forming bacteria

236 Pages·2017·3.85 MB·English

by  Apostolis Papathanasiou

ARISTOTLE UNIVERSITY OF THESSALONIKI
FACULTY OF AGRICULTURE, FORESTRY AND NATURAL ENVIRONMENT
SCHOOL OF AGRICULTURE
ΑΡΙΣΤΟΤΕΛΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ
ΣΧΟΛΗ ΓΕΩΠΟΝΙΑΣ, ΔΑΣΟΛΟΓΙΑΣ ΚΑΙ ΦΥΣΙΚΟΥ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ
ΤΜΗΜΑ ΓΕΩΠΟΝΙΑΣ

MYRSINI N. KAKAGIANNI
Biologist, MSc

ΜΥΡΣΙΝΗ Ν. ΚΑΚΑΓΙΑΝΝΗ
Πτυχιούχος Βιολόγος, MSc

Development and application of predictive models for the growth
of thermophilic spore - forming bacteria in foods

Ανάπτυξη και εφαρμογή μαθηματικών μοντέλων πρόβλεψης της
συμπεριφοράς θερμόφιλων σποριογόνων βακτηρίων στα τρόφιμα

PhD THESIS
ΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΗ ΔΙΑΤΡΙΒΗ

THESSALONIKI / 2018
ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗ / 2018
MYRSINI N. KAKAGIANNI
Biologist, MSc

Development and application of predictive models for
the growth of thermophilic spore - forming bacteria in foods

Ph.D. THESIS

Submitted at School of Agriculture of Aristotle University of Thessaloniki
DATE OF ORAL PRESENTATION: Friday 13 July 2018
THESIS COMMITTEE (Decision ΓΣΕΣ 122/01-06-2018):
FULL NAME LEVEL ROLE INSTITUTION
Konstantinos P. Aristotle University of
Professor Supervisor
Koutsoumanis Thessaloniki
Member of Three – Aristotle University of
Konstantinos Biliaderis Professor
member Committee Thessaloniki
Assistant Member of Three – Aristotle University of
Eugenios Katsanidis
Professor member Committee Thessaloniki
Agricultural University of
George – John Nychas Professor Member
Athens
Associate Aristotle University of
Apostolos S. Angelidis Member
Professor Thessaloniki
Associate Agricultural University of
Efstathios Panagou Member
Professor Athens
Assistant Aristotle University of
Athanasia Goula Member
Professor Thessaloniki
ΜΥΡΣΙΝΗ Ν. ΚΑΚΑΓΙΑΝΝΗ
Πτυχιούχος Βιολόγος, MSc

Ανάπτυξη και εφαρμογή μαθηματικών μοντέλων πρόβλεψης
της συμπεριφοράς θερμόφιλων σποριογόνων βακτηρίων στα
τρόφιμα

ΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΗ ΔΙΑΤΡΙΒΗ

Υποβλήθηκε στο Τμήμα Γεωπονίας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου
Θεσσαλονίκης
ΗΜΕΡΟΜΗΝΙΑ ΥΠΟΣΤΗΡΙΞΗΣ: Παρασκευή 13 Ιουλίου 2018
ΕΞΕΤΑΣΤΙΚΗ ΕΠΙΤΡΟΠΗ (Απόφαση ΓΣΕΣ 122/01-06-2018):
ΟΝΟΜΑΤΕΠΩΝΥΜΟ ΒΑΘΜΙΔΑ ΙΔΙΟΤΗΤΑ ΙΔΡΥΜΑ
Κωνσταντίνος Π. Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο
Καθηγητής Επιβλέπων
Κουτσουμανής Θεσσαλονίκης
Μέλος
Κωνσταντίνος Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο
Καθηγητής Τριμελούς
Μπιλιαδέρης Θεσσαλονίκης
Επιτροπής
Μέλος
Επίκουρος Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο
Ευγένιος Κατσανίδης Τριμελούς
Καθηγητής Θεσσαλονίκης
Επιτροπής
Γεώργιος – Ιωάννης Γεωπονικό Πανεπιστήμιο
Καθηγητής Μέλος
Νυχάς Αθηνών
Αναπληρωτής Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο
Απόστολος Σ. Αγγελίδης Μέλος
Καθηγητής Θεσσαλονίκης
Αναπληρωτής Γεωπονικό Πανεπιστήμιο
Ευστάθιος Πανάγου Μέλος
Καθηγητής Αθηνών
Επίκουρος Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο
Αθανασία Γούλα Μέλος
Καθηγήτρια Θεσσαλονίκης
© Myrsini N. Kakagianni, 2018
© PhD thesis, Aristotle University of Thessaloniki, Thessaloniki, Greece, 2018
Development and application of predictive models for the growth of
thermophilic spore - forming bacteria in foods
Ανάπτυξη και εφαρμογή μαθηματικών μοντέλων πρόβλεψης της συμπεριφοράς
θερμόφιλων σποριογόνων βακτηρίων στα τρόφιμα

ISBN

«Η έγκριση της παρούσης διδακτορικής διατριβής από το Τμήμα Γεωπονίας δεν
υποδηλώνει αποδοχή των γνωμών και απόψεων του συγγραφέως» (Ν.
5343/1932, άρθρο 202, παρ. 2)
Μέρος της παρούσας διατριβής υλοποιήθηκε στο πλαίσιο της Δράσης
«Συνεργασία» ΕΣΠΑ 2007 - 2013 και του προγράμματος Erasmus+ και
συγχρηματοδοτήθηκε από:
-Ευρωπαϊκή ΄Ενωση - Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο
-Γενική Γραμματεία Έρευνας και Τεχνολογίας

στον Αποστόλη και το Νικόλα

Ευχαριστίες
Αρχικά, θα ήθελα να εκφράσω τη βαθύτατη ευγνωμοσύνη μου στον κ.
Κωνσταντίνο Κουτσουμανή για την πολύτιμη καθοδήγηση και τη συνεχή στήριξή
του κατά τη διάρκεια όλων αυτών των ετών. Τον ευχαριστώ θερμά για το χρόνο, τις
ιδέες και την εμπιστοσύνη που έδειξε στο πρόσωπό μου δίνοντάς μου την ευκαιρία
να συνεχίσω τις πανεπιστημιακές μου σπουδές με την εκπόνηση της διδακτορικής
αυτής μελέτης και να εξελιχθώ ως ερευνήτρια. Τον ευχαριστώ, επίσης, που μου
έμαθε τη σημασία της συνεργασίας των επιστημών αλλά και τη μετάδοση της
γνώσης από γενιά σε γενιά προκειμένου να είμαστε σε θέση να προβούμε σε
αξιόλογα αποτελέσματα. Θεωρώ τον εαυτό μου τυχερό που ήμουν ένα από τα μέλη
της ερευνητικής του ομάδας καθώς μου μετέδωσε πολλές και πλούσιες γνώσεις στο
χώρο της Ποσοτικής Μικροβιολογίας.
Επίσης, θα ήθελα να ευχαριστήσω όλα τα μέλη της εξεταστικής μου επιτροπής,
τους καθηγητές κ. Κωνσταντίνο Μπιλιαδέρη, κ. Ευγένιο Κατσανίδη, κ. Γεώργιο –
Ιωάννη Νυχά, κ. Ευστάθιο Πανάγου, κ. Απόστολο Αγγελίδη και κα. Αθανασία Γούλα,
που αξιολόγησαν αυτή τη διατριβή και ενήργησαν ως «αντίπαλοι» κατά την
υπεράσπισή της.
Θα ήθελα να εκφράσω τις θερμές μου ευχαριστίες στο Βασίλη Βαλδραμίδη, Αν.
Καθηγητή του Πανεπιστημίου της Μάλτας, για την εμπιστοσύνη του και την
ευκαιρία που μου έδωσε να υλοποιήσω ένα μικρό μέρος της διδακτορικής αυτής
μελέτης, υπό την επίβλεψή του, στο εργαστήριό του. Εκτιμώ βαθιά την εξαίρετη
συνεργασία μας, την πολύτιμη καθοδήγησή του και την ανιδιοτελή μετάδοση των
γνώσεών του στο αντικείμενο της ποσοτικής μικροβιολογίας.
Ιδιαίτερες ευχαριστίες θα ήθελα να εκφράσω στο δάσκαλό μου κ. Μηνά
Γιάγκου για την εμπιστοσύνη που έδειξε στο πρόσωπό μου και την ευκαιρία που
μου έδωσε να γνωρίσω τον κόσμο της Ανοσοβιολογίας. Έπαιξε καθοριστικό ρόλο
στη ζωή μου καθώς ήταν ο άνθρωπος που μετά από συζητήσεις με παρότρυνε να
συνεχίσω τις μεταπτυχιακές μου σπουδές εξερευνώντας το χώρο των τροφίμων.
Ένα μεγάλο ευχαριστώ οφείλω στους συναδέλφους, συνεργάτες και
συμφοιτητές, συμπεριλαμβανομένων και των προπτυχιακών φοιτητών (Φωτεινή
Μπόμπολα, Φανή Τσίνα, Αγγελική Χωραΐτη, Χριστίνα Νταμπούδη, Όλια
Χαρισμιάδου, Μαρία Ρέπα, Μαίρη Τσιλφίδου και Μαρία Παπακρασά), για τη
βοήθεια και ουσιαστική συμβολή τους καθ’ όλη τη διάρκεια της διδακτορικής
διατριβής. Την ιδιαίτερη ευγνωμοσύνη και αγάπη μου θα ήθελα να εκφράσω στη
Μαίρη Γουγουλή, για την άριστη συνεργασία και την αμέριστη βοήθεια
οποτεδήποτε της ζήτησα, και τη Δάφνη Δημακοπούλου – Παπάζογλου, για τη
σημαντική συμβολή της σε παρατηρήσεις και διορθώσεις της παρούσας
διδακτορικής διατριβής, τη φιλία και συμπαράστασή της όλα αυτά τα χρόνια, ενώ
παράλληλα μαζί με την Αλεξία Λιανού, Ζάφη Ασπρίδου, και Ζαχαρένια Ζαμπουλάκη
ζήσαμε αξέχαστες στιγμές, όμορφες και δύσκολες, δημιουργώντας ένα ιδανικό
κλίμα συνεργασίας, δημιουργικότητας και σκληρής δουλειάς. Είστε πλέον
αναπόσπαστο κομμάτι της καρδιάς μου.
Ιδιαιτέρως θα ήθελα να ευχαριστήσω τους φίλους μου Δημήτρη Βασιλείου για
την καθοριστική βοήθειά του όσον αφορά τη συλλογή των θερμοκρασιακών
δεδομένων καθώς και την Ελένη Νάστα για την επιμέλεια του εξωφύλλου της
συγκεκριμένης διατριβής.
Τέλος, ένα μεγάλο ευχαριστώ θα ήθελα να εκφράσω στον Αποστόλη μου για
τις διορθώσεις του στην παρούσα διδακτορική διατριβή, την αγάπη, την
υποστήριξη και την υπομονή του όλα αυτά τα χρόνια, ενώ πάρα πολλές φορές με
βοήθησε να επαναπροσδιορίσω τις προτεραιότητές μου. Είμαι παντοτινά
ευγνώμων στους γονείς μου, Μαίρη και Νίκο, αλλά και την αδερφή μου, Βίκυ, για
την αγάπη τους, τη συνεχή και ανεξάντλητη συμπαράσταση και υποστήριξη σε κάθε
μου απόφαση όλα τα χρόνια των σπουδών μου.
Μυρσίνη