rapport d'activite 2015

277 Pages·2017·3.68 MB·French

Institut Pasteur d’Algérie Rapport d’Activité 2015

Institut Pasteur d’Algérie

RAPPORT D’ACTIVITE 2015

Route du Petit Staouéli, Dély-Brahim, Alger – Algérie
Tél. : [phone] – Fax: [phone]
Site web: www.pasteur.dz
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Institut Pasteur d’Algérie Rapport d’Activité 2015

Responsable de la Publication
Pr. Kamal KEZZAL

Responsable de la Rédaction
Pr. Fatma BACHI

Coordinatrice
Mme Fadila BOUCIF

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Sommaire

ACTIVITES DE LA DIRECTION DES LABORATOIRES, DE LA RECHERCHE ET DU
DEVELOPPEMENT

Département de Bactériologie
 Laboratoire de Bactériologie Médicale et de Surveillance de la Résistance aux
antibiotiques…………………………………………………………………………………………………………..07
 Laboratoire de la Tuberculose, des Mycobactéries et de Surveillance de la Résistance
aux Antituberculeux…………………………………………………………………………………………….....20
 Laboratoire de Bactériologie des Aliments, des Eaux et de l’Environnement……………..29
 Laboratoire des Entérobactéries et autres Bactéries Apparentées…………………………….42
 Laboratoire des Bactéries Anaérobies et du Botulisme……………………………………………..54
Département de Virologie
 Laboratoire de V.I.H. et Rétrovirus…………………………………………………………………………..63
 Laboratoire Grippe et autres Virus Respiratoires……………………………………………………..72
 Laboratoire des Virus des Hépatites………………………………………………………………………...77
 Laboratoire des Entérovirus………………………………..…………………………………………….........84
 Laboratoire des Virus de la Rougeole des Oreillons et de la Rubéole………………………….89
 Laboratoire des Arbovirus et Virus Emergents…………………………………………………...........92
 Laboratoire Virus et Oncogènes………………………………………………………………………………100
 Laboratoire Herpesvirus, Papillomavirus et autres…………………………………………….........107
Département d’Immunologie
 Laboratoire d’Immunochimie et Neuro-immunologie………………………………………….….113
 Laboratoire d’Immunogénétique et Transplantation……………………………………………….125
 Laboratoire d’Auto-immunité………………………………………………………………………………....133
 Laboratoire d’Immunologie Cellulaire……………………………………………………………………..145
Département de Parasitologie
 Laboratoire de Mycologie Médicale……………………………………………………………………......151
 Laboratoire de Biologie Parasitaire………………………………………………………………………..156
 Laboratoire d’Eco-épidémiologie Parasitaire et Génétique des Populations……………..170
Département de Microbiologie et Pathologie Vétérinaire
 Laboratoire de BactériologieVétérinaire….………………………….………………………………….185
 Laboratoire de Virologie Vétérinaire………………………………………………………………………193
 Laboratoire d’Anatomie de Cytologie Pathologiques Vétérinaires…………………………….198
Département de Médecine Préventive et d’Analyses Médicales
 Centre de Prélèvement…………………………………………………………………………………………..206
 Centre de Vaccination………………………………………………………………………………………….....211
 Centre de Médecine Préventive……………………………………………………………………………....216
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Département de Contrôle des Produits Biologiques…………………………………………………….221
 Laboratoire Technico-Reglementaire…………………………………………………………….……….222
 Laboratoire de Contrôle de Qualite………………………………………………………………………….225
ACTVITES DE LA DIRECTION DE PRODUCTION
Département Produits Biologiques Humains
 Laboratoire Vaccins Bactériens………………………………………………………………………………238
 Laboratoire Sérums Thérapeutiques………………………………………………………………………247
Département Produits Biologiques Vétérinaire
 Laboratoire de Production des Vaccins Viraux Vétérinaire………………………………………251
 Laboratoire Vaccins et Sérums Antirabiques………………………………………………………......253
Département Réactifs de Laboratoires
 Laboratoire des milieux de culture et réactifs de diagnostics ……………………………………256
Département de Mise Sous Forme Pharmaceutique…………………………………………………….260
Département Animalerie
 Laboratoire Petits Animaux………………………………………………………………………………………265
 Laboratoire Grands Animaux…………………………………………………………………………………….268
Direction Technique Production………………………………………………………………………………..271
ABREVIATIONS…………………………………………………………………………………………………………..276

Services et Laboratoires de Recherche / Diagnostic

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ACTIVITES de la DIRECTION des
LABORATOIRES, de la RECHERCHE et
du DEVELOPPEMENT

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DEPARTEMENT BACTERIOLOGIE
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LABORATOIRE DE BACTERIOLOGIE MEDICALE ET DE LA
SURVEILLANCE DE LA RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES
Chef de Laboratoire : Hassiba TALI-MAAMAR (Ph./M.A./Faculté de Médecine
d’Alger)

PRESENTATION DU LABORATOIRE
Le Laboratoire de Bactériologie Médicale et de Surveillance de la Résistance aux
antibiotiques, est organisé, depuis 2014, en 4 unités intitulées comme suite : Méningites et
bactériémies, Infections respiratoires bactériennes, Infections sexuellement transmissibles
bactériennes et Bactéries Multi-résistantes. A travers ces différentes unités, le laboratoire
assure les activités suivantes :
- Activité de référence, elle consiste en la surveillance épidémiologique avec typage
des espèces bactériennes responsables de maladies à déclaration obligatoire
(MDO), dont la coqueluche, la diphtérie, la méningite purulente (méningocoque,
pneumocoque et Haemophilus), Chlamydia trachomatis, Legionella pneumophila et
Brucellose.
- Activité d’expertise, pour la confirmation rapide des épidémies, y compris lors
d’enquêtes autour de cas d’infections hospitalières liées aux soins.
- Activité de recherche, liée essentiellement à l’étude des nouveaux mécanismes de
résistance, génotypage des bactéries par séquençage des souches.
- Activité de formation. Le laboratoire assure la formation des résidents en sciences
médicales (microbiologie et biologie clinique), durant leur cursus, ainsi que celles des
stagiaires en biologie et en sciences vétérinaires.
Le laboratoire de Bactériologie Médicale et de Surveillance de la Résistance aux
antibiotiques, est fondateur du réseau de laboratoires AARN (Algerian Antimicrobial
Resistance Network) www.sante.dz/aarn dont il assure la coordination et la formation
continue.

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I –ACTIVITE DE DIAGNOSTIC
a) Diagnostic bactériologique : (BOUHERAOUA S. – DJEDJIG F. – AOUDIA M. -
BOUHERAOUA M. – TAHRAT N. – LAZIZI S. LAZRI M. – LAFER O. – HASNAOUI S.)

 Nombre total de prélèvements reçus année 2015:

stnemevèlérP senirU serutlucoméH RCL sreviD xuanigaV .P xuartérU .P erutlucomrepS ACPD egroG lasaN noitarotcepxE elliero’d suP sertuA stnemevèlérp seriotaripser latoT
Total 454 190 23 192 39 5 16 2 32 09 50 01 27 1040

Autres prélèvements respiratoires : aspiration naso-pharyngée, prélèvement distal protégé ;
aspiration bronchique, sonde trachéale, lavage broncho-alvéolaire.
b) Diagnostic moléculaire : (BOUHERAOUA S. – DJEDJIG F. – LALIAM R. – LAZRI M. –
HASNAOUI S. – LAFER O.)

Pathologies
Germe recherché PCR RT-PCR

N. meningitidis 42 29
Méningites
S. pneumoniae 42 29
purulentes
H. influenzae 18 ---
C. diphtheriae --- 03
Infections B. pertussis --- 23
respiratoires B. parapertussis --- 23
L. pneumophila --- 09
Infection
sexuellement Chlamydia trachomatis --- 53
transmissible
Totaux 102 169

c) Diagnostic indirect et antigénurie: (BOUHERAOUA S. – DJEDJIG F. AOUDIA M. –
SENOUCI H. – CHEMLI S.)

Pathologie Sérologie Nombre de tests réalisés
Brucella
Brucellose 560

Mycoplasma pneumoniae
465

Chlamydia pneumoniae
Pneumonies atypiques 465

Legionella pneumophila
465

C. diphtheriae
Diphtérie 05

L. pneumophila type 1
Légionellose (antigénurie) 78

Bartonellose B. henselae
04
B. quintana

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II. ACTIVITE DE REFERENCE

d) Activité de veille épidémiologique (déclaration des maladies obligatoires) (TALI-
MAAMAR H. – BENAMROUCHE N.-BOUHERAOUA S. – DJEDJIG F. LALIAM R. –
LAZRI M. – HASNAOUI S. – LAFER O. - SENOUCI H. – CHEMLI S.)

Pathologie Nombre de cas confirmés
Méningite à méningocoque 12
Méningite à pneumocoque 07
Méningite à H. influenzae 00
Coqueluche 06
Diphtérie 00
Brucellose 193
Légionellose 28
Total 246

e) Activité d’expertise (TALI-MAAMAR H. – BENAMROUCHE N. - BOUHERAOUA S. –
DJEDJIG F. OURAGHI R. – ZOURDANI N. - LAZRI M. – HASNAOUI S. – LAFER O.)

Type d’activité Demandeur
Confirmation de l’identification des
(voir tableau ci-après)
souches
Caractérisation des mécanismes de
Voir chapitre activité de recherche et développement
résistance aux antibiotiques
Dépistage de portage BMR
SARM
Clinique Médico-chirurgicale infantile – Bou Ismail
BLSE
Candida
Expertise juridique Tribunal de Bouira
Enquête d’hygiène hospitalière Clinique Médico-chirurgicale infantile – Bou Ismail

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Souches reçues pour identification durant l’année 2015
Souche Nombre
Acinetobacter baumanii 44
Achromobacter anthropi 1
Achromobacter xyloxidans 3
Archanobacterium pyogenes 1
Arthrobacter sp. 1
Bacillus megaterium 1
Brucella melitensis 5
Cellulomonas sp. 1
Corynebacterium spp 1
E coli 9
Elisabethkingia meningosepticum 2
Enterobacter cloacae 9
Enterococcus faecalis 4
Enterococcus faecium 3
Gemella morbillorum 1
Haemophilus influenzae 7
Klebsiella pneumoniae 42
Lactococcus lactis lactis 1
Morganella morganii 2
N. flavescens 2
N. meningitidis 9
Neisseria gonorrhoeae 2
Pantoea sp. 1
Proteus mirabilis 2
Pseudomonas aeruginosa 26
S. pneumoniae 58
Serratia marcescens 3
Shigella sonnei 1
Staphylococcus chromogenes 2
Staphylococcus aureus 12
Staphylococcus epidermidis 5
Staphylococcus haemolyticus 1
Staphylococcus warnerii 1
staphylococcus xylosus 1
Stenotrophomonas maltophilia 2
Streptococcus agalactiae 1
Streptococcus capitis 1
Streptococcus constellatus 1
Streptococcus mitis 3
Streptococcus oralis 1
Streptococcus pyogenes 1
Streptococcus sanguinis 1
Total 275

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