SSoouuss llaa ddiirreeccttiioonn ddee PPiieerrrree CChhaarrbboonnnneeaauu eett MMiicchheell WWoollffff IInnffeeccttiioollooggiiee eenn rrééaanniimmaattiioonn CCoolllleeccttiioonn ddee llaa SSRRLLFF RRééfféérreenncceess eenn rrééaanniimmaattiioonn Infectiologie en réanimation Springer Paris Berlin Heidelberg New York Hong Kong Londres Milan Tokyo Pierre Charbonneau Michel Wolff Infectiologie en réanimation Springer Pierre Charbonneau Service de réanimation médicale CHU de Caen Avenue Côte-de-Nacre 14033 Caen Michel Wolff Service de réanimation médicale et des maladies infectieuses Hôpital Bichat-Claude Bernard AP-HP, Université Paris-Diderot Paris-7 46, rue Henri-Huchard 75877 Paris cedex 18 ISBN 978-2-8178-0388-3 Springer Paris Berlin Heidelberg New York ISSN : 2115-8509 © Springer-Verlag France, Paris, 2013 Springer-Verlag France est membre du groupe Springer Science + Business Media Cet ouvrage est soumis au copyright. Tous droits réservés, notamment la reproduction et la représentation, la traduction, la réimpression, l’exposé, la reproduction des illustrations et des tableaux, la transmission par voie d’enregistrement sonore ou visuel, la reproduction par microfi lm ou tout autre moyen ainsi que la conservation des banques de données. La loi française sur le copyright du 9 septembre 1965 dans la version en vigueur n’autorise une reproduction intégrale ou partielle que dans certains cas, et en principe moyennant les paiements des droits. Toute représentation, reproduction, contrefaçon ou conservation dans une banque de données par quelque procédé que ce soit est sanctionnée par la loi pénale sur le copyright. L’utilisation dans cet ouvrage de désignations, dénominations commerciales, marques de fabrique, etc., même sans spécifi cation ne signifi e pas que ces termes soient libres de la législation sur les marques de fabrique et la protection des marques et qu’ils puissent être utilisés par chacun. La maison d’édition décline toute responsabilité quant à l’exactitude des indications de dosage et des modes d’emplois. Dans chaque cas il incombe à l’usager de vérifi er les informations données par comparaison à la littérature existante. Maquette de couverture : Jean-François Montmarché Mise en page : Nord Compo Villeneuve d’Ascq Sommaire Préface ....................................................................................... vii P. Sansonnetti I - BACTÉRIOLOGIE, IMMUNOLOGIE ET PHARMACOLOGIE APPLIQUÉES À L’INFECTIOLOGIE EN RÉANIMATION 1. Les défenses de l’organisme et immunité innée .......................... 3 J.- M. Cavaillon 2. Prédisposition génétique et sepsis ............................................. 23 G. Geri, A. Bouglé, C. Rousseau, J.- P. Mira 3. Évolution des résistances bactériennes en réanimation ................ 37 V. Cattoir, R. Leclercq 4. Prévention de l’émergence ou de l’acquisition des résistances en réanimation .................................................. 55 J.- C. Lucet, G. Birgand 5. Méthodes diagnostiques rapides des sepsis sévères en réanimation 71 S. Bonacorsi, P. Bidet, E. Bingen 6. Objectifs PK/PD et adaptation posologique des antibiotiques chez le patient de réanimation : vers une approche pratique ........ 83 O. Petitjean, R. Gauzit 7. De la bonne utilisation des antifongiques systémiques en réanimation ..................................................... 105 J.- F. Timsit, L. Potton, M. Lugosi, C. Minet, R. Hamidfar- Roy, C. Ara- Somohano, A. Bonadona, C. Schwebel 8. Les thérapeutiques infectieuses non antibiotiques ...................... 121 E. Kipnis, R. Dessein, K. Faure, B. Guery 9. Place des biomarqueurs pour le diagnostic et le suivi des infections en réanimation .................................... 135 C. Daubin, A. Seguin, X.Valette II - PATHOLOGIES INFECTIEUSES SÉVÈRES LES PLUS FRÉQUENTES EN RÉANIMATION 10. Méningites purulentes et méningoencéphalites graves (à l’exclusion des patients immunodéprimés) ................... 145 M. Wolff , R. Sonneville 11. Pneumonies communautaires graves ......................................... 169 O. Leroy, P.Y. Delannoy, N. Boussekey, A. Meybeck, A. Chiche, H. Georges vi Infectiologie en réanimation 12. Grippe sévère ......................................................................... 185 N. Bréchot, C.- E. Luyt, J.- L. Trouillet, J. Chastre, A. Combes 13. Endocardites en réanimation ................................................... 203 P. Charbonneau 14. Péritonites communautaires .................................................... 221 T. Clavier, Ph. Gouin, B. Veber 15. Les infections sévères de la peau et des parties molles.................. 237 D. Mathieu 16. Choc septique ........................................................................ 255 F. Daviaud, F. Pène 17. Infections fongiques sévères en réanimation .............................. 273 N. Lerolle, P. Parize et O. Lortholary 18. Pathologies Infectieuses d’importation en réanimation ............... 305 P. Tattevin, F. Bruneel III - PATHOLOGIES NOSOCOMIALES ET/OU LIÉES AUX SOINS 19. Complications infectieuses intracrâniennes postopératoires ........ 331 A.- M. Korinek 20. Infections postopératoires : médiastinites .................................. 353 J.- L. Trouillet 21. Infections intraabdominales postopératoires ............................. 371 P. Montravers, P. Mascitti, I. Balcan 22. Infections ostéoarticulaires (IOA) en réanimation ...................... 393 E. Senneville, S. Nguyen, H. Dézéque, E. Beltrand, H. Migaud 23. Pneumonies acquises sous ventilation mécanique ....................... 407 J.- L. Trouillet, C.- E. Luyt, A. Combes, J. Chastre 24. Infections de cathéters intravasculaires en réanimation ............... 423 C. Brun- Buisson, J.- J. Parienti 25. Infections digestives à Clostridium diffi cile : diagnostic et traitement ........................................................... 441 F. Barbut, J.- L. Meynard, É. Maury, L. Surgers, C. Eckert IV - INFECTIONS CHEZ LES PATIENTS IMMUNODÉPRIMÉS EN RÉANIMATION 26. Stratégie diagnostique devant une insuffi sance respiratoire aiguë chez un patient d’oncohématologie admis en réanimation .......... 463 D. Schnell, É. Azoulay 27. Infections chez les patients neutropéniques ............................... 491 B. Gachot, F. Blot, É. Chachaty 28. Prise en charge des infections chez les adultes transplantés d’organe(s) ................................... 503 F. Schneider, M. Guillot, M.- C. Chomette, N. Douiri, J.- É. Herbrecht, M. Diouf, S. Kremer*, T. Lavigne, P. Lutun Préface L’infection est l’ennemi premier du réanimateur. Outre les infections graves admises en réanimation, les patients qui y sont hospitalisés sont ultrasensibles au risque infectieux nosocomial : manœuvres invasives, immunosuppression, défi cits organiques complexes, âge parfois avancé. Tout concourt à faire de ces patients une cible privilégiée pour des micro- organismes dont la pathogénicité n’est pas nécessairement évidente chez un individu sain. On parlait de microbes opportunistes, on emploie de plus en plus le terme de pathobiontes. Une zone grise entre pathogènes bona fi de, dotés de tout l’arsenal génétique et moléculaire pour engager l’hôte et manipuler ses défenses immunitaires et le symbiote commensal. Ces pathobiontes, entérocoques, entérobactéries, pseudomonadacées, moraxellacées, familles présentes en faibles eff ectifs au sein des fl ores comme le microbiote intestinal ou respiratoire, éventuellement originaires de l’environnement, jouent sans doute un rôle positif dans l’homéostasie de l’interface hôte-microbe. Ils imposent une pression mesurée sur l’immunité innée assurant un niveau « d’infl ammation physiologique » qui représente l’état de veille anti-infectieuse du système immunitaire. Des défaillances locales ou systémiques de l’immunité vont permettre à ces pathobiontes de prévaloir en accédant au statut de pathogène. Tout est aff aire de co-évolution contrariée par des événements de rupture. Circonstance aggravante, la multirésistance aux anti-infectieux culmine dans l’environnement de réanimation. Elle est son « épicentre », dit Christian Brun-Buisson. Pour de multiples raisons, ces pathobiontes sont volontiers résistants, voire multirésistants. Ineffi cace sur certains de ces micro-organismes et délétère pour le microbiote dominant qui assure leur contrôle, un cercle vicieux parfois inextricable s’engage où l’antibiotique devient à la fois l’agresseur et la victime. Même si son contrôle s’est considérablement amélioré ces dernières années par un eff ort collectif exemplaire, la multirésistance demeure une préoccupation majeure, en particulier pour les bactéries à Gram négatif, ainsi que pour les champignons et les levures. Un exemple, l’infection par Acinetobacter baumannii qui illustre et résume à elle seule la complexité de la confrontation du réanimateur au risque infectieux. « Celui qui ne connaît ni son ennemi ni lui-même sera en danger à chaque combat », écrit Sun Zi dans L’art de la guerre. Infectiologie en réanimation est une superbe illustration de cet adage de la philosophie de la stratégie guerrière adaptée à la lutte anti-infectieuse. « Connais ton ennemi » : cet ouvrage traite en eff et en détail des aspects fondamentaux des micro-organismes, de leur diagnostic, de l’état et des mécanismes de leur résistance. « Connais-toi toi-même » : cet ouvrage viii Infectiologie en réanimation envisage aussi l’hôte infecté, ses défenses, sa prédisposition génétique aux insuffi sances et aux dérapages de ces défenses, causes de sepsis. Sur ces bases fondamentales, les principales situations cliniques où se joue cette confrontation sont envisagées, décrites, analysées, sous l’angle parfois spécifi que qu’imprime le contexte de la réanimation. L’ensemble produit un véritable ouvrage de référence d’infectiologie moderne, intégrant clinique, physiopathologie moléculaire, diagnostic, prévention, thérapeutique, d’intérêt pour le fondamentaliste comme pour le clinicien qu’il est essentiel de coaliser dans ce combat contre le risque infectieux. Philippe Sansonetti Professeur au Collège de France Professeur à l’Institut Pasteur I Bactériologie, immunologie et pharmacologie appliquées à l’infectiologie en réanimation