Genes and Genomics PDF
Preview Genes and Genomics
ELSEVIER AAPPPPLLIIEEDD MMYYCCOOLLOOGGYY AANNDD BBIIOOTTEECCHHNNOOLLOOGGYY VVOOLLUUMMEE 55 GGEENNEESS AANNDD GGEENNOOMMIICCSS This Page is Intentionally Left Blank AAPPPPLLIIEEDD MMYYCCOOLLOOGGYY AANNDD BBIIOOTTEECCHHNNOOLLOOGGYY VVOOLLUUMMEE 55 GGEENNEESS AANNDD GGEENNOOMMIICCSS EEddiitteedd bbyy DDiilliipp KK.. AArroorraa CCeennttrree ooff AAddvvaanncceedd SSttuuddyy iinn BBoottaannyy BBaannaarraass HHiinndduu UUnniivveerrssiittyy VVaarraannaassii,, IInnddiiaa RRaannddyy MM.. BBeerrkkaa NNoovvoozzyymmeess BBiiootteecchh,, IInncc..,, 11444455 DDrreeww AAvveennuuee,, DDaavviiss,, CCAA 9955661166--44888800,, UUSSAA .- ELSEVIER 22000055 AAmmsstteerrddaamm –- BBoossttoonn –- HHeeiiddeellbbeerrgg –- LLoonnddoonn –- NNeeww YYoorrkk –- OOxxffoorrdd PPaarriiss –- SSaann DDiieeggoo –- SSaann FFrraanncciissccoo –- SSiinnggaappoorree –- SSyyddnneeyy –- TTookkyyoo EELLSSEEVVIIEERR BB..VV.. EELLSSEEVVIIEERR IInncc.. EELLSSEEVVIIEERR LLttdd.. EELLSSEEVVIIEERR LLttdd.. RRaaddaarrwweegg 2299 552255 BB SSttrreeeett,, SSuuiittee 11990000 TThhee BBoouulleevvaarrdd,, LLaannggffoorrdd LLaannee 8844 TThheeoobbaallddss RRooaadd PP..OO.. BBooxx 221111,, 11000000 AAEE AAmmsstteerrddaamm SSaann DDiieeggoo,, CCAA 9922110011--44449955 KKiiddlliinnggttoonn,, OOxxffoorrdd OOXX55 11GGBB LLoonnddoonn WWCC11XX 88RRRR TThhee NNeetthheerrllaannddss UUSSAA UUKK UUKK ©© 22000055 EEllsseevviieerr BB..VV.. AAllll rriigghhttss rreesseerrvveedd.. TThhiiss wwoorrkk iiss pprrootteecctteedd uunnddeerr ccooppyyrriigghhtt bbyy EEllsseevviieerr BB.. VV..,, aanndd tthhee ffoolllloowwiinngg tteerrmmss aanndd ccoonnddiittiioonnss aappppllyy ttoo iittss uussee:: PPhhoottooccooppyyiinngg SSiinnggllee pphhoottooccooppiieess ooff ssiinnggllee cchhaapptteerrss mmaayy bbee mmaaddee ffoorr ppeerrssoonnaall uussee aass aalllloowweedd bbyy nnaattiioonnaall ccooppyyrriigghhtt llaawwss.. PPeerrmmiissssiioonn ooff tthhee PPuubblliisshheerr aanndd ppaayymmeenntt ooff aa ffeeee iiss rreeqquuiirreedd ffoorr aallll ootthheerr pphhoottooccooppyyiinngg,, iinncclluuddiinngg mmuullttiippllee oorr ssyysstteemmaattiicc ccooppyyiinngg,, ccooppyyiinngg ffoorr aaddvveerrttiissiinngg oorr pprroommoottiioonnaall ppuurrppoosseess,, rreessaallee,, aanndd aallll ffoorrmmss oof fd dooccuummeenntt ddeelilviveerryy. . SSppeecciaiall rraatetess aarere a avvaailialabblele ffoorr eedduuccaattiioonnaall iinnssttiittuuttiioonnss tthhaatt wwiisshh ttoo mmaakkee pphhoottooccooppiieess ffoorr nnoonn--pprrooffiitt eedduuccaattiioonnaall ccllaassssrroooomm uussee.. PPeerrmmiissssiioonnss mmaayy bbee ssoouugghhtt ddiirreeccttllyy ffrroomm EEllsseevviieerr’'ss RRiigghhttss DDeeppaarrttmmeenntt iinn OOxxffoorrdd,, UUKK:: pphhoonnee ((++4444)) 11886655 884433883300,, ffaaxx ((++4444)) 11886655 885533333333,, ee--mmaaiill:: ppeerrmmiissssiioonnss@@eellsseevviieerr..ccoomm.. RReeqquueessttss mmaayy aallssoo bbee ccoommpplleetteedd oonn--lliinnee vviiaa tthhee EEllsseevviieerr hhoommeeppaaggee ((hhttttpp::////wwwwww..eellsseevviieerr..ccoomm//llooccaattee//ppeerrmmiissssiioonnss)).. IInn tthhee UUSSAA,, uusseerrss mmaayy cclleeaarr ppeerrmmiissssiioonnss aanndd mmaakkee ppaayymmeennttss tthhrroouugghh tthhee CCooppyyrriigghhtt CClleeaarraannccee CCeenntteerr,, IInncc..,, 222222 RRoosseewwoooodd DDrriivvee,, DDaannvveerrss,, MMAA 0011992233,, UUSSAA;; pphhoonnee:: ((++11)) ((997788)) 77550088440000,, ffaaxx:: ((++11)) ((997788)) 77550044774444,, aanndd iinn tthhee UUKK tthhrroouugghh tthhee CCooppyyrriigghhtt LLiicceennssiinngg AAggeennccyy RRaappiidd CClleeaarraannccee SSeerrvviiccee ((CCLLAARRCCSS)),, 9900 TTootttteennhhaamm CCoouurrtt RRooaadd,, LLoonnddoonn WW11PP 00LLPP,, UUKK;; pphhoonnee:: ((++4444)) 2200 77663311 55555555;; ffaaxx:: ((++4444)) 2200 77663311 55550000.. OOtthheerr ccoouunnttrriieess mmaayy hhaavvee aa llooccaall rreepprrooggrraapphhiicc rriigghhttss aaggeennccyy ffoorr ppaayymmeennttss.. DDeerriivvaattiivvee WWoorrkkss TTaabblleess ooff ccoonntteennttss mmaayy bbee rreepprroodduucceedd ffoorr iinntteerrnnaall cciirrccuullaattiioonn,, bbuutt ppeerrmmiissssiioonn ooff tthhee PPuubblliisshheerr iiss rreeqquuiirreedd ffoorr eexxtteerrnnaall rreessaallee oorr ddiissttrriibbuuttiioonn ooff ssuucchh mmaatteerriiaall.. PPeerrmmiissssiioonn ooff tthhee PPuubblliisshheerr iiss rreeqquuiirreedd ffoorr aallll ootthheerr ddeerriivvaattiivvee wwoorrkkss,, iinncclluuddiinngg ccoommppiillaattiioonnss aanndd ttrraannssllaattiioonnss.. EElleeccttrroonniicc SSttoorraaggee oorr UUssaaggee PPeerrmmiissssiioonn ooff tthhee PPuubblliisshheerr iiss rreeqquuiirreedd ttoo ssttoorree oorr uussee eelleeccttrroonniiccaallllyy aannyy mmaatteerriiaall ccoonnttaaiinneedd iinn tthhiiss wwoorrkk,, iinncclluuddiinngg aannyy cchhaapptteerr oorr ppaarrtt ooff a a cchhaapptteerr.. EExxcceepptt aass oouuttlliinneedd aabboovvee,, nnoo ppaarrtt ooff tthhiiss wwoorrkk mmaayy bbee rreepprroodduucceedd,, ssttoorreedd iinn aa rreettrriieevvaall ssyysstteemm oorr ttrraannssmmiitttteedd iinn aannyy ffoorrmm oorr bbyy aannyy mmeeaannss,, eelleeccttrroonniicc,, mmeecchhaanniiccaall,, pphhoottooccooppyyiinngg,, rreeccoorrddiinngg oorr ootthheerrwwiissee,, wwiitthhoouutt pprriioorr wwrriitttteenn ppeerrmmiissssiioonn ooff tthhee PPuubblliisshheerr.. AAddddrreessss ppeerrmmiissssiioonnss rreeqquueessttss ttoo:: EEllsseevviieerr’'ss RRiigghhttss DDeeppaarrttmmeenntt,, aatt tthhee ffaaxx aanndd ee--mmaaiill aaddddrreesssseess nnootteedd aabboovvee.. NNoottiiccee NNoo rreessppoonnssiibbiilliittyy iiss aassssuummeedd bbyy tthhee PPuubblliisshheerr ffoorr aannyy iinnjjuurryy aanndd//oorr ddaammaaggee ttoo ppeerrssoonnss oorr pprrooppeerrttyy aass aa mmaatttteerr ooff pprroodduuccttss lliiaabbiilliittyy,, nneegglliiggeennccee oorr ootthheerrwwiissee,, oorr ffrroomm aannyy uussee oorr ooppeerraattiioonn ooff aannyy mmeetthhooddss,, pprroodduuccttss,, iinnssttrruuccttiioonnss oorr iiddeeaass ccoonnttaaiinneedd iinn tthhee mmaatteerriiaall hheerreeiinn.. BBeeccaauussee ooff rraappiidd aaddvvaanncceess iinn tthhee mmeeddiiccaall sscciieenncceess,, iinn ppaarrttiiccuullaarr,, iinnddeeppeennddeenntt vveerriiffiiccaattiioonn ooff ddiiaaggnnoosseess aanndd ddrruugg ddoossaaggeess sshhoouulldd bbee mmaaddee.. FFiirrsstt eeddiittiioonn 22000055 LLiibbrraarryy ooff CCoonnggrreessss CCaattaallooggiinngg iinn PPuubblliiccaattiioonn DDaattaa AA ccaattaalloogg rreeccoorrdd iiss aavvaaiillaabbllee ffrroomm tthhee LLiibbrraarryy ooff CCoonnggrreessss.. BBrriittiisshh LLiibbrraarryy CCaattaalloogguuiinngg iinn PPuubblliiccaattiioonn DDaattaa AA ccaattaalloogguuee rreeccoorrdd iiss aavvaaiillaabbllee ffrroomm tthhee BBrriittiisshh LLiibbrraarryy.. IISSBBNN:: 00--444444--5511880088--88 @ TThhee ppaappeerr uusseedd iinn tthhiiss ppuubblliiccaattiioonn mmeeeettss tthhee rreeqquuiirreemmeennttss ooff AANNSSII//NNIISSOO ZZ3399..4488--11999922 ((PPeerrmmaanneennccee ooff PPaappeerr)).. PPrriinntteedd iinn TThhee NNeetthheerrllaannddss.. Working together to grow libraries in developing countries •ww.elsevier.com www.bookaid.org www.sabre.org ELSEVIER BOOK AID Sabre Foundation International v Editors Dilip K. Arora Centre of Advanced Study in Botany Banaras Hindu University Varanasi, 221005 India E-mail: [email protected] Randy M. Berka Novozymes Biotech, Inc. 1445 Drew Avenue Davis, CA 95616-4880, USA E-mail: [email protected] Editorial Board Frank Kcmpken Christian-Albrechts-Universitat zuKiel, Germany George G Khachatourians University of Saskatchewan, Canada B. Franz Lang Universite de Montreal, Canada Yong Hawn Lee Seoul National University, South Korea Brendan Loftus Eukaryotic Genomics, TIGR, USA Giuseppe Macino Molecolare Policlinico Umberto Roma Italy Gregory S. May Anderson Cancer Center, USA Mary Anne Nelson University of New Mexico, USA Helena Nevalainen Macquarie University, Australia Gary A. Payne North Carolina State University, U.S.A. Merja Penttila VTT Biotechnology, Finland R. Prade Okalhoma State Univesrity, USA Alberto Luis Rosa Instituto de Investigacion Medica, Argentina TsugeTakashi Nagoya University, Japan Johannes WBstemeyer Friedrich-Schiller-Universitaet Jena, Germany Oded Yarden The Hebrew Universtiy of Jerusalem, Israel Debbie Sue Yaver Novozymes Biotech, Inc., USA 'Present affiliation: National Bureau of Agriculturally Important Microorganisms, Kusmaur (Post: Kaithauli), Post Bag No. - 06, Mau Nath Bhanjan, Uttar Pradesh 275 101, INDIA This Page is Intentionally Left Blank vVilli Contents Editorial Board for Volume 5 v Contents vii-viii Contributors ix-xiv Preface xv-xvi Recombination in Filamentous Fungi 1 Frederick ]. Bowring, P. Jane Yeadon and David E. A. Catcheside EST Data Mining and Applications in Fungal Genomics 33 Peijun Zhang and Xiang ]ia Min Fungal Intervening Sequences 71 Stefanie Poggeler Gene Silencing as a Tool for the Identification of Gene 93 Function in Fungi Annette Pickford and Giuseppe Macino The DNA Damage Response of Filamentous Fungi: Novel 117 Features Associated with a Multicellular Lifestyle Camile P. Semighini, Gustavo H. Goldman and Steven D. Harris The cfp Genes (cfp-1 and cfp-2) of Neurospom crassa: A Tale 141 of a Bunch of Filaments, One Enzyme, and Two Genes Esteban D. Temporini, Hernan D. Folco and Alberto L.Rosa A Search for Developmental Gene Sequences in 169 the Genomes of Filamentous Fungi David Moore, Conor Walsh and Geoffrey D. Robson Applications of Fungal Site-specific Recombination as a Tool 189 in Biotechnology and Basic Biology Yuri Voziyanov, Ian Grainge and Makkuni Jayaram viii Vlll Heterologous Gene Expression in Filamentous Fungi: 211 A Holistic View Helena Nevalainen, Valentino Te'o, Merja Penttila and Tiina Pakula Expression and Engineering of Fungal Hydrophobins 239 Karin Scholtmeijer, Rick Rink, Harm ] Hektor and Han AB Wosten Genetic Regulation of Carotenoid Biosynthesis in Fungi 257 Johannes Wostemeyer, Anke Grunler, Christine Schimek and Kerstin Voigt Combination of Suppression Subtractive Hybridization and 275 Microarray Technologies to Enumerate Biomass - Induced Genes in the Cellulolytic Fungus Trichoderma reesei Elena V. Bashkirova, Michael W. Rey, and Randy M. Berka Genomics of Some Human Dimorphic Fungus 301 Andre Rodrigues Lopes, Luciano Angelo, Everaldo dos Reis Marques, Maria Helena de S. Goldman and Gustavo H. Goldman Phanerochaete chrysosporium Genomics 315 Luis F. Larrondo, Rafael Vicuna and Dan Cullen Genetics of Morphogenesis in Basidiomycetes 353 /. Stephen Horton, Guus Bakkeren, Steven J. Klosterman, Maria Garcia-Pedrajas and Scott E. Gold Keyword Index 423 iIxX Contributors Keietsu Abe Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University, 1-1 Tsutsumidori-Amamiyamachi Aoba-ku, Sendai, 981-8555, Japan. Luciano Angelo Faculdade de Ciencias Farmaceuticas de Ribeirao Preto, Universidade de Sao Paulo, Sao Paulo, Brazil. Kiyoshi Asia Computional Biology Research Center, Natl. Inst. Of Advanced Ind. Sci. and Technol (AIST), Aomi Frontier Building 17F, 2-43 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan. Guus Bakkeren Agriculture and Agri-food Canada, Pacific Agri-food Research Center, 4200 Highway 94, Summerland, B.C. Canada VOZ1Z0. Randy M. Berka Novozymes Biotech, Inc., 1445 Drew Avenue, Davis, California 95616-4880, USA. Elena V. Bashkirova Novozymes Biotech, Inc., 1445 Drew Avenue, Davis, California 95616-4880, USA. Frederick J. Bowring School of Biological Sciences, Flinders University, PO Box 2100, Adelaide, South Australia 5001. David E.A. Catcheside School of Biological Sciences, Flinders University, PO Box 2100, Adelaide, South Australia 5001. Dan Cullen USDA Forest Products Laboratory, Madison, Wisconsin 53705, USA.
Description:The list of books you might like
