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La Construccion De La Doble Helice De La Nucleina Del Adn PDF

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MARTÍN BONFIL OLIVERA 4 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 n d e c i l é a h e l b o l d a a l e Es la molécula la que tiene glamour, a d n no los científicos. n ó i c FRANCISCRICK c í u e r t s l n o c c Pocas veces un hallazgo científico marca de manera ta- u a jante el inicio de una nueva era. Es el caso del famoso L artículo firmado por J. D. Watson y F. H. C. Crick en el n número del 25 de abril de 1953 de la revista inglesa Na- ture. Con sólo 14 párrafos, el escueto título de “Molecular structure of nucleic acids. A structure for desoxyribose a nucleic acid” y una sola figura —que luego llegaría a con- vertirse en un icono: la “escalera de caracol” de la doble l hélice del ADN—, el artículo de Watson y Crick bastó para marcar formalmente el nacimiento de la genética molecu- e lar. Constituye, junto con la formulación de la teoría de la selección natural de Darwin, o de la teoría celular por d Schleiden y Schwann, uno de los hitos decisivos en la his- toria intelectual de las ciencias biológicas. 5 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 Al igual que la memoria, la historia de la ciencia tiende y en 1889 formuló una teoría llamada pangénesis intrace- a simplificar los hechos, a veces hasta el punto de carica- lular, notoria porque prefigura varias de las características turizarlos. Los descubrimientos científicos, vistos a la dis- de la moderna genética molecular. Hacia 1850 no estaba tancia, parecen logros de genios que conciben de pronto todavía claro que el núcleo de la célula fuera importante grandes ideas que resultan, casi por casualidad, correctas. para la vida, pero en 1866 el prestigiado naturalista alemán Pero rara vez, al menos en las ciencias naturales, se pue- Ernst Haeckel reconoció que “el núcleo interno permite de hablar de descubrimientos individuales. La metáfora de la transmisión de caracteres hereditarios”, lo cual contri- los hombros de gigantes puede estar ya desgastada, pero buyó a afianzar la noción de que los factores responsa- no por ello es menos cierta. Al igual que las especies bio- bles de la herencia debían estar localizados en el núcleo lógicas, las ideas no surgen espontáneamente de la nada: (posteriormente, alrededor de 1910, los trabajos del zoó- evolucionan a partir de ideas anteriores, generadas en logo estadounidense Thomas Hunt Morgan comproba- otros cerebros. También mutan y se combinan unas con rían que se encuentran más precisamente en los cromo- otras; producen descendencia variada que luego es selec- somas). cionada, en parte, por su capacidad para colonizar nuevas De Vries destacó en su teoría esta localización nuclear mentes, pero sobre todo, en el caso de la ciencia, para ajus- del material hereditario. “Considero que el resultado más tarse a eso que llamamos realidad. importante de la investigación celular de la década pasada El descubrimiento de la doble hélice surge, principal- —escribe en 1889—es la teoría de que todas las predispo- mente, de dos linajes de ideas. Uno proviene de la genéti- siciones hereditarias del organismo deben estar represen- ca y se remonta a los conceptos de los antiguos griegos so- tadas en el núcleo de la célula”. Asimismo, en un párrafo bre la pangénesis, que suponía que ciertas secreciones del que parece predecir los descubrimientos moleculares de cuerpo de los padres se mezclaban para dar origen a un décadas futuras, postula que “los portadores materiales hijo. El otro son los estudios acerca de la química del ma- de los caracteres hereditarios no pueden ser idénticos a terial hereditario. las moléculas químicas; deben concebirse como unida- En el siglo XIXhubo varias teorías que buscaban expli- des, construidas a partir de éstas, mucho más grandes que car la transmisión de caracteres hereditarios de padres a ellas y aún así invisiblemente pequeñas”. hijos. Una de ellas, un refinamiento de la pangénesis, fue Sin embargo, al llegar a este punto, poco podía ha- desarrollada por Charles Darwin. Pero la genética sólo se cerse para averiguar el funcionamiento de los genes. Era formalizó como estudio científico con los trabajos del mon- necesaria otra línea de ataque para descifrar el enigma. je austriaco Gregor Mendel, publicados en 1866 en la os- A pesar de que los estudios de genética clásica seguirían cura revista de la Sociedad de Ciencias Naturales de Brno. proporcionando importantes descubrimientos, como el En ellos demostraba la existencia de unidades heredita- mapeo cada vez más preciso de genes en los cromoso- rias que se transmitían de padres a hijos sin mezclarse y mas y la identificación de genes relacionados con fun- siguiendo unas leyes sencillas. Desgraciadamente los es- ciones o enfermedades específicas, fue un segundo li- tudios de Mendel no fueron tomados en cuenta por los naje conceptual el que llevó finalmente a conocer la científicos de su tiempo. Permanecieron olvidados duran- estructura del ADN. Se trata del que proviene de los estu- te cuarenta y cuatro años, hasta que en 1900 fueron re- dios de la química de los sistemas vivos, iniciado con la descubiertos simultánea e independientemente por tres síntesis de las primeras moléculas orgánicas en labora- botánicos que habían reproducido sus experimentos: el torio (la obtención de la urea por Wöhler en 1828), con- holandés Hugo de Vries, el alemán Karl Correns y el aus- tinuada por el nacimiento y desarrollo de la bioquímica triaco Erich von Tschermak. hasta llegar a la biología molecular propiamente dicha. A partir de ese momento fue quedando cada vez más Los detalles rara vez se mencionan al hablar de la histo- claro que para entender a fondo la herencia había que ria del ADN. desentrañar el funcionamiento de estas unidades que el botánico danés Wilhelm Johannsen denominaría genes El padre del ADN en 1909. De Vries había estado trabajando algún tiempo sobre El ácido desoxirribonucleico fue descubierto por Friedrich la herencia, antes de redescubrir los hallazgos de Mendel, Miescher, bioquímico suizo nacido en 1844 y muerto en 6 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 1895. En 1869 Miescher trabajaba en Tubinga haciendo “histoquímica”. En una época en la que muchos investi- gadores se dedicaban a examinar el funcionamiento de la célula, Miescher decidió concentrarse en el estudio de cé- lulas linfoides (glóbulos blancos o linfocitos), mismas que podían obtenerse fácilmente a partir de la pus de los en- fermos de una clínica cercana, pues entonces las infec- ciones graves eran cosa común. Miescher estaba interesado en la composición quími- ca de las células, en particular en las proteínas, sustancias presentes en el “protoplasma” (la “sustancia viva” en el in- terior de la célula, equivalente a lo que hoy conocemos como citoplasma, junto con los organelos que contiene). Por ello se dedicó a tratar de separar el protoplasma y los núcleos de las células. Buscando cómo lograrlo aplicó di- ferentes soluciones de sales a las células mientras las ob- servaba en el microscopio. Fue entonces que hizo una observación importante que desviaría su atención del protoplasma al núcleo: “En el experimento con fluidos dé- bilmente alcalinos, se obtuvieron a partir de las solucio- nes, mediante neutralización, precipitados que no eran solubles en agua, ácido acético, ácido clorhídrico muy di- luido ni en solución de cloruro de sodio, y en consecuen- cia no pueden pertenecer a ninguna de las sustancias proteicas conocidas hasta ahora”. Miescher tenía razones para suponer que este preci- pitado provenía de los núcleos de las células, lo cual era la primera indicación de que el núcleo pudiera tener una composición química propia. Para comprobarlo tuvo que desarrollar una técnica para aislar los núcleos, lo cual lo- gró utilizando pepsina (enzima que destruye proteínas, obtenida de extractos de estómago de cerdo) para rom- per las células. Una vez obtenidos los núcleos en forma pura (lo cual comprobó mediante el microscopio), aisló nuevamente el precipitado a partir de ellos. Posteriormente Miescher también logró purificar su misteriosa sustancia a partir de núcleos de levaduras, cé- lulas de riñón, de hígado, de testículo y glóbulos rojos nucleados y confirmó que no parecía tratarse de una pro- teína. Tomando en cuenta su origen decidió llamarla nu- cleína. El análisis químico indicaba que, además de carbono, oxígeno, nitrógeno e hidrógeno, la nucleína contenía fós- foro, un elemento poco usual en las sustancias de origen biológico estudiadas hasta entonces. El contenido de fós- foro en la nucleína fue lo que contribuyó en gran medi- da a despertar el interés de otros investigadores en su es- 7 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 tudio. Por diversas circunstancias, entre ellas una guerra, últimas no contenían fósforo y sugirió, tomando en cuen- los hallazgos de Miescher no se publicaron sino hasta ta su carácter ácido, un nuevo nombre para la nucleína: 1871. ácido nucleico. Inicialmente Miescher pensaba que la función de la nucleína era servir como reserva de fósforo, mantenién- El núcleo y los cromosomas dolo disponible para cuando la célula lo necesitara. Me- diante el uso de esperma de salmón, una excelente fuen- Mientras tanto los estudios del núcleo celular habían se- te de núcleos, continuó estudiando la composición química guido avanzando paralelamente. Entre 1870 y 1880 el bac- de esta sustancia, aunque la labor se complicaba por lo teriólogo alemán Paul Ehrlich había desarrollado técnicas difícil que resultaba separar la nucleína de las proteínas de tinción química que le permitieron distinguir diver- que, según descubrió el propio Miescher, también estaban sos componentes celulares, entre ellos los cromosomas, presentes en el núcleo. Hacia el final de su vida Mies- llamados así por su propiedad de teñirse con colorantes cher sospechaba, junto con otros, que la nucleína podía básicos. En la misma década varios investigadores se de- constituir la base química de la herencia. dicaron a describir la estructura y comportamiento de los En 1889 Richard Altmann reportó la obtención de nu- cromosomas durante la división celular. Para 1881 Eduard cleína libre de proteínas, con lo cual comprobó que éstas Zacharias aplicó las técnicas desarrolladas por Miescher al estudio de los cromosomas, disolviendo con pepsina el citoplasma de las células y dejando núcleos aislados. Los cromosomas resistían la acción de la pepsina, lo cual indicaba que su naturaleza no era proteica. En 1879 el alemán Walther Flemming propuso el tér- mino cromatina para denominar al material intensa- mente coloreado que aparecía en el núcleo en interfase (cuando no se está dividiendo, a diferencia de los cro- mosomas, que aparecen durante la división) al teñirlo con colorantes básicos. En un estudio de 1882 Flemming escri- be: “En vista de su naturaleza refringente, sus reacciones, y sobre todo su afinidad por los colorantes, [he nombrado “cromatina” a esta sustancia]. Posiblemente la cromatina es idéntica a la nucleína, pero si no, puede deducirse de los estudios de Zacharias que la una contiene a la otra. La palabra cromatina puede servirnos hasta que su naturale- za química sea conocida, y mientras tanto significa la sustancia en el núcleo celular que se tiñe fácilmente”. Co- menzaba así a converger esta línea de investigación cito- lógica con la de Miescher, que era más bioquímica. ¿De qué está hecha la nucleína? La composición química de la nucleína era un problema central en el camino que llevaría directamente al descu- brimiento de la doble hélice, pero antes de abordar la es- tructura de una molécula tan complicada tuvo que estu- diarse su composición en términos de las unidades más sencillas que la forman. En 1879 el bioquímico alemán Albrecht Kossel reali- zó análisis químicos de la nucleína de levaduras (hongos 8 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 unicelulares que en esa época eran considerados plan- Así, durante algún tiempo se creyó que los ácidos nu- tas) y encontró en su composición, además de fósforo en cleicos de las plantas contenían ribosa y los de los ani- forma de fosfato, un compuesto heterocíclico del tipo de males desoxirribosa. Hoy sabemos que el ácido nucleico las bases nitrogenadas (con anillos de carbono y nitróge- de ribosa o ARNes especialmente abundante en las leva- no) llamado guanina. Posteriormente descubrió también duras, mientras que el de desoxirribosa o ADNabunda en la presencia de dos nuevas bases, mismas que llamó ade- el timo. nina y timina. La citosina sería descubierta poco des- Establecidos así los componentes más sencillos de los pués. En 1893 Kossel descubrió que los ácidos nucleicos ácidos nucleicos, comenzó a elucidarse el siguiente nivel contenían también un carbohidrato, que identificó como de su estructura. una pentosa (azúcar de cinco carbonos). En 1909 esta En 1909 Levene y su colaborador Jacobs determina- pentosa fue identificada con más precisión como la D-ri- ron que la base nitrogenada y el fosfato están unidos res- bosa. Paralelamente, también realizó estudios que mos- pectivamente a los carbonos 1 y 5 de la pentosa. Propusie- traron que el papel de la nucleína en células de hígado y ron los términos nucleósidoy nucleótidopara denominar bazo, más que de reserva, se relacionaba con la forma- respectivamente a la unión de una purina y un carbohi- ción de nuevos tejidos. drato y a su éster fosfórico. Durante un tiempo se pensó que el ácido nucleico Ya desde 1893 Kossel y otros habían estudiado con mé- de timo de ternera contenía otro tipo de azúcar, una he- todos bastante burdos las proporciones de las purinas y xosa (seis carbonos), pero posteriormente, mediante es- pirimidinas que se hallaban en los ácidos nucleicos. En el tudios muy cuidadosos, el químico ruso Theodor Leve- ácido nucleico de timo las cuatro parecían hallarse en ne y sus colaboradores encontraron que en realidad cantidades iguales. Esto hizo que surgiera la que hasta la también se trataba de una pentosa: la 2-desoxi-D-ribosa. década de 1940 sería la hipótesis dominante: que la uni- 9 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 dad fundamental de los ácidos nucleicos era un “tetranu- éste tenía un peso molecular muy alto (entre 500 mil y un cleótido” que contenía una de cada una de las cuatro ba- millón), mismo que era de 300 a 600 veces mayor que el ses (incluso, en 1935, llegó a proponerse que se trataba de de las proteínas. Este hallazgo se confirmó mediante otros tetranucleótidos cíclicos). métodos como la ultracentrifugación y la difracción de Para 1938 había quedado claro que los dos tipos de rayos X. El alto peso molecular implicaba que se trataba ácido nucleico, ARN y ADN, se hallaban presentes tanto de un polímero, quizá un polímero de tetranucleótidos. en plantas como animales, pero la investigación sobre su Sin embargo no parecía tener un peso molecular bien de- estructura se hallaba bastante estancada. Una dificultad finido, por lo cual se trataba de una molécula extraña. importante era determinar el peso molecular de los áci- dos nucleicos. En la década de los veintes no se sabía si Volviendo a la química básica se trataba de coloides, agregados de moléculas pequeñas unidas por enlaces débiles, o polímeros, moléculas gigan- La química es una ciencia que tiene dos caras. Una de tes unidas por enlaces covalentes. Hasta ese momento ellas es el análisis, vía seguida hasta entonces en el estu- los métodos usados para aislarlo eran más bien burdos, dio de los ácidos nucleicos. La otra es la síntesis, que per- lo que provocaba su ruptura. Se obtenían pesos molecu- mite confirmar la estructura que se ha deducido para lares de alrededor de 1500, cercanos a lo esperado para una molécula. En 1947 el químico escocés Alexander un tetranucleótido, por lo cual esta hipótesis se vio re- Todd consiguió sintetizar dos nucleótidos, el mono y el forzada. difosfato de adenosina (AMPy ADP), logro que confirmó la En 1938, mediante cuidadosos estudios que recupera- estructura de estas moléculas y por el cual en 1957 reci- ban técnicas desarrolladas por Miescher, el sueco Einar biría el premio Nobel. Hammarsten preparó y estudió ADNde timo (“ácido timo- En el mismo año quedó claro que la diferencia entre nucléico”) y determinó mediante un método óptico que el ARNy el ADNera la ausencia en este último del grupo 0 1 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 hidroxilo en el carbono 2’ de la ribosa (2-desoxirribosa, gracia para la hipótesis de que el ADNestaba formado por de ahí su nombre actual de ácido desoxirribonucleico). tetranucleótidos que contenían una base de cada clase. Es precisamente la presencia de este hidroxilo en el ARN Sin embargo su mayor hallazgo fueron las famosas reglas lo que le confiere una mayor reactividad, y por tanto una de Chargaff, producto de una medida refinada de la este- menor estabilidad, lo cual probablemente explique por- quiometría de las bases en el ADNde especies distintas: la qué, a pesar de que se piensa que las primeras moléculas cantidad de adenina es siempre equivalente a la de timi- autorreplicantes eran ARN, los organismos actuales tie- na y la de guanina a la de citosina. Ésta fue, como se sabe, nen un genoma de ADNy no de ARN. una de las pistas clave que permitieron a Crick y Watson Entre tanto, la hipótesis de los tetranucleótidos co- concretar su modelo. menzó a perder fuerza. Esto se debió en parte a los tra- El resultado de todo este trabajo químico es resumido bajos del químico inglés John Masson Gulland, quien en así por Portugal y Cohen: “a principios de los cincuenta 1947, mediante titulaciones ácido-base muy precisas, es- se sabía que el ADNera un polímero de alto peso molecu- tudió la estequiometría del ADNy mostró que la cantidad lar en el que grupos fosfato unían a los desoxirribonu- de grupos fosfato ionizables por cada molécula era supe- cleósidos entre las posiciones 3’ y 5’ de sus azúcares. La rior a la que correspondería a un tetranucleótido. Adelan- secuencia de las bases se desconocía, aunque se habían tándose al futuro modelo de Watson y Crick, Gulland tam- observado algunas regularidades cuantitativas en la com- bién mostró, mediante el mismo método, que parecía posición de bases. Aun cuando la estructura química deta- haber grupos débilmente ionizables en las bases que po- llada del ADNhabía sido determinada, su geometría mo- drían estar formando enlaces de hidrógeno entre ellas lecular permanecía en el misterio”. El próximo paso sería (aunque no se podía saber si unían partes de una misma la transición a la biología molecular, historia que se na- cadena o cadenas distintas de ADN). rra con más frecuencia. El último gran aporte de la química tradicional en la ruta hacia la doble hélice fue el trabajo realizado por el Nace la genética molecular bioquímico austriaco Erwin Chargaff, quien entre 1948 y 1952 estudió, mediante cromatografía en papel, las pro- Paralelamente a la investigación química del ADN, los es- porciones de las cuatro bases en el ADN. Chargaff halló tudios genéticos estaban demostrando el papel central que los porcentajes de bases presentes en diversas espe- de esta molécula como agente hereditario. cies eran muy variables, aunque la cantidad de purinas En 1928 el bacteriólogo inglés Frederick Griffith des- totales, adenina y guanina, era siempre igual a la canti- cubrió el fenómeno de transformación genética en las dad de pirimidinas, timina y citosina. Éste fue el tiro de bacterias causantes de la neumonía (Pneumococcus). Se 1 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 1 cantidades de proteína que pudieran transmitir la infor- mación genética, como suponían todavía muchos investi- gadores. Las dudas no se esfumarían hasta la publicación en 1952 de un trabajo firmado por Alfred Hershey y Martha Chase, quienes provenían de otra tradición experimen- tal: la que se dedicaba al estudio de los virus de bacterias o bacteriófagos (fagos). Este tipo de estudios había logra- do un alto grado de refinamiento, lo que permitió que Hershey y Chase hicieran el experimento decisivo para confirmar el papel genético del ADN. Utilizando cultivos de fagos marcados radiactivamente, unos con azufre (que sólo está presente en las proteínas) y otros con fósforo (que se halla sólo en el ADNdel virus), comprobaron que cuando un fago infecta a una bacteria para reproducirse, sólo su ADNpenetra en ella y es suficiente para la multi- plicación del fago. Con esto el papel genético del ADNera ya indudable. conocían dos formas del microorganismo: una patógena 1951-1953: La odisea de Cambridge o forma S, capsulaza, y otra inocua o forma R, sin cápsu- la. Griffith halló que al inocular en ratones bacterias vi- Uno de los libros más citados al hablar de la historia del vas de la forma R, junto con bacterias tipo Smuertas por ADNes ¿Qué es la vida?, escrito en 1944 por el físico Erwin calentamiento, se observaba la transformación de las Schrödinger. En él reflexiona sobre la constitución física bacterias Ren Svivas, mismas que eran capaces de cau- del material genético: “A menudo se ha preguntado có- sar la enfermedad. mo, en esta diminuta mancha de materia, el núcleo de En 1944, utilizando cuidadosas técnicas de purifica- un óvulo fertilizado, puede estar contenida una clave ela- ción, el médico canadiense Oswald Avery, junto con Co- borada y que contiene todo el desarrollo futuro del orga- lin MacLeod y Maclyn McCarty, purificó el “principio nismo. Una asociación bien ordenada de átomos, capaz transformante” responsable de este fenómeno y compro- de mantener permanentemente su orden, parece ser la bó que se trataba de ADN(por ejemplo, al mostrar que la única estructura material concebible que ofrece una va- enzima desoxirribonucleasa, que destruye al ADN, elimi- riedad de posibles organizaciones (‘isoméricas’) y que es naba la actividad transformante). La cantidad de técni- suficientemente grande como para poder contener un cas utilizadas para fundamentar su hallazgo se revela en sistema complicado de ‘determinaciones’ dentro de re- un párrafo al final de su histórico artículo: “Los datos ob- ducidos límites espaciales”. tenidos mediante análisis químicos, enzimáticos y sero- Schrödinger postulaba que el gen debía ser un “sólido lógicos [inmunológicos], junto con los resultados de los aperiódico” y profetizaba (en forma finalmente errónea, estudios realizados por electroforesis, ultracentrifuga- pero sugestiva) que, “si bien [la materia viva] no elude ción y espectroscopía ultravioleta indican que […] la frac- las ‘leyes de la física’ tal como están establecidas hasta la ción activa no contiene en forma demostrable proteína, fecha, probablemente implica ‘otras leyes físicas’ desco- lípido libre o polisacárido serológicamente reactivo, y nocidas hasta ahora”. consiste principal, si no exclusivamente, en una forma Sus ideas tuvieron el efecto de despertar en muchos altamente polimerizada y viscosa de ácido desoxirribo- el interés por el estudio molecular de los genes, en espe- nucleico”. cial en el físico inglés Francis Harry Compton Crick y el Estos resultados, que enfocaron decisivamente la aten- biólogo estadounidense James Dewey Watson. “Un fac- ción en el ADN, no fueron aceptados como definitivos pues tor importante que contribuyó a su abandono [de Crick] permanecía la posibilidad de que hubiera pequeñísimas de la física y al desarrollo de un acusado interés por la bio- 2 1 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 1 CIENCIAS71 JULIO SEPTIEMBRE 2003 3

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