Andrzej Marszałek Instalacja i konfiguracja pakietu do obliczeń struktur elektronowych WIEN2k

44 Pages·2012·1.97 MB·Polish

AKADEMIA PEDAGOGICZNA
IM. KOMISJI EDUKACJI NARODOWEJ
W KRAKOWIE
INSTYTUT FIZYKI
Kierunek: Fizyka komputerowa
Andrzej Marsza“ek
Instalacja i kon(cid:12)guracja pakietu do
oblicze« struktur elektronowych
WIEN2k
Praca licencjacka napisana
w Zak“adzie Spektroskopii Mo(cid:127)ssbauerowskiej
pod kierunkiem dr in». Artura B“achowskiego
Krak(cid:243)w2005
Spis tre–ci
1. Instalacja systemu Linuks Gentoo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.1. Wstƒp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.2. Kon(cid:12)guracja sprzƒtowa serwera elektron. . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3. Przygotowanie doinstalacji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.4. Instalacja Gentoo naserwerze elektron . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4.1. Kon(cid:12)guracja sieci . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4.2. Partycjonowanie dysku . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4.3. System plik(cid:243)w . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.4.4. Instalacja Stage’a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.4.5. Instalacja Portage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.4.6. Zmiana –rodowiska, pierwsze kroki w nowym –rodowisku /
chroot, rsync . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1.4.7. Parametry optymalizuj¡ce, (cid:13)agi USE . . . . . . . . . . . . . . 5
1.4.8. stage1 ->stage2 ->stage3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.4.9. Kon(cid:12)gurowanie j¡dra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
1.4.10. Kon(cid:12)gurowanie systemu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
1.4.11. I... reboot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2. Instalacja, kon(cid:12)guracja i u»ytkowanie pakietu WIEN2k . . . . . . . 10
2.1. Wstƒp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.2. Kr(cid:243)tki wstƒp teoretyczny . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.3. Biblioteki numeryczne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.4. Kompilatory . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.5. Kompilacja oraz instalacja pakietu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
2.6. U»ytkowanie pakietuWIEN2k . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
2.7. Skryptstartowy WIEN2k . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
2.8. Opis dokumentacji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
3. Przyk“adowe obliczenia dla TiC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
3.1. Wstƒp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
3.2. Uruchomienie WIEN2k . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
3.3. Logowanie i utworzenie sesji obliczeniowej . . . . . . . . . . . . . . . . 18
3.4. Generowanie strukturykryszta“u . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5. Inicjalizacja oblicze« . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
3.6. Obliczenia samouzgodnione (SCF) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
3.7. Wykresygƒsto–ci elektronowej . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
3.7.1. Wykres3D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
3.7.2. Wykreskonturowy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
3.8. Gƒsto–¢ stan(cid:243)w elektronowych (DOS) . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
3.9. Obliczenia w“asno–ci optycznych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
3.10. Widmo promieniowania rentgenowskiego . . . . . . . . . . . . . . . . 35
3.11. Obliczenia widm w oparciu o spektroskopiƒ na krawƒdzi absorpcji . . 36
3.12. Obliczenia strukturypasmowej . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Spis tablic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
Spis rysunk(cid:243)w . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Bibliogra(cid:12)a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Streszczenie
W pracy tej prezentujƒ pakiet do oblicze« struktur elektronowych WIEN2k.
Zwyklesytuacjaprzedstawiasiƒtak,»eAdministratorsystemuLinuksproszony
jestprzezFizykaoinstalacjƒpakietu.Fizykmo»emie¢problemyzprzygotowa-
niem –rodowiska do instalacji, Administrator natomiast ze sprawdzeniem, czy
wszystko zainstalowa“ poprawnie. Oczywi–cie w ko«cu dojd¡ do porozumienia,
ale zajmie im to trochƒ czasu. Mam nadziejƒ, »e moja praca pomo»e zar(cid:243)wno
Fizykowi jak i Administratorowi, skr(cid:243)ci czas instalacji i kon(cid:12)guracji WIEN2k,
umo»liwiaj¡c Fizykowi komfortow¡pracƒ.
W rozdziale 1. przeprowadzam instalacjƒ zoptymalizowanego –rodowiska li-
nuksowego na przyk“adzie dystrybucji Gentoo. Pokazujƒ zalety tej dystrybucji,
wskazujƒ najbardziej odpowiednie parametry optymalizacji zar(cid:243)wno systemu
jaki pakietuobliczeniowego.Rozdzia“2.po–wiƒci“empakietowiWIEN2k, prze-
prowadzaj¡c u»ytkownika krok po kroku przez proces kompilacji i instalacji,
wyja–niam powody ustawienia poszczeg(cid:243)lnych parametr(cid:243)w. W rozdziale 3. za-
prezentowa“empodrƒcznikowyprzyk“ad oblicze« dla zwi¡zku TiC. Skoncentro-
wa“em siƒ g“(cid:243)wnie na prezentacji wygodnego i “atwego w obs“udze, gra(cid:12)cznego
interfejsu u»ytkownika, dostƒpnego z poziomu dowolnej przegl¡darki WWW.
Omawiaj¡c poszczeg(cid:243)lne etapy wprowadzania danych, oblicze« oraz otrzyma-
nych danych, zobrazowa“emje w ob(cid:12)ty spos(cid:243)b zrzutami ekran(cid:243)w z prawdziwej
sesji obliczeniowej.
Pe“n¡ instalacjƒ Gentoo i WIEN2k przeprowadzi“em na serwerze elektron,
udostƒpnionymmiprzezZak“adSpektroskopiiMo(cid:127)ssbauerowskiej,jednostkƒAka-
demii Pedagogicznejw Krakowie.
1. Instalacja systemu Linuks Gentoo
1.1. Wstƒp
Jedn¡ z charakterystycznych cech systemu Linuks Gentoo
[1] jest to, »e w trakcie instalacji i u»ytkowania mo»na w
prosty spos(cid:243)b optymalizowa¢ kompilacjƒ wszystkich pakie-
t(cid:243)w, dziƒki czemu otrzymujemy produkt stabilny, wydajny i
przystosowanydo naszych potrzeb.
Praktycznie ca“y system mo»e by¢ przekompilowany w czasie instalowania,
dziƒki czemu jest on bardzo dobrze dopasowanydo posiadanej przez nas archi-
tektury sprzƒtowej, kon(cid:12)gurowalny zgodnie z naszymi preferencjami a przede
wszystkim jest szybki i stabilny. Oczywi–cie w celu przeprowadzenia instalacji
powinni–my posiada¢ wydajny sprzƒt oraz dostƒp do sieci Internet (chocia» nie
jest to niezbƒdne).
W chwili obecnej, Gentoo mo»na instalowa¢ na maszynach posiadaj¡cych
procesory z rodziny x86, AMD64, PowerPC, UltraSparc, Alpha oraz MIPS.
Pakiety
Kolejn¡ wa»n¡ zalet¡ systemu Gentoo jest system pakiet(cid:243)w (Portage) [2].
Ich(cid:12)lozo(cid:12)azosta“aopartanaimplementacjiport(cid:243)w(ports)zrodzinysystem(cid:243)w
*BSD. Programy s¡ grupowane w kategoriach (np. app-antivirus, sys-cluster,
sys-kernel),natomiastwpodkatalogachkategorii(nosz¡cychnazwyprogram(cid:243)w,
np.clamav,lam-mpi,vanilla-sources)znajduj¡siƒplikizinformacjaminatemat
miejsca dostƒpu „r(cid:243)de“ programu, sposobu kon(cid:12)guracji, parametr(cid:243)w kompila-
cji a tak»e miejsca docelowej instalacji. Czƒsto dostƒpne s¡ r(cid:243)wnolegle kolejne
wersje program(cid:243)w, pozostawiaj¡c u»ytkownikowi wyb(cid:243)r w kwestii instalacji
(wersja nowsza lub starsza, ale sprawdzona, stabilna, np. aktualnie, m.in., do-
stƒpne s¡ wersje „r(cid:243)de“ kernela vanilla-sources-2.6.12.5, vanilla-sources-2.6.13,
vanilla-sources-2.6.14 rc1).
Instalacjƒ pakietu wykonuje siƒ poprzez wydanie polecenia
emerge nazwa-pakietu
Polecenie emerge automatycznie –ci¡gnie, przekompiluje i zainstaluje pakiet
oraz, je–li zaistnia“a taka potrzeba, pakiety pomocnicze.
Grupaludziodpowiedzialnazautrzymaniedrzewapakiet(cid:243)w,ca“yczasaktu-
alizuje,rozwijaidodajenowepakiety,wzale»no–ciodtego,jakczƒstopojawiaj¡
siƒ nowe wersje oprogramowania. W ka»dej chwili, maj¡c dostƒp do Internetu,
mo»na zaktualizowa¢drzewo pakiet(cid:243)w (polecenie emerge sync). We wrze–niu
2005 roku liczba dostƒpnych w portach program(cid:243)w przekroczy“a 10000 w 143
kategoriach.
Flagi USE
Inn¡zzaletGentoo jestdu»akon(cid:12)gurowalno–¢tejdystrybucji.To,»ebazuje
ona na „r(cid:243)d“ach program(cid:243)w, daje u»ytkownikowi pe“n¡ kontrolƒ nad zestawem
opcji wkompilowywanych w instalowane aplikacje. Sterowanie tym, co ma siƒ
instalowa¢ a co nie w naszym systemie, kontroluje siƒ poprzez zmienn¡ USE z
pliku /etc/make.conf. Np. ustawienia
USE="-X atlas bcmath mysql nls"
oznaczaj¡, w kolejno–ci
1
| nie instaluj bibliotek i program(cid:243)w zwi¡zanych ze –rodowiskiem gra(cid:12)cznym
X11
| u»yj bibliotek atlas zamiast blas
| u»yj libbcmath, je–li aplikacja mo»e jej potrzebowa¢
| wkompiluj bibliotekƒ w programy,kt(cid:243)re mog¡ obs“ugiwa¢ MySQLa
| dodaj obs“ugƒ jƒzyk(cid:243)w narodowychw aplikacjach, kt(cid:243)re na to pozwalaj¡
W chwili obecnej dostƒpnych jest ponad 350 standardowych (cid:13)ag [3].
1.2. Kon(cid:12)guracja sprzƒtowa serwera elektron.
Kon(cid:12)guracjasprzƒtowa serweraelektron przedstawia siƒ nastƒpuj¡co:
| 2 x Pentium Xeon 2.8 GHz
| RAM 4 GiB RAM
| HDD 160 GiB ATA
| p“yta g“(cid:243)wna posiada zintegrowan¡ kartƒ gigabitow¡, stumegabitow¡ oraz
gra(cid:12)kƒ.
Rysunek1.1: Serwer elektron
Serwer znajduje siƒ w Zak“adzie Spektroskopii Mo(cid:127)ssbauerowskiej Akademii
Pedagogicznejw Krakowie[4].
1.3. Przygotowanie do instalacji
Gentoo mo»na zainstalowa¢ na wiele sposob(cid:243)w. Instalacji mo»na dokona¢
z p“ytki Gentoo LiveCD, p“ytek innych dystrybucji linuksa, z dowolnej, zain-
stalowanej ju» dystrybucji, z PXE, z dyskietki. Mo»liwo–ci jest wiele, spos(cid:243)b
instalacji zale»y od tego, jakie mamy mo»liwo–ci techniczne lub... preferencje.
W tym przypadku, instalacjƒ przeprowadzi“em standardowo[5], –ci¡gaj¡c z
jednego z dostƒpnych serwer(cid:243)w
http://www.gentoo.org/main/en/mirrors.xml
obraz ISO dystrybucji, wypalaj¡c go na p“ytce CD i startuj¡c proces instalacji
z tej w“a–nie p“ytki.
Przy instalacji Gentoo mo»na utworzy¢ system za pomoc¡ jednego z trzech
tarballi, z u»yciem tzw. stage’y. Ka»dy z nich, to skompresowane archiwum
zawieraj¡ceminimalne –rodowiskopracy.
| stage1 - zawiera wy“¡cznie kompilator, Portageoraz programy,bez kt(cid:243)rych
narzƒdzia te nie mog“yby pracowa¢. Pozwala na pe“n¡ kontrolƒ nad kon(cid:12)-
guracj¡ i optymalizacj¡ systemu, jest odpowiedni dla do–wiadczonych u»yt-
kownik(cid:243)w.
2
| stage2 -zawieraspakowanysystem,wkt(cid:243)rymmo»naprzyst¡pi¢dobudowy
innychniezbƒdnychnarzƒdzisystemowych.Minusemjestto,»etrzebazaak-
ceptowa¢ domy–lne ustawienia optymalizacji dla podstawowegosystemu.
| stage3 - zawiera prekompilowany system podstawowy, kt(cid:243)ry jest niemal w
pe“ni przygotowany do pracy. Brakuje mu jedynie kilku program(cid:243)w, kt(cid:243)re
ka»dy u»ytkownik musi wybra¢ i zainstalowa¢ samodzielnie. Niestety, nie
mo»na poprawia¢ systemu podstawowego- jest prekompilowany.
Z wy»ej wymienionych powod(cid:243)w, instalacjƒ przeprowadza“emze stage1.
1.4. Instalacja Gentoo na serwerze elektron
Domy–lnym edytorem plik(cid:243)w w gentoo jest program nano, np.
nano -w /etc/conf.d/net
Opis parametr(cid:243)w obs“ugi nano znajduje siƒ w dw(cid:243)ch najni»szych liniach po
wywo“aniu programu.
1.4.1. Kon(cid:12)guracja sieci
W pliku /etc/conf.d/net wpisa“em parametry kon(cid:12)guracyjne sieci dla ser-
wera elektron:
iface eth0="149.156.26.96netmask 255.255.255.0"
gateway="eth0/149.156.26.1"
oraz w pliku /etc/resolv.conf
nameserver 149.156.24.24
domain ap.krakow.pl
Uaktywnienie sieci wykona“em poleceniem
/etc/init.d/net.eth0 start
1.4.2. Partycjonowanie dysku
Partycje zosta“y podzielone w nastƒpuj¡cy spos(cid:243)b:
Partycja Montowanie System plik(cid:243)w Rozmiar Opis
/dev/hda1 swap swap 4 GB Partycja wymiany
/dev/hda2 / reiserfs 30 GB Partycja g“(cid:243)wna
/dev/hda3 /home reiserfs 120 GB Katalogi domowe u»ytkownik(cid:243)w
Tablica 1.1: Partycje dyskowe
Daneu»ytkownik(cid:243)wbƒd¡zajmowa“ynajwiƒcejmiejsca,dlategote»partycja
katalog(cid:243)w domowych zajmuje 75% dostƒpnej przestrzeni dyskowej. Do party-
cjonowania dysku u»y“em standardowegonarzƒdzia fdisk:
fdisk /dev/hda
ustawiaj¡c wielko–ci partycji zgodnie z powy»sz¡ tabel¡.
3
1.4.3. System plik(cid:243)w
Jako g“(cid:243)wny system plik(cid:243)w wybra“em ReiserFS [6]. Z moich do–wiadcze«
wynika, »e sprawuje sie on –wietnie zar(cid:243)wno na komputerach domowego prze-
znaczenia jak i serwerach wymagaj¡cychkrytycznego dostƒpu do danych. Przy
wielu ma“ych plikach ReiserFS mo»e by¢ szybszy od ext3 nawet piƒtnastokrot-
nie. ReiserFS jest wysoce skalowalnyi posiada ksiƒgowanie[7]. Charakteryzuje
go niezawodno–¢ oraz u»yteczno–¢ zar(cid:243)wnona partycjach og(cid:243)lnegoprzeznacze-
nia jakiwekstremalnychprzypadkach,takichjakogromne,terabajtoweparty-
cje. Poprawniesprawujesiƒ tak»e przy operacjachna katalogachzawieraj¡cych
dziesi¡tki i setki tysiƒcy plik(cid:243)w, tak»e operuj¡c na wielu bardzo ma“ych lub
bardzo du»ych plikach
W kolejnych krokach wykona“em nastƒpuj¡ce czynno–ci:
| Utworzenie partycji:
mkswap /dev/hda1
mkreiserfs -q /dev/hda2
mkreiserfs -q /dev/hda3
| Aktywacja partycji wymiany:
swapon /dev/hda1
| Montowanie partycji:
mount /dev/hda2 /mnt/gentoo
mkdir /mnt/gentoo/home
mount /dev/hda3 /mnt/gentoo/home
1.4.4. Instalacja Stage’a
Stage dostƒpne s¡ w katalogu /mnt/cdrom/stages na p“ytce instalacyjnej.
W celu poprawnej jego instalacji wykona“em kroki (w chwili pisania tej pracy,
najnowszym wydaniem by“ Gentoo 2005.1):
cd /mnt/gentoo
tar -xvjpf /mnt/cdrom/stages/stage1-x86-2005.1.tar.bz2
chmod 0755 /mnt/gentoo
W czasie kilkudziesiƒciu sekund nast¡pi“o rozpakowanie podstawy systemu, co
mo»na by“o obserwowa¢na bie»¡co na konsoli.
Stage mo»na tak»e pobra¢ z mirror(cid:243)w,np.
wget http://ftp.belnet.be/mirror/rsync.gentoo.org/n
gentoo/releases/x86/current/stages/x86/stage1-x86-2005.1.tar.bz2
i post¡pi¢ jak wy»ej.
1.4.5. Instalacja Portage
Porty dostƒpne s¡ na ka»dym z mirror(cid:243)w Gentoo (ja wybra“em BelNet), w
katalogu snapshots. W celu instalacji Portage post¡pi“em nastƒpuj¡co:
cd /mnt/gentoo
wget http://ftp.belnet.be/mirror/rsync.gentoo.org/n
gentoo/snapshots/portage-latest.tar.bz2
tar-xvjf/mnt/gentoo/portage-latest.tar.bz2-C/mnt/gentoo/usr
4
1.4.6. Zmiana –rodowiska, pierwsze kroki w nowym –rodowisku /
chroot, rsync
Tu» przed wej–ciem do –rodowiska nowej instalacji, nale»a“o przekopiowa¢
plik ustawie«
cp -L /etc/resolv.conf /mnt/gentoo/etc/resolv.conf
cp -L /etc/conf.d/net /mnt/gentoo/etc/net
oraz zamontowa¢system plik(cid:243)w /proc
mount -t proc none /mnt/gentoo/proc
Gdywszystkiepartycjezosta“yza“o»one,apodstawowe–rodowisko(stage1)za-
instalowane,nadszed“ czaswej–ciaw nie, poprzezchroot. Oznaczato przej–cie
z systemu „r(cid:243)d“a instalacyjnego do systemu instalowanego.
chroot /mnt/gentoo /bin/bash
env-update
source /etc/pro(cid:12)le
Po zako«czeniu operacji wej–cia do nowego–rodowiska wykona“em polecenie
emerge sync
w celu zaktualizowaniadrzewa Portage.
1.4.7. Parametry optymalizuj¡ce, (cid:13)agi USE
Dokona“em wyboru pro(cid:12)lu systemu. Dostƒpne pro(cid:12)le mo»na podgl¡dn¡¢
ls -lsa /usr/portage/pro(cid:12)les/default-linux/x86/
iwybra¢najnowszy(umnieby“topro(cid:12)l2005.1),poprzezutworzeniedowi¡zania
symbolicznego
ln-snf/usr/portage/pro(cid:12)les/default-linux/x86/2005.1/etc/make.pro(cid:12)le
Falgi USE mo»emy wylistowa¢poleceniem
less /usr/portage/pro(cid:12)les/use.desc
a ustawia¢ je nale»y w pliku /etc/make.conf
nano -w /etc/make.conf
Serwerelektron,opr(cid:243)czzada«obliczeniowych,mia“tak»espe“nia¢rolƒterminala
gra(cid:12)cznego,gdzie bƒdzie mo»na np. przegl¡dn¡¢dokumentacjƒ w formaciepdf,
wykona¢ backup na no–nikach DVD, czy wys“a¢ plik na drukarkƒ. Wybranym
–rodowiskiem gra(cid:12)cznym sta“ siƒ Gnome, jako kompromis miƒdzy szybko–ci¡
dzia“ania a prostot¡ obs“ugi.
Ustawienia (cid:13)ag USE [3]
USE="gnomeX gtk2 alsa ssl nptlnptlonly gtk gtk2 network mysql hal
howl -qt -kde"
W tym samym pliku poprawi“em lub doda“em wpisy:
CHOST="i686-pc-linux-gnu"
CFLAGS="-O2 -pipe -march=pentium4"
MAKEOPTS ="-j2"
PORTAGE NICENESS ="19"
Zmienna CFLAGS i CXXFLAGS de(cid:12)niuj¡ »¡dane (cid:13)agi dla kompilacji kodu C
i C++,zmiennaCHOST zawierainformacjƒoho–cienakt(cid:243)rymbudowanyjest
program.
Wzale»no–ciodarchitektury,nakt(cid:243)rejinstalujemy,ograniczaj¡csiƒdotych
najbardziejpopularnych,mamynastƒpuj¡cywyb(cid:243)rustawie«(cid:13)agiCHOST oraz
parametru -march:
5
Host ((cid:13)aga CHOST) Rodzina procesor(cid:243)w
i386-pc-linux-gnu Intel 80386DX
i486-pc-linux-gnu Intel 80486DX
i586-pc-linux-gnu Intel PI, AMD K5/K6/K6-II/K6-III,VIA C3 , IDT Winchip
i686-pc-linux-gnu Intel PII/III/IV, AMD Duron/Sempron/Athlon-XP
x86 64-pc-linux-gnu Intel EM64T, AMD Athlon64/Opteron
Tablica 1.2: Rodzinyprocesor(cid:243)w i(cid:13)aga CHOST
Architektura (parametr -march) Procesor
i386 Intel 80386DX+
i486 Intel 80486DX+
i586, pentium Intel Pentium I (bez MMX) i AMD K5
pentium-mmx Intel Pentium I (z MMX)
i686, pentiumpro Intel Pentium Pro
pentium2 Intel Pentium II, Celeron ’Mendocino’
pentium3, pentium3m Intel Pentium III, Mobile, Celeron ’Coppermine’
pentium-m Intel Centrino
pentium4, pentium4m Intel Pentium IV, Celeron ’Willamette’
prescott Intel Pentium IV, Celeron ’Prescott’
nocona Intel Xeon ’Nocona’ i Pentium4 z EM64T
k6 AMD K6
k6-2, k6-3 AMD K6-II, K6-III
athlon, athlon-tbird AMD Athlon, Athlon ’Thunderbird’
athlon-4, athlon-xp, athlon-mp AMD Athlon4, Sempron/AthlonXP, Athlon MP
athlon64, athlon-fx, opteron AMD Athlon64, AthlonFX, Opteron
winchip-c6 IDT Winchip ’C6’
winchip2 IDT Winchip II
c3 VIA C3
c3-2 VIA C3 II
Tablica 1.4: Architekturaserwera iparametr -march
Nale»yzwr(cid:243)ci¢uwagƒ,»ewprzypadkub“ƒdnychustawie«parametru-march,
kompilacja mo»e zosta¢ przerwanaz powodu pr(cid:243)by inicjalizacji polece« z opty-
malizacjami rozkaz(cid:243)wnie obs“ugiwanychprzez procesor.
1.4.8. stage1 -> stage2 -> stage3
stage1->stage2
Kompilacjasystemuodpodstaw,pomimoistotnychzalet,majedn¡wadƒ:trwa“a
2-3 godziny. Na tym etapie bƒd¡ budowane biblioteki GNU C, zestaw kompila-
tor(cid:243)w GNU i kilka innych niezbƒdnych do stworzenia systemu program(cid:243)w. W
celu wykonania tzw. bootstrapu systemu, wykona“em nastƒpuj¡ce polecenia:
cd /usr/portage
scripts/bootstrap.sh
Przyk“adowypocz¡tekprocesubootstrap mo»nazobaczy¢naponi»szymobrazie:
6
Rysunek1.2: Proces bootstrap
Poprzerwaniuprocesubootstrap,np.przezu»ytkownikalubzpowoduwyst¡-
pieniab“ƒdu,niejeste–myzmuszenidorozpoczynaniaca“egoprocesukompilacji
od nowa. Ponowne uruchomienia skryptu spowoduje kontynuacjƒ budowania
systemu od miejsca, w kt(cid:243)rym zosta“a ona przerwana.
Po jego zako«czeniu przeszed“em do kolejnego etapu.
stage2->stage3
Na tym etapie kompiluj¡ i instaluj¡ siƒ programy, co do kt(cid:243)rych nie mamy
mo»liwo–ci wyboru a s¡ one niezbƒdne do pe“nego dzia“ania systemu. Niekt(cid:243)re
programy maj¡ kilka alternatyw (np. programy loguj¡ce) i te programymusia-
“em zainstalowa¢samodzielnie. Pozosta“e(ponad 90 pakiet(cid:243)w)zainstalowa“em,
wydaj¡c polecenia:
emerge -u portage
emerge {emptytree system
Jesttonajd“u»szyetapkompilacji,trwa“kilkana–ciegodzin.Pojegozako«czeniu
nale»a“o ustawi¢ strefƒ czasow¡.Do wyboru mia“em:
ls /usr/share/zoneinfo
Serwer elektron instalowany jest w Polsce, w zwi¡zku z tym ustawi“em strefƒ
czasow¡Poland, robi¡c dowi¡zanie symboliczne
ln -sf /usr/share/zoneinfo/Poland /etc/localtime
1.4.9. Kon(cid:12)gurowanie j¡dra
Maj¡c skompilowany i zainstalowany prawie ca“y system, nale»a“o jeszcze
zainstalowa¢ jego najwa»niejsz¡ czƒ–¢: j¡dra systemu. J¡dro Linuks jest ser-
cem ka»dej dystrybucji i stanowi interfejs pomiƒdzy programami u»ytkownika,
a sprzƒtem. W Portach (/usr/portage/sys-kernel) jest do wyboru kilkana–cie
odmian j¡dra (kernela) dla architektury x86, ale dla mnie najwa»niejsze by“y
dwie: vanilla-sources oraz gentoo-sources. Pierwszy z nich jest tzw. \czystym"
j¡drem, przygotowywanymprzez deweloper(cid:243)w j¡dra [8] a pozbawionym popra-
wek z zewn¡trz. Jest to j¡dro dla ka»dego systemu, stabilne i przetestowane.
Gentoo-sources, s¡ to oryginalne „r(cid:243)d“a j¡dra z poprawkami zwiƒkszaj¡cymi
wydajno–¢.Przedewszystkim zawszewartosprawdzi¢,jak dzia“asystem z tym
j¡drem a w razie wyst¡pienia problem(cid:243)w, zainstalowa¢vanilla.
Kon(cid:12)guracja j¡dra nie jest prost¡ spraw¡ i niezaawansowanemu u»ytkow-
nikowi mo»e sprawi¢ problemy. Na szczƒ–cie deweloperzy Gentoo przygotowali,
dla mniej bieg“ych u»ytkownik(cid:243)w, skrypt dokonuj¡cy kon(cid:12)guracji, kompilacji i
instalacji j¡dra. Skrypt o nazwie genkernel, nale»a“o najpierw zainstalowa¢
7