Ouder en wijzer koerst Ezio Auditore richting de verloren bibliotheek van Altaïr. Hier ligt het geheim waarmee de tempeliers definitief verslagen kunnen worden. Maar dan doet Ezio een schokkende ontdekking.
Vijf sleutels zijn nodig om de bibliotheek te kunnen betreden. Om die te vinden moet Ezio naar Constantinopel, waar een groot tempeliersleger het Ottomaanse Rijk omver dreigt te werpen.
Hier moet Ezio de temperliers zien te verslaan. Wat begon als een pelgrimstocht, wordt een gevecht tegen de tijd...