF, PlGF) in placentas from pre-eclamptic and small-for- gestational-age pregnancies. Journal of Maternal-Fetal and Neonatal Medicine 2008;21(4):267-73. *both authors contributed equally Paper II Lian IA*, Toft JH*, Olsen GD, Langaas M, Bjørge L, Eide IP, Børdahl PE, Austgulen R. Matrix metalloproteinase 1 in pre-eclampsia and/or fetal growth restriction: reduced gene expression in decidual tissue and protein expression in extravillous trophoblasts. Placenta 2010;31(7):615-20. *both authors contributed equally Paper III Løset M, Mundal SB, Johnson MP, Fenstad MH, Freed KA, Lian IA, Eide IP, Bjørge L, Blangero J, Moses EK, Austgulen R. A transcriptional profile of the decidua in preeclampsia. American Journal of Obstetrics and Gynecology 2011;204(1):84.e1-27. Paper IV Lian IA, Løset M, Mundal SB, Fenstad MH, Johnson MP, Eide IP, Bjørge L, Freed KA, Moses EK, Austgulen R. Increased endoplasmic reticulum stress in decidual tissue from pregnancies complicated by fetal growth restriction with and without pre-eclampsia. Placenta 2011;32(11):823-29. iv
Description: