Bitkilerde nukleus genlerinin anlatımı ve düzenlenmesi PDF
Preview Bitkilerde nukleus genlerinin anlatımı ve düzenlenmesi
Bitkilerde nukleus genlerinin anlatımı ve düzenlenmesi Düzenlemede çok kademe vardır: 1. Transkripsiyon 2. “Capping”şapkalama 3. 3' olgunlaşma, kesim ve poliadenilasyon 4. “Splicing”kırpılma 5. Sitoplazmaya taşınma 6. mRNA’nın stabilizasyonu/destabilizasyonu Translation Bir intronlu bir genden mRNA oluşumuna kadar geçen aşamalar Transkripsiyon: 3 DNA-Bağımlı RNA Polimeraz 1. Pol I - 45S rRNA öncülerini sentezler, nukleolusta bulunur (45S18S, 28S, 5.8S rRNAs) (S sedimentasyon katsayısı hemen hemen makromolekül büyüklüğüne eşit) 2. Pol II - mRNA öncülerini ve bazı snRNA’ları sentezler, 3. Pol III- 5S rRNA’ları, tRNA’ları ve küçük nuklear RNA’ları (snRNAs) sentezler 3 polimeraz da multi-altüniteteye, bazı büyük alt uniteteye ve 5 küçük ortak altüniteteye (mayada) sahiptir. Nisbi hücresel RNA yoğunluğu • Ribosomal RNA (rRNA) ~ % 90 – Transfer RNA (tRNA) ~ % 5 • Mesenger RNA (mRNA ) ~ % 2 kalan (~% 3): • Signal tanıma partikülğü (SRP) RNA • Küçük nuklear RNA (snRNA) • Küçük nukleolar RNA (snoRNA) • Mikro RNA (miRNA) RNA Polimeraz II 1. 2 büyük alt ünitesi var ve bu üniteler E. coli RNAP ß and ß’ alt üniteleri ile homologi göstermektedir. 2. En büyük alt ünite fosdforlanmış COOH- terminal domain (CTD) içerir. – Fosforlanma inisiyasyondan elongasyaona geçiş için önemlidir. – CTD diğer proteinslerle de ilişkiye geçer. 3. DNA ‘ya kendisinin bağlanması için promotötr önce diğer proteinlerin bağlanmasına gereksinim duyar TFII – RNA Pol II transkripsiyon faktörleri RNAPII – RNA Pol II Fig. 6.30, Buchanan et al. RNAP II Promotörleri • Sınıf-II promotörler 4 bileşkenlidirler: 1. Upstream element 2. TATA kutusu (–25) 3. Inisiyasyon başlama bölgesi (+1) 4. Downstream element 1. 2. 3. 4. Biçok sınıf II promotöründe 3 ve 4. bazılarında lack 2. Yoktur. TATA Kutusuof Class II Promoters • TATA kutusu = TATAAAA • Transkripsiyonun başalayacağı bölgeyi belirler. • Bazı promotörlerde etkin transkripsiyonu sağlar. • TBP – TATA kutusu bağlanma proteini ile bulunur Sınıf II Promoterlerde Upstream Elementler Çeşitli sınıf II promotörlerde bulunurlar: 1. GC kutuları (GGGCGG ve CCGCCCC) – Transkripsyionu ve oryantasyonunu uyarırlar. – Çok kopyalı olabilirler. – TATA kutusuna yakındırlar. 2. CCAAT box – Transkripsiyonu uyarır. – CCAAT-bağlama transkripsiyon faktörüne bağlanırlar (CTF). Enhancer ve Silencer 1. Enhancer transkripsiyonu uyarır, Silencer inhibe eder. 2. Oryantasyonları bağımsızdır. 3. Pozisyon-bağımsızdırlar. – Promotörden belli bir uzaklıkta çalışabilir. – Enhancer’lar her yerde bulunurlar. Bind regulated transcription factors
Description:The list of books you might like
