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Diagnóstico de paludismo por Plasmodium Vivax utilizando secuencias repetitivas de ADN ... PDF

258 Pages·2012·3.68 MB·Spanish
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Tesis de Posgrado DDiiaaggnnóóssttiiccoo ddee ppaalluuddiissmmoo ppoorr PPllaassmmooddiiuumm VViivvaaxx uuttiilliizzaannddoo sseeccuueenncciiaass rreeppeettiittiivvaass ddee AADDNN ppaarraassiittaarriioo Carnevale, Silvana 2002 Tesis presentada para obtener el grado de Doctor en Ciencias Biológicas de la Universidad de Buenos Aires Este documento forma parte de la colección de tesis doctorales y de maestría de la Biblioteca Central Dr. Luis Federico Leloir, disponible en digital.bl.fcen.uba.ar. Su utilización debe ser acompañada por la cita bibliográfica con reconocimiento de la fuente. This document is part of the doctoral theses collection of the Central Library Dr. Luis Federico Leloir, available in digital.bl.fcen.uba.ar. It should be used accompanied by the corresponding citation acknowledging the source. Cita tipo APA: Carnevale, Silvana. (2002). Diagnóstico de paludismo por Plasmodium Vivax utilizando secuencias repetitivas de ADN parasitario. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_3490_Carnevale.pdf Cita tipo Chicago: Carnevale, Silvana. "Diagnóstico de paludismo por Plasmodium Vivax utilizando secuencias repetitivas de ADN parasitario". Tesis de Doctor. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2002. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_3490_Carnevale.pdf DDiirreecccciióónn:: Biblioteca Central Dr. Luis F. Leloir, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires. CCoonnttaaccttoo:: [email protected] Intendente Güiraldes 2160 - C1428EGA - Tel. (++54 +11) 4789-9293 i .. É. a"fl .. .- - 4*.:‘.:'E. w m att 1 mia-um. 5.111111: n un un)» Diagnóstico de Paludismo por Plasmodium vívax utilizando secuencias repetitivas de ADN parasitario Lic. Silvana Carnevale TESIS PARAOPTAR AL TÍTULO DE DOCTOR DE LA UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES Director: Dr.Sergio OscarAngel BuenosAires,Argentina Agosto de 2002 Jim-en­ Resumen La malaria es unproblema de salud pública mundial en másde 100paises habitados por un total de 2.400 millones de personas, representando el 40% de la población mundial. Las cuatro especies más comunes que infectan al hombre son:Plasmoa'ium vivax,P.falciparum, P. malariae yP. ovale, de las cuales, las dos primeras, representan el 95% de las infecciones. En Argentina se plantea la necesidad de trabajar sobre P. vr'vax,pues no se han registrado casos autóctonos depaludismoporP.falciparum. El propósito de este estudio fue disponer de herramientas moleculares para la detección de P. vivax, aplicables a muestras humanas y vectores, adaptables a las condiciones de recolección y procesamiento básico disponibles en lasbases operativas del Programa Nacional de Paludismo. Para ello se obtuvieron y caracterizaron secuencias repetitivas de ADN de P. vivax. El fragmento clonado (instlO) resultó en un tamaño de 6.899 pb y presentó varias repeticiones directas en tandem y un elemento repetitivo del tipo disperso. Este fragmento incluyó la secuencia específica de P. vivax, instlO-ll, de 75 pb, que fue empleada como sonda en el desarrollo de la técnica de Dot blot, y la secuencia instE/C, dentro de la cual se diseñó el blanco de reacción de PCR. Desde el punto de vista del diagnóstico individual, las técnicas de PCR-sangre e instlO-l l-Dot blot demostraronservaliosaspara emplearsecomo métodosen el diagnóstico de pacientes sintomáticos y asintomáticos, incluyendo aquellos que retoman de una zona endémica de infecciones causadas por P. vr'vax,ypara el seguimiento de pacientes. Desde la perspectiva epidemiológica la técnica de PCR-elutorios desarrollada en este trabajo permitió efectuar el diagnóstico específico de la especie P. vivax en pacientes sintomáticos y asintomáticos, lo que facilitaría su uso en acciones de detección por búsqueda pasiva y activa. Por otro lado, el método de PCR aplicado a vectores mostró ser una de las pocas alternativas disponibles de alta sensibilidad y especificidad para la detección de P. vivax en mosquitos experimental y naturalmente infectados, con condiciones prácticas de conservación de muestras. Las técnicas desarrolladas en este trabajo son de utilidad para el manejo debrotes yepidemias yacontribuyen a ladetección del aumento de la tasa de infección en mosquitos, al estudio de las migraciones y la vigilancia de la quimiorresistencia. El trabajo realizado se enmarca como un desarrollo local de herramientas diagnósticas aplicables al control del paludismo en Argentina. Palabras claves: paludismo, Plasmodium vivax, diagnóstico, vigilancia, control de vectores, manejo clínico, secuencias de ADN repetitivas Abstract Malaria is a public health problem in more than one hundred countries, meaning that 40% (2,400 million) of the world’s total population is exposed to malaria n'sk. The four common species that infect humans are Plasmodium vivax, P. falciparum, P. malariae y P. ovaIe, and the two first ones represent 95% of infections. In Argentina it is necessary to work onP. vivax,because there are not localcases of malaria due toP.falciparum. The purposeofthis studywasto have disposal of molecular tools forthe detection of P. vivax, that could be applied to human and mosquito samples, and adapted to the basic conditions of collection and processing available at the operating settings of the National Malaria Programme. Inthis way we obtained and characterized repetitive sequences ofP. vivax DNA. The cloned fragment (instlO) resulted in a molecular size of 6,899 bp, with several tandem direct repeats and a repetitive interspersed element. This fragment included the instlO-ll P. vivax-specificsequence(75 bp), employedas probe for the development of the Dotblottechnique,andthe instE/C sequence,insidewhichthe PCRtarget wasdesigned. At the individual level, the PCR-blood and instlO-l l-Dot blot demonstrated to be valuable methods for the diagnosis of symptomatic and asymptomatic patients, including those retuming fromP. vr'vaxendemic areas, and for management of cases. Atthe epidemiological level,the technique of PCR-blood impregnated filter paper disks developed in this work allowed the specific diagnosis of P. vivax in symptomatic and asymptomatic patients. This fact could facilitate its use in active and passive surveillance. The PCRmethodologyapplied to malaria vectors showedto be oneofthe fewavailable altematives of high sensitivity and specificity for the detection of P. vivaxin experimentally and naturally infected mosquitoes, with practical conditions for sample storage. The techniques developed in this work are useful for management of outbreaks and epidemics, as they contribute to the detection of increased infection ratios in mosquitoes, to the study of migrations, and to the surveillance of drug resistance. This work can be described as a local development of diagnostic tools that can be applied to malaria control inArgentina. Key words: malaria, Plasmodium vivax, diagnosis, surveillance, vector control, clinical management, repetitive sequences of DNA. A mi mamá AJorge —Agradecimientos ­ Agradecimientos Al Dr. Hernando del Portillo, del Instituto de Ciencias Biomédicas IIde la Universidad de Sao Paulo, por su contribución en la provisión de genotecas, plásmidos, filtros, y por sus aportes en eldiseño deexperimentos e interpretación de resultados. Al Dr. Jorge Velásquez, del Hospital Municipal de Infecciosas “Dr. Francisco J. Muñiz”, por su valiosa colaboración en la interpretación clínica de resultados, discusión y redacción deeste trabajo y suconstante incentivo. Al Dr. Sergio Angel, investigador del CONICET, por sus valiosos aportes en todos los estudios moleculares. Al Dr. Eduardo Guamera, jefe del Departamento de Parasitología del INEI, ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán”, por darme la posibilidad de realizar esta Tesis en mi lugar de trabajo y por ayudarme en lacolección de muestras enáreas endémicas. A los Dres. Rolando Boffi y Roberto Chuit, que en 1994-1995, desde la Dirección de Epidemiología del Ministerio de Salud, me facilitaron los medios para la recolección de muestras en elNoroeste Argentino. Al Dr. Enrique Bellegarde, del Hospital Municipal de Infecciosas Francisco J. Muñiz”, por su esfuerzo en la provisión de muestras ydatos de loscontroles utilizados. Al Dr. Mario Zaidenberg,jefe del Programa Nacional de Paludismo, por la información brindada sobre losantecedentes yactual situación del paludismo en laArgentina. Al Dr. Néstor Taranto, del Hospital San Vicente de Paul de Orán, por su atención, esfuerzos y facilidades de laboratorio que recibiera durante mis tareas en dicha ciudad. Al Dr. Nicanor Sosa, que en 1994 se desempeñara como director del Hospital de Yrigoyen, por sucooperación en labúsqueda decasos en lazona fronteriza yen Bermejo. Al Dr. Nicolás Schweigmann, por la provisión de muestras controles negativas de mosquitos ypor colección demuestras enterreno. Al Dr.Raúl Franco, por su colaboración en eldesarrollo de lastécnicas moleculares. A todo el personal del Programa Nacional de Paludismo, particularmente a quienes se desempeñan y desempeñaron en la Base Operativa de Orán, por su apoyo constante en la obtención de muestras humanas yde mosquitos, incluyendo suclasificación taxonómica. -Agradecimientos­ A los Vianconi, padre e hijo, de la Base Operativa de Orán, por facilitarme las condiciones para eltrabajo en terreno. A losagentes sanitarios de APS Salta, por su participación en la identificación de casos. A los pacientes del NOA, por recibirrne en sus hogares. Al Dr. José Bento, del Instituto Militar de Río de Janeiro, por su contribución en muestras controles positivas de mosquitos. Al Dr. Claudio Ribeiro, de FIOCRUZ, por sus sugerencias y aportes sobre técnicas moleculares. A la Dra. Regina Amendoeira, del Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, por su constante incentivo a la realización de este trabajo ypor sus innumerables contribuciones. Al Dr. Líen Kuo, por la realización de diapositivas de muestras dePlasmodium. A mis compañeros del Departamento, por sus diferentes contribuciones en la ejecución de este trabajo. A Marta Cabrera, por su incansable ayuda en todas las actividades de laboratorio de esta tesis, ypor sus valiosos aportes en el diagnóstico etiológico de paludismo. A Jorge Labbé, por su participación desde el inicio en la labor experimental y las discusiones técnicas. A Mónica Rodríguez, por sus aportes en la observación microscópica y la realización de extracciones de ADN de mosquitos. A Marcela Ferella, Octavio Fusco y Juan Manuel Centeno, por su participación en la secuenciación automática de fragmentos de ADN. Ya mi mamá, portodo su cariño e incentivo en larealización de esta Tesis. -Publicach ­ Publicaciones Velásquez JN, Camevale S,Guamera EA, Labbé JH, Chertcoff A,Cabrera MG, Rodríguez MI. 1996. Detection of the microsporidian parasite Enterocytozoon bieneusi in specimens from patients with AIDS by PCR. Journal of Clinical Microbiology3423230­ 3232. Velásquez JN, Camevale S, Cortí M, dí Rísío C, Bramajo J, Pinto M, Labbé JH, Chencoff A, CabreraM,RodríguezM,Guamera EA. 1997.Estrategias clásicas para el diagnóstico de Criptosporidiosis en pacientes con SIDAy diarrea crónica. ActaGastroenterológica Latinoamericana 27:107-1ll. Velásquez JN, dí Rísío C, Camevale S, Corti M, Benetuccí J, Bozzíni JP, Cabrera M, Chertcoff A, Labbé JH, Rodríguez M, Besasso H, Guamera EA. 1997. Estudio morfológicodeEnterocytozoonbieneusi en pacientes con SIDAy diarrea crónica. Acta Gastroenterológíca Latinoamericana 27:241-245. Velásquez JN, Camevale S, Labbé JH, Chertcoff A, Cabrera M, Oelemann W. 1999. In situ hybridization: a molecular approach for the diagnosis of the microsporidian parasite Enterocytozoon bieneusi. HumanPathology30:54-58. Velásquez JN, Camevale S, Bessaso H, Bramajo J, Kuo L, Faimboim H. 2000. Identicación de Enterocytozoon bleneusi en un paciente con colangitis esclerosante y SIDA. Acta Gastroenterológica Latinoamericana 30247-51. Oelemann W, Velásquez JN, Camevale S, Bessaso H, Teixeira MGM, Peralta JM. 2000. Intestinal Chagas' disease in patients with AIDS.AIDS 14:9-10. Camevale S, Velásquez JN, Labbé JH, Chencoff A, Cabrera MG, Rodríguez MI. 2000. DiagnosisofEnterocytozoonbieneusi by PCR in stool samples eluted from filter paper disks. Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology 7:504-506. Velásquez JN, Oelemann W, Camevale S, Bessaso H, Etchait C, Cabrera MG, Pinto ME, Labbé JH, Kuo LH, Peralta JM. 2000. Trypanosoma cruzí en SIDA: Localización gastrointestinal y mecanismos alternativos de transmisión. Revista del Hospital Nacional Baldomero Sommer 327-18. -Publicacions­ Camevale S, Rodríguez M, Santillán G, Labbé J, Cabrera M, Bellegarde E, Velásquez J, Trgovcic J, Guamera E. 2001. Immunodiagnosis of human fascioliasis by an enzyme­ linked immunosorbent assay (ELISA) and a Micro-ELISA. Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology 8:174-l77. Camevale S, Rodriguez MI, Guamera EA, Carmona C, Tanos T, Angel S. 2001. Immunodiagnosis of fasciolosisusing recombinant procathepsin L cystein proteinase. Diagnostic Microbiology and Infectious Diseases 41:43-49 Velásquez JN, Camevale S, Mariano M, Kuo LH, Caballero A, Chertcoff A, Ibáñez C, Bozzini JP. 2001. Isosporosis and unizoite tissue cysts in patients with acquired immune deficiency syndrome. HumanPathology32:500-505. -Participaciones oficiales­ Participaciones oficiales I Participación en la Comisión Asesora encargada de la normatización del área Parasitosis, por citación de laDirección de Programas y Servicios de Atención de la Salud en uso de las facultades que leotorga el Art. 5de la Resolución Ministerial N°411/99. l999-actual. I Participación en la elaboración de la Guía de Prevención, Procedimiento, Diagnóstico y Tratamiento en Parasitosis (Resolución 898/2001 del Ministerio de Salud), para el Programa Nacional de Garantía de la Atención Médica del Ministerio de Salud de la Nación. Publicada en Boletin Oficial de la República Argentina N° 29734, 18/09/2001, Suplemento.

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Tesis presentada para obtener el grado de Doctor en Ciencias . At the epidemiological level, the technique of PCR-blood impregnated filter paper disks This fact could facilitate its use in active and passive surveillance. habitantes de las regiones pantanosas de Egipto han dejado registros que
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