ARCAD plateaux technologiques Laboratoire ADN PDF
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ARCAD plateaux technologiques Laboratoire ADN -Laboratoire de purification de l’ADN à haut débit – Banque d’ADN -Laboratoire de séquençage et génotypage Responsables Sylvain SANTONI, UMR AGAP INRA Montpellier Pierre MOURNET, UMR AGAP CIRAD Montpellier 1 ARCAD plateaux technologiques Molécule d’ADN, support de l’information génétique, rendue accessible pour des Purification de l’ADN analyses de génotypage et séquençage Purification de l’ADN de plante « à l’ancienne » 2 ARCAD plateaux technologiques Molécule d’ADN, support de l’information génétique, rendue accessible pour des Purification de l’ADN analyses de génotypage et séquençage Analyses génétiques réalisées sur de grandes populations de plantes - Etudes de la diversité génétique d’une espèce - Programme d’amélioration des plantes Besoin de procédures et de protocoles compatibles avec l’analyse de plusieurs milliers de plantes Organisation d’un laboratoire pour des analyses à haut débit. Unité de base : 96 échantillons 3 ARCAD plateaux technologiques Purification de l’ADN Poste d’ingénieur, CDD de 20 mois Michael Bourgeois Organisation d’un laboratoire spécialisé dans la purification des ADN de plantes Capable de traiter des milliers d’échantillons - Extraction/purification - Contrôles, qualité et quantité - Gestion des échantillons et traçabilité des opérations -Pour un usage immédiat en génotypage -Stockage sécurisé, DNA bank : ressources d’échanges de matériels génétique 4 ARCAD plateaux technologiques Purification de l’ADN Maîtrise des protocoles biochimiques de purification des ADN de plante Capture de l’ADN sur de la silice Utilisation de billes métalliques magnétiques 5 ARCAD plateaux technologiques Purification de l’ADN Robotique dédiée à la purification des ADN sur silice/bille magnétique Format 96 échantillons 2 heures de traitement Tète 96 ou 24 aimants Déplacement de billes magnétique 2 KingFisher installés 6 ARCAD plateaux Robotique dédiée à la purification de l’ADN pour des séries importantes d’échantillons technologiques Purification de l’ADN Type LGC Oktopure Tète 96 pipettes 8 positions magnétiques 8 plaques 96 simultanément Appel d’offre en cours Installation prévue début 2015 7 ARCAD plateaux Robotique de pipetage à usage universelle, haut débit, haute performance technologiques Purification de l’ADN Type Beckman FX Tête 96 pipettes + 8 canaux indépendants Soutien / manipulation des ADN - Dosage - Ajustement de concentrations - Etc Appel d’offre en cours Installation prévue début 2015 ARCAD plateaux technologiques Purification de l’ADN Qualification/quantification des ADN purifiés Bioanalyser 96 échantillons Type Caliper GX Appel d’offre en cours Installation prévue fin 2014 9 ARCAD plateaux technologiques Purification de l’ADN Qualification/quantification des ADN purifiés P01 4 P02 P03 3.5 P04 P05 3 P06 P07 2.5 P08 P09 2 P10 P11 1.5 P12 P13 1 P14 P16 P18 0.5 P20 0 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 -0.5 Spectrophotomètre/fluorimètre Type Infinite 200 Tecan Achat prévu en 2015 10
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