Génomique comparative et alignement de séquences PDF
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G´enomique comparative et Alignement de s´equences biologiques Catherine Matias CNRS-LaboratoireStatistique&G´enome,E´vry E´tats de la Recherche de la SMF-oct 2009 Sommaire : Introduction `a la biologie mol´eculaire Partie II : Alignement par fonction de score Partie III : Alignement statistique Partie IV : Alignement multiple Premi`ere partie I Introduction `a la biologie mol´eculaire Sommaire : Introduction `a la biologie mol´eculaire Biologie mol´eculaire G´enomique comparative Alignement Repr´esentation graphique de l’alignement de deux s´equences Sommaire Biologie mol´eculaire G´enomique comparative Alignement Repr´esentation graphique de l’alignement de deux s´equences La cellule (avec ou sans noyau) L’information g´en´etique : les chromosomes Chez l’Homme, 22 paires de chromosomes plus une paire de chromosomes sexuels L’information g´en´etique : l’ADN Chez l’Homme, 3,4 milliards de paires de bases 4 bases diff´erentes : A,C, G et T Appariement C/G et A/T L’expression des g`enes Un g`ene = une petite unit´e d’ADN, qui code une prot´eine Au final I De nos jours, on est capables I de «s´equencer les g´enomes des organismes» I de connaˆıtre la s´equence d’une prot´eine I Les s´equences biologiques = soit des s´equences d’ADN, soit des s´equences d’acides amin´es I On ne sait rien sur la plupart des s´equences (fonction, structure...) I La g´enomique comparative consiste `a comparer une s´equence inconnue avec une base de donn´ees de s´equences connues pour tenter d’en tirer de l’information
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