Bioinformatique des puces à ADN et application à l'analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola

328 Pages·2016·19.59 MB·French

by  Nancie Reymond

Bioinformatique des puces à ADN et application à
l’analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola
Nancie Reymond
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Nancie Reymond. Bioinformatique des puces à ADN et application à l’analyse du transcriptome de
Buchnera aphidicola. Sciences du Vivant [q-bio]. Migration - université en cours d’affectation, 2004.
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HAL Id: tel-00008630
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N° d’ordre 04 ISAL 0100
Année 2004
Thèse
Bioinformatique des puces à ADN et
application à l’analyse du
transcriptome de Buchnera
aphidicola
Présentée devant
L’institut national des sciences appliquées de Lyon
Pour obtenir
Le grade de docteur
Formation doctorale
Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques
Bioinformatique
École doctorale Évolution, Écosystèmes, Microbiologie, Modélisation
(E2M2)
Par
Nancie Reymond
(Ingénieur)
Soutenue le 16 décembre 2004 devant la Commission d’examen
Jury MM.
H. Charles Maître de Conférences (INSA de Lyon) – Directeur
J.-M. Fayard Professeur (INSA de Lyon) – Directeur
G. Febvay Directeur de Recherches (INRA)
C. Gautier Professeur (UCBL) – Président
M.-C. Potier Chargée de Recherches (CNRS) – Rapporteur
D. Tagu Directeur de Recherches (INRA) – Rapporteur
A. Trubuil Ingénieur de Recherches (INRA)

Écoles Doctorales
Écoles Doctorales
CHIMIE DE LYON
Responsable : M. Denis SINOU
Université Claude Bernard Lyon 1
Lab Synthèse Asymétrique UMR UCB/CNRS 5622
Bât 308
2ème étage
43 bd du 11 novembre 1918
69622 VILLEURBANNE Cedex
Tél : [phone]
[email protected]
ECONOMIE, ESPACE ET MODELISATION
DES COMPORTEMENTS (E2MC)
Responsable : M. Alain BONNAFOUS
Université Lyon 2
14 avenue Berthelot
MRASH
Laboratoire d’Economie des Transports
69363 LYON Cedex 07
Tél : [phone]
[email protected]
3
Écoles Doctorales
ELECTRONIQUE, ELECTROTECHNIQUE,
AUTOMATIQUE (EEA)
Responsable : M. Daniel BARBIER
INSA DE LYON
Laboratoire Physique de la Matière
Bâtiment Blaise Pascal
69621 VILLEURBANNE Cedex
Tél : [phone]
[email protected]
EVOLUTION, ECOSYSTEMES,
MICROBIOLOGIE, MODELISATION
(E2M2)
http://biomserv.univ-lyon1.fr/E2M2
Responsable : M. Jean-Pierre FLANDROIS
UMR 5558 Biométrie et Biologie Evolutive
Equipe Dynamique des Populations Bactériennes
Faculté de Médecine Lyon-Sud Laboratoire de Bactériologie BP 12
69600 OULLINS
Tél : [phone]
[email protected]
INFORMATIQUE ET INFORMATION POUR
LA SOCIETE (EDIIS)
http://www.insa-lyon.fr/ediis
Responsable : M. Lionel BRUNIE
INSA DE LYON
EDIIS
Bâtiment Blaise Pascal
69621 VILLEURBANNE Cedex
Tél : [phone]
[email protected]
4
Écoles Doctorales
INTERDISCIPLINAIRE SCIENCES-SANTE
(EDISS)
http://www.ibcp.fr/ediss
Responsable : M. Alain Jean COZZONE
IBCP (UCBL1)
7 passage du Vercors
69367 LYON Cedex 07
Tél : [phone]
[email protected]
MATERIAUX DE LYON
http://www.ec-lyon.fr/sites/edml
Responsable : M. Jacques JOSEPH
Ecole Centrale de Lyon
Bât F7 Lab. Sciences et Techniques des Matériaux et des Surfaces
36 Avenue Guy de Collongue BP 163
69131 ECULLY Cedex
Tél : [phone]
[email protected]
MATHEMATIQUES ET INFORMATIQUE
FONDAMENTALE (Math IF)
http://www.ens-lyon.fr/MathIS
Responsable : M. Franck WAGNER
Université Claude Bernard Lyon1
Institut Girard Desargues
UMR 5028 MATHEMATIQUES
Bâtiment Doyen Jean Braconnier
Bureau 101 Bis, 1er étage
69622 VILLEURBANNE Cedex
Tél : [phone]
[email protected]
5
Écoles Doctorales
MECANIQUE, ENERGETIQUE, GENIE
CIVIL, ACOUSTIQUE (MEGA)
http://www.lmfa.ec-lyon.fr/autres/MEGA/index.html
Responsable : M. François SIDOROFF
Ecole Centrale de Lyon
Lab. Tribologie et Dynamique des Systêmes Bât G8
36 avenue Guy de Collongue
BP 163
69131 ECULLY Cedex
Tél :[phone]
[email protected]
6
Professeurs
Novembre 2003
INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES
APPLIQUEES DE LYON
Directeur : STORCK A.
Professeurs
AMGHAR Y. LIRIS
AUDISIO S. PHYSICOCHIMIE INDUSTRIELLE
BABOT D. CONT. NON DESTR. PAR RAYONNE-
MENTS IONISANTS
BABOUX J.C. GEMPPM***
BALLAND B. PHYSIQUE DE LA MATIERE
BAPTISTE P. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES
SYSTEMES MANUFACTURIERS
BARBIER D. PHYSIQUE DE LA MATIERE
BASKURT A. LIRIS
BASTIDE J.P. LAEPSI****
BAYADA G. MECANIQUE DES CONTACTS
BENADDA B. LAEPSI****
BETEMPS M. AUTOMATIQUE INDUSTRIELLE
BIENNIER F. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES
SYSTEMES MANUFACTURIERS
BLANCHARD J.M. LAEPSI****
BOISSE P. LAMCOS
BOISSON C. VIBRATIONS-ACOUSTIQUE
BOIVIN M. (Prof. émérite) MECANIQUE DES SOLIDES
BOTTA H. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL -
Développement Urbain
7
Professeurs
BOTTA-ZIMMERMANN M. (Mme) UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL -
Développement Urbain
BOULAYE G. (Prof. émérite) INFORMATIQUE
BOYER J.C. MECANIQUE DES SOLIDES
BRAU J. CENTRE DE THERMIQUE DE LYON -
Thermique du bâtiment
BREMOND G. PHYSIQUE DE LA MATIERE
BRISSAUD M. GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRI-
CITE
BRUNET M. MECANIQUE DES SOLIDES
BRUNIE L. INGENIERIE DES SYSTEMES
D’INFORMATION
BUFFIERE J-Y. GEMPPM***
BUREAU J.C. CEGELY*
CAMPAGNE J-P. PRISMA
CAVAILLE J.Y. GEMPPM***
CHAMPAGNE J-Y. LMFA
CHANTE J.P. CEGELY*- Composants de puissance et
applications
CHOCAT B. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL -
Hydrologie urbaine
COMBESCURE A. MECANIQUE DES CONTACTS
COURBON GEMPPM
COUSIN M. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL -
Structures
DAUMAS F. (Mme) CENTRE DE THERMIQUE DE LYON -
Energétique et Thermique
DJERAN-MAIGRE I. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL
DOUTHEAU A. CHIMIE ORGANIQUE
DUBUY-MASSARD N. ESCHIL
DUFOUR R. MECANIQUE DES STRUCTURES
DUPUY J.C. PHYSIQUE DE LA MATIERE
EMPTOZ H. RECONNAISSANCE DE FORMES ET VI-
SION
ESNOUF C. GEMPPM***
EYRAUD L. (Prof. émérite) GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRI-
CITE
FANTOZZI G. GEMPPM***
FAVREL J. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES
SYSTEMES MANUFACTURIERS
8
Professeurs
FAYARD J.M. BIOLOGIE FONCTIONNELLE, INSECTES
ET INTERACTIONS
FAYET M. (Prof. émérite) MECANIQUE DES SOLIDES
FAZEKAS A. GEMPPM
FERRARIS-BESSO G. MECANIQUE DES STRUCTURES
FLAMAND L. MECANIQUE DES CONTACTS
FLEURY E. CITI
FLORY A. INGENIERIE DES SYSTEMES
D’INFORMATIONS
FOUGERES R. GEMPPM***
FOUQUET F. GEMPPM***
FRECON L. (Prof. émérite) REGROUPEMENT DES ENSEIGNANTS
CHERCHEURS ISOLES
GERARD J.F. INGENIERIE DES MATERIAUX POLYME-
RES
GERMAIN P. LAEPSI****
GIMENEZ G. CREATIS**
GOBIN P.F. (Prof. émérite) GEMPPM***
GONNARD P. GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRI-
CITE
GONTRAND M. PHYSIQUE DE LA MATIERE
GOUTTE R. (Prof. émérite) CREATIS**
GOUJON L. GEMPPM***
GOURDON R. LAEPSI****.
GRANGE G. (Prof. émérite) GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRI-
CITE
GUENIN G. GEMPPM***
GUICHARDANT M. BIOCHIMIE ET PHARMACOLOGIE
GUILLOT G. PHYSIQUE DE LA MATIERE
GUINET A. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES
SYSTEMES MANUFACTURIERS
GUYADER J.L. VIBRATIONS-ACOUSTIQUE
GUYOMAR D. GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRI-
CITE
HEIBIG A. MATHEMATIQUE APPLIQUEES DE LYON
JACQUET-RICHARDET G. MECANIQUE DES STRUCTURES
JAYET Y. GEMPPM***
JOLION J.M. RECONNAISSANCE DE FORMES ET VI-
SION
JULLIEN J.F. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL
- Structures
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